本文關(guān)鍵詞：流感病毒組成蛋白質(zhì)序列的分析與預(yù)測

  更多相關(guān)文章： 流感病毒 蛋白質(zhì)序列 詳細(xì)HP模型 CGR-WALK模型 ARFIMA(p d q)模型

【摘要】：在NCBI數(shù)據(jù)庫中獲得1902—2013年關(guān)于流感病毒10種組成蛋白的所有氨基酸序列,在MATLAB中采用大數(shù)據(jù)編程分析,結(jié)合詳細(xì)的HP模型,并基于CGR-WALK模型的方法將全部流感病毒蛋白質(zhì)序列轉(zhuǎn)化為數(shù)據(jù)形式,引入時間序列ARFIMA(p,d,q)模型來擬合所有序列,分析10種組成蛋白的序列在近80年的變化趨勢,并對其未來10年的發(fā)展趨勢進(jìn)行預(yù)測.通過分析可以發(fā)現(xiàn),其對流感病毒變異趨勢的預(yù)測有很好的效果,這為基于大數(shù)據(jù)分析流感病毒蛋白質(zhì)序列,預(yù)測流感病毒的爆發(fā)提供一定的的研究參考價值.
【作者單位】： 江南大學(xué)理學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 流感病毒 蛋白質(zhì)序列 詳細(xì)HP模型 CGR-WALK模型 ARFIMA(p d q)模型
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(11271163) 中央高�；究蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)專項資金項目(JUSRP21117)
【分類號】：R373.13
【正文快照】： 流感病毒為負(fù)向單鏈RNA病毒[1],自身具有很強(qiáng)的變異性,歷史上多次流感大流行都是由其新的亞型和以往出現(xiàn)過的亞型經(jīng)過變異再次出現(xiàn),人類由于缺乏對其的免疫力而導(dǎo)致流感病毒在人群中快速傳播。目前對流感病毒蛋白質(zhì)序列的研究上,劉娟等用時間序列模型識別,預(yù)測流感病毒的DNA序

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 劉娟;高潔;;甲型H1N1流感病毒DNA序列堿基的預(yù)測[J];生物信息學(xué);2011年03期

2 劉娟;高潔;;乙型、丙型流感病毒的長記憶ARFIMA模型[J];生物信息學(xué);2011年02期

3 劉娟;高潔;;甲型流感病毒DNA序列的長記憶ARFIMA模型[J];物理學(xué)報;2011年04期

4 高潔;徐振源;;Chaos game representation(CGR)-walk model for DNA sequences[J];Chinese Physics B;2009年01期

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 劉娟;基于時間序列理論方法的流感病毒DNA序列特征分析[D];江南大學(xué);2011年

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前7條

1 靳佩軒;高潔;;流感病毒組成蛋白質(zhì)序列的分析與預(yù)測[J];食品與生物技術(shù)學(xué)報;2016年04期

2 張玲;高潔;靳佩軒;;流感大爆發(fā)的多重早期預(yù)警信號[J];生物數(shù)學(xué)學(xué)報;2015年02期

3 楊德玉;;痰熱清注射液聯(lián)合西藥治療病毒流感隨機(jī)平行對照研究[J];實用中醫(yī)內(nèi)科雜志;2014年10期

4 張玲;高潔;;甲型流感病毒HA蛋白質(zhì)序列的預(yù)測[J];食品與生物技術(shù)學(xué)報;2013年08期

5 吳靜;丁勇;劉成友;;甲型H1N1流感病毒HA基因的簡單重復(fù)序列預(yù)測[J];南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2013年01期

6 張玲;高潔;;甲型流感病毒蛋白質(zhì)序列的長記憶模型[J];江南大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2012年06期

7 張玲;高潔;;甲型H1N1流感病毒蛋白質(zhì)序列的預(yù)測[J];生物技術(shù);2012年06期

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 靳佩軒;甲型流感病毒蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)預(yù)測[D];江南大學(xué);2014年

【二級參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 婁海容;;甲流(H1N1)的病原、診斷、治療和預(yù)防[J];現(xiàn)代醫(yī)院;2009年09期

2 陳繼明;孫映雪;劉朔;蔣文明;陳杰;侯廣宇;李金平;;2009年新甲型H1N1流感病毒的來源和去向分析[J];科學(xué)通報;2009年12期

3 匡治州;鄭麗舒;段招軍;漆正宇;瞿小旺;劉文培;張萬菊;李丹地;高寒春;侯云德;;流感病毒神經(jīng)氨酸酶廣譜抑制多肽的篩選研究[J];病毒學(xué)報;2007年03期

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王發(fā)生,羅敏;在網(wǎng)絡(luò)上作蛋白質(zhì)序列分析[J];生命的化學(xué);2001年01期

