本文關(guān)鍵詞：結(jié)核分枝桿菌TrpD蛋白的生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的應(yīng)用生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)結(jié)核分枝桿菌TrpD基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能。方法應(yīng)用Protparam程序預(yù)測(cè)TrpD蛋白的理化性質(zhì),利用SignaIP 4.1和MotifScan分析其信號(hào)肽和磷酸化位點(diǎn),應(yīng)用ClustalX、MEGA5.1軟件分析TrpD蛋白的同源性等。結(jié)果 TrpD蛋白共370個(gè)氨基酸,分子式為C1652H2651N493O500S10,理論等電點(diǎn)為5.99,脂溶性系數(shù)93,不穩(wěn)定系數(shù)28.86,預(yù)測(cè)該蛋白為穩(wěn)定蛋白。TrpD蛋白無(wú)信號(hào)肽,其二級(jí)結(jié)構(gòu)中β-轉(zhuǎn)角占6.76%,無(wú)規(guī)則卷曲占32.7%。氨基酸序列中有5個(gè)潛在的B細(xì)胞抗原表位,13個(gè)Th細(xì)胞表位,22個(gè)磷酸化位點(diǎn),與麻風(fēng)桿菌和恥垢分枝桿菌的同源性分別為80.1%和76.6%。結(jié)論初步預(yù)測(cè)結(jié)核分枝桿菌TrpD為穩(wěn)定蛋白,含有T、B細(xì)胞抗原表位,為抗結(jié)核新藥的潛在作用靶標(biāo)。
【作者單位】： 濰坊醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)系;濰坊醫(yī)學(xué)院臨床學(xué)院病原生物學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】： 結(jié)核分枝桿菌 TrpD蛋白 生物信息學(xué) 分析
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81470001、81170080)
【分類號(hào)】：R378.911
【正文快照】： ***目前結(jié)核病仍是威脅全球公共衛(wèi)生健康的疾病之一。2015年WHO結(jié)核病統(tǒng)計(jì)報(bào)告顯示,2014年全球共有960萬(wàn)人感染肺結(jié)核,我國(guó)新發(fā)病例為93萬(wàn),位居全球第三位,是22個(gè)高負(fù)擔(dān)國(guó)家之一[1]。因此,深入研究結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tu-berculosi,MTB)結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)新的治療結(jié)核病的分子，

本文編號(hào)：595317