本文關(guān)鍵詞：一株弗氏檸檬酸桿菌噬菌體IME-CF2的分離、測(cè)序及全基因組分析

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【摘要】：目的從醫(yī)院污水中分離一株能裂解弗氏檸檬酸桿菌的噬菌體,觀察其形態(tài),并進(jìn)行全基因組測(cè)序和全基因組分析,為治療和控制弗氏檸檬酸桿菌感染提供基礎(chǔ)。方法以弗氏檸檬酸桿菌為宿主,從醫(yī)院污水分離噬菌體,用透射電鏡觀察其形態(tài);使用Ion Torrent測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行噬菌體全基因組測(cè)序,測(cè)序后進(jìn)行噬菌體全基因組序列組裝、注釋、進(jìn)化分析和比較分析。結(jié)果成功分離一株弗氏檸檬酸桿菌噬菌體,命名為IME-CF2;電鏡觀察顯示,該噬菌體具有二十面體的頭部,形態(tài)類似肌尾噬菌體科;IME-CF2核酸類型為DNA,基因組全長(zhǎng)為177 685 bp,GC含量為43.2%;編碼267個(gè)編碼區(qū)(CDS),2個(gè)tRNA;進(jìn)化分析表明,IME-CF2屬于T4類噬菌體,全基因組比較分析表明,IME-CF2與檸檬酸桿菌噬菌體Miller同源性最高。結(jié)論分離鑒定了一株弗氏檸檬酸桿菌噬菌體,進(jìn)行了全基因組測(cè)序和分析,為噬菌體治療多重耐藥細(xì)菌奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】： 安徽醫(yī)科大學(xué)軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所;軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所病原微生物生物安全國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 弗氏檸檬酸桿菌 噬菌體 全基因組測(cè)序 基因組分析
【基金】：國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)(編號(hào):2012AA022003、2014AA021402) 國(guó)家科技重大專項(xiàng)課題(編號(hào):2013ZX10004605、2013ZX10004217-002-003)
【分類號(hào)】：R378
【正文快照】： 弗氏檸檬酸桿灥腸桿菌科枸櫞酸桿灥,是發(fā)酵型革蘭陰性菌,廣泛存在于自然環(huán)境中,是人體佊正常栤,也~#髓掙。洰來(lái),枿觸}0濫用,概檸壚桿sE常M抗生素產(chǎn)灥藥[l],給臨床感染治療帶來(lái)極大挑戰(zhàn)。噬菌體是-種能特異性感染細(xì)}0病毒,廣泛存在于自然環(huán)境中,栜灥體能P宿主灥麻亡|2]。灥體

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本文編號(hào)：529894