2 管維紅;張立婷;徐振源;朱平;;蛋白質(zhì)序列混沌特性的研究[J];生物信息學(xué);2008年04期

3 管維紅;徐振源;朱平;;用非線性預(yù)測方法研究蛋白質(zhì)序列的特性(Ⅰ)[J];食品與生物技術(shù)學(xué)報;2008年01期

4 肖絢;邵世煌;;一種新穎的蛋白質(zhì)序列可視化模型[J];計算機(jī)工程;2008年03期

5 管維紅;徐振源;朱平;;用非線性預(yù)測方法研究蛋白質(zhì)序列的特性(Ⅱ)[J];食品與生物技術(shù)學(xué)報;2008年02期

6 馬影;于曉慶;周楊;楊柳;李春;;蛋白質(zhì)序列的一類新的二維圖形表示及其應(yīng)用[J];宜春學(xué)院學(xué)報;2008年04期

7 李丹丹;王俊;李春;;蛋白質(zhì)序列的一種新的三維圖形表示及其應(yīng)用[J];生物信息學(xué);2009年01期

8 湯麗華;;基于小波分析的蛋白質(zhì)序列分形研究[J];科技信息;2009年33期

9 肖前軍;周金玉;鄧總綱;;蛋白質(zhì)序列混沌游戲表示模擬效果的優(yōu)化[J];汕頭大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2010年01期

10 趙靜靜;齊斌;王寒冰;唐旭清;;基于矩陣圖譜表達(dá)法的蛋白質(zhì)序列的相似性分析[J];計算機(jī)工程與應(yīng)用;2011年07期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 光宣敏;郭延芝;李夢龍;汪夏;;支持向量機(jī)預(yù)測蛋白質(zhì)序列中胱氨酸氧化還原態(tài)[A];第十屆全國計算(機(jī))化學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2009年

2 李通化;孫江明;李大鵬;唐勝男;叢培盛;;從蛋白質(zhì)序列到結(jié)構(gòu)和功能[A];第十一屆全國計算（機(jī)）化學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2011年

3 肖奕;;蛋白質(zhì)序列的對稱性[A];第十次中國生物物理學(xué)術(shù)大會論文摘要集[C];2006年

4 陳文理;龐小峰;;LC／MS技術(shù)在蛋白質(zhì)序列檢測上的應(yīng)用[A];第十次中國生物物理學(xué)術(shù)大會論文摘要集[C];2006年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 薦文;專利保護(hù)什么[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報;2001年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前9條

1 徐海松;蛋白質(zhì)序列中的折疊和去折疊信息[D];北京工業(yè)大學(xué);2011年

2 林衛(wèi)中;蛋白質(zhì)序列離散灰色模型及其在藥物開發(fā)中的應(yīng)用研究[D];東華大學(xué);2013年

3 吳自凱;信息度量的蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)、質(zhì)譜數(shù)據(jù)研究[D];大連理工大學(xué);2007年

4 王棟;蛋白質(zhì)序列的并行分類方法研究[D];天津大學(xué);2010年

5 李明鋒;結(jié)構(gòu)對稱蛋白質(zhì)性質(zhì)研究[D];華中科技大學(xué);2008年

6 楊凡;生物序列分析中若干問題的研究[D];電子科技大學(xué);2011年

7 王彤;高維生物數(shù)據(jù)的分類與預(yù)測研究[D];上海交通大學(xué);2009年

8 劉亮偉;木聚糖酶蛋白質(zhì)序列分析、分子進(jìn)化和分子模擬[D];江南大學(xué);2005年

9 余宏杰;生物序列特征信息提取方法及其應(yīng)用[D];中國科學(xué)技術(shù)大學(xué);2013年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 許時超;蛋白質(zhì)序列一級結(jié)構(gòu)圖形構(gòu)造及相似性分析[D];浙江理工大學(xué);2015年

2 王紹鵬;蛋白質(zhì)—核酸相互作用位點預(yù)測新方法研究[D];蘭州大學(xué);2015年

3 吳海燕;基于圖能量的蛋白質(zhì)圖形表示及應(yīng)用研究[D];山東大學(xué);2015年

4 彭輝;蛋白質(zhì)序列的圖形化表示及其應(yīng)用的研究[D];湘潭大學(xué);2015年

5 張艷萍;蛋白質(zhì)序列的數(shù)學(xué)描述及其應(yīng)用[D];浙江理工大學(xué);2010年

6 李明鋒;蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)關(guān)系研究[D];華中科技大學(xué);2005年

7 張X;基于粒度下的蛋白質(zhì)序列的分析[D];江南大學(xué);2011年

8 錢盼盼;蛋白質(zhì)序列新的表示方法[D];山東大學(xué);2011年

9 孔芬;蛋白質(zhì)序列相似性分析的幾種數(shù)學(xué)方法[D];浙江理工大學(xué);2013年

10 張羊;基于譜的蛋白質(zhì)序列比對方法研究[D];西安電子科技大學(xué);2009年

，

本文編號：575322