發(fā)布時間：2017-05-27 18:13

  本文關(guān)鍵詞：埃及伊蚊yellow基因家族的鑒別和表達(dá)譜分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的篩選并鑒定埃及伊蚊(Aedes aegypti)全基因組中的yellow基因,分析其基因結(jié)構(gòu)、基因進(jìn)化以及在不同發(fā)育時期和不同組織的表達(dá)譜。方法運用模式昆蟲黑腹果蠅(Drosophila melanogaster)Dmyellow基因(Gen Bank登錄號為AAF45497)王漿主蛋白(MRJP)結(jié)構(gòu)域氨基酸序列,在埃及伊蚊全基因組數(shù)據(jù)庫中篩選并鑒定埃及伊蚊yellow基因家族,采用Ex PASy在線相關(guān)工具包分析其理化性質(zhì)和結(jié)構(gòu)域,運用Signal P4.1預(yù)測信號肽,結(jié)合使用DNAstar、MAGA6.0和Gene Doc軟件包進(jìn)行同源性比對、保守性分析和系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建。提取埃及伊蚊總RNA,合成c DNA,利用實時熒光定量PCR(q RT-PCR)法對埃及伊蚊不同發(fā)育時期(卵、Ⅰ~Ⅳ齡幼蟲、蛹以及未吸血雌蚊和雄蚊)和未吸血雌蚊不同組織(唾液腺、中腸、脂肪體和卵巢)的yellow基因表達(dá)譜進(jìn)行相對定量分析。結(jié)果從埃及伊蚊全基因組中篩選出12條yellow基因(Aa-yellow、Aa-yellow-b、Aayellow-c、Aa-yellow-d、Aa-yellow-e、Aa-yellow-f2、Aa-yellow-fb、Aa-yellow-fc、Aa-yellow-g、Aa-yellow-g2、Aa-yellow-h和Aa-yellow-x)。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,12條yellow基因均具有MRJP結(jié)構(gòu)域和信號肽序列。同源性比對結(jié)果顯示,埃及伊蚊yellow基因家族成員間同源性較低,為15%~49%;但其保守域間同源性較高,可達(dá)60%。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示,12個YELLOW蛋白分為5個亞家族,其中11個在黑腹果蠅中均有直系同源蛋白存在。q RT-PCR結(jié)果顯示,Aa-yellow-d和Aa-yellow-x在雄蚊中高表達(dá)(P0.01或P0.05),相對表達(dá)量分別為0.018 9和0.023 5;Aa-yellow-fc在雌蚊和唾液腺中特異高表達(dá)(P0.01),相對表達(dá)量分別為0.024 8和0.034 9;Aa-yellow-f2在Ⅱ齡幼蟲中特異高表達(dá)(P0.01),相對表達(dá)量為0.093 4;Aa-yellow、Aa-yellow-e和Aa-yellow-fb在Ⅲ齡幼蟲中特異高表達(dá)(P0.01),相對表達(dá)量分別為0.562 1、0.004 4和0.008 4;Aa-yellow、Aa-yellow-e、Aa-yellow-f2、Aayellow-fb、Aa-yellow-h和Aa-yellow-x等6條基因在卵巢中高表達(dá)(P0.01或P0.05),相對表達(dá)量分別為0.569 4、0.027 0、0.006 5、0.001 0、0.084 8和0.015 1;除Aa-yellow-c(0.004 0)和Aa-yellow-x(0.007 4)外,其余基因幾乎不在中腸表達(dá)。結(jié)論在埃及伊蚊基因組中獲得的12條yellow基因同源性較低,且在不同發(fā)育時期和不同組織中表達(dá)有差異。
【作者單位】： 貴州醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院人體寄生蟲學(xué)教研室貴州醫(yī)科大學(xué)現(xiàn)代病原生物學(xué)實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 埃及伊蚊 yellow基因家族 qRT-PCR 表達(dá)譜
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.81260260)~~
【分類號】：R384.1
【正文快照】： yellow基因家族主要存在于昆蟲基因組中,是在。研究顯示,YELLOW蛋白家族成員在長須魯蛉當(dāng)前研究較為熱門的基因家族之一。在部分真菌和(Lutzomyia longipalpis)唾液腺中豐富表達(dá)[22],其中耐輻射球菌(Deinococcus radiodurans)也發(fā)現(xiàn)同源LJM11蛋白已被證實具有抗凝血和逃避宿主

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本文編號：400804