本文關(guān)鍵詞：結(jié)核分枝桿菌TrpD蛋白的生物信息學分析

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【摘要】：目的應用生物信息學軟件預測結(jié)核分枝桿菌TrpD基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能。方法應用Protparam程序預測TrpD蛋白的理化性質(zhì),利用SignaIP 4.1和MotifScan分析其信號肽和磷酸化位點,應用ClustalX、MEGA5.1軟件分析TrpD蛋白的同源性等。結(jié)果 TrpD蛋白共370個氨基酸,分子式為C1652H2651N493O500S10,理論等電點為5.99,脂溶性系數(shù)93,不穩(wěn)定系數(shù)28.86,預測該蛋白為穩(wěn)定蛋白。TrpD蛋白無信號肽,其二級結(jié)構(gòu)中β-轉(zhuǎn)角占6.76%,無規(guī)則卷曲占32.7%。氨基酸序列中有5個潛在的B細胞抗原表位,13個Th細胞表位,22個磷酸化位點,與麻風桿菌和恥垢分枝桿菌的同源性分別為80.1%和76.6%。結(jié)論初步預測結(jié)核分枝桿菌TrpD為穩(wěn)定蛋白,含有T、B細胞抗原表位,為抗結(jié)核新藥的潛在作用靶標。
【作者單位】： 濰坊醫(yī)學院醫(yī)學檢驗學系;濰坊醫(yī)學院臨床學院病原生物學教研室;
【關(guān)鍵詞】： 結(jié)核分枝桿菌 TrpD蛋白 生物信息學 分析
【基金】：國家自然科學基金項目(No.81470001、81170080)
【分類號】：R378.911
【正文快照】： ***目前結(jié)核病仍是威脅全球公共衛(wèi)生健康的疾病之一。2015年WHO結(jié)核病統(tǒng)計報告顯示,2014年全球共有960萬人感染肺結(jié)核,我國新發(fā)病例為93萬,位居全球第三位,是22個高負擔國家之一[1]。因此,深入研究結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tu-berculosi,MTB)結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)新的治療結(jié)核病的分子，

本文編號：595317