應(yīng)用DNAStar軟件預(yù)測結(jié)核分枝桿菌Rv3812的抗原表位
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【摘要】:目的:預(yù)測結(jié)核分枝桿菌Rv3812蛋白的抗原表位。方法:利用DNAStar軟件包中Editseq軟件將結(jié)核分枝桿菌Rv3812氨基酸序列進行編輯保存,然后利用Protean軟件進行氨基酸序列分析,預(yù)測Rv3812蛋白的二級結(jié)構(gòu)、B細(xì)胞抗原表位及T細(xì)胞抗原表位,然后再用BLAST分析其與人類抗原表位的同源性。結(jié)果:Rv3812蛋白具有豐富的二級結(jié)構(gòu)和多處抗原指數(shù)較高的區(qū)段,潛在的B細(xì)胞抗原表位較少,可能位于55~68、77~99、116~120、265~280、283~294、303~326、330~337和425~435位氨基酸殘基或其附近。該蛋白潛在的T細(xì)胞抗原表位較多,可能位于6~30、55~85、97~140、159~191、202~204、208~231、251~264、270~281、287~299、311~334、337~343、349~356、368~385、394~413、428~433、437~441、470~476、479~481和488~493位氨基酸殘基或其附近。結(jié)論:Rv3812是一個T細(xì)胞抗原表位占優(yōu)勢的蛋白抗原,B細(xì)胞抗原表位略少。
【作者單位】: 河北北方學(xué)院;解放軍第309醫(yī)院全軍結(jié)核病研究所;全軍結(jié)核病防治重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】: 抗原表位 結(jié)核分枝桿菌Rv 二級結(jié)構(gòu)
【基金】:國家重大傳染病防治科技重大專項基金2012ZX10003008002 軍隊醫(yī)學(xué)科技“十二·五”重點項目BWS11J050 北京市科技創(chuàng)新基地培育與發(fā)展工程專項Z141107004414021 解放軍第309醫(yī)院重點課題2015ZD-004
【分類號】:R378.911
【正文快照】: 結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌引起的一種人畜共患傳染病,是當(dāng)今嚴(yán)重危害人類健康的公共衛(wèi)生問題,躋身全球十大疾病死亡原因之列?ń槊(BCG)作為一種活性減弱的牛型結(jié)核分枝桿菌疫苗,是目前使用最廣泛的疫苗之一[1-2]。我國是全球22個結(jié)核病高負(fù)擔(dān)國家之一,同時也是全球27個耐多藥
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