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E3連接酶CHIP泛素化IRE1的分子機制研究

發(fā)布時間:2024-06-04 01:27
  內(nèi)質(zhì)網(wǎng)是真核細胞中蛋白質(zhì)合成、折疊與分泌的重要細胞器,它的內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定是細胞維持正常功能的基本需求。在某種環(huán)境因素刺激下,合成后蛋白質(zhì)在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中發(fā)生錯誤的折疊和修飾,導致其穩(wěn)態(tài)失衡,形成內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力(endoplasmic reticulum stress, ER stress)。細胞內(nèi)存在一系列信號轉(zhuǎn)導通路,對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力實行應答,這些應激通路一般稱為錯誤折疊蛋白質(zhì)應激(unfolded protein response, UPR)。肌醇需求蛋白質(zhì)1(inositol-requiring protein-1, IRE1)是一個內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜蛋白質(zhì),是UPR中三個重要的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力感受器和信號傳導蛋白質(zhì)之一。盡管人們對IRE1的分子機制已有相當程度的了解,但是有關(guān)IRE1與其他蛋白質(zhì)的相互作用、它的信號通路調(diào)控、以及翻譯后修飾的可能性等方面的知識依然匱乏。本課題以IRE1為研究對象,通過蛋白質(zhì)互作分析,發(fā)現(xiàn)IRE1相互作用的蛋白質(zhì),進而聚焦于IRE1相關(guān)的修飾和信號通路,試圖發(fā)現(xiàn)和闡明內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力條件下IRE1的新功能和可能的分子機制。利用蛋白質(zhì)組學的方法,我們在IRE1的免疫共沉淀物中發(fā)現(xiàn)了若干泛素...

【文章頁數(shù)】:108 頁

【學位級別】:博士

【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
專業(yè)詞匯中英文對照表
第一章 緒論
    1.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的結(jié)構(gòu)和功能
        1.1.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的分類與結(jié)構(gòu)
        1.1.2 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的功能
    1.2 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力與錯誤折疊蛋白應激
        1.2.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力與錯誤折疊蛋白應激概述
        1.2.2 三條UPR通路
    1.3 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)的蛋白降解
    1.4 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力和腫瘤的關(guān)系
        1.4.1 IRE1通路在腫瘤中的作用
        1.4.2 PERK通路在腫瘤中的作用
        1.4.3 ATF6通路在腫瘤中的作用
    1.5 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力和衰老
        1.5.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力與衰老的關(guān)系
        1.5.2 UPR在衰老過程中的作用
    1.6 細胞老化
        1.6.1 復制性老化和成熟前老化
        1.6.2 調(diào)節(jié)細胞老化的信號通路和分子機制
        1.6.3 細胞老化與腫瘤的關(guān)系
        1.6.4 細胞老化和衰老的關(guān)系
    1.7 泛素和泛素化系統(tǒng)
        1.7.1 泛素和泛素化過程
        1.7.2 泛素化鏈接方式
    1.8 泛素化酶CHIP的結(jié)構(gòu)和功能
        1.8.1 CHIP的結(jié)構(gòu)
        1.8.2 CHIP的功能
    1.9 本論文研究的目的
第二章 IRE1結(jié)合蛋白的鑒定與驗證
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 實驗材料
        2.2.2 實驗方法
    2.3 實驗結(jié)果
        2.3.1 IRE1結(jié)合蛋白的免疫沉淀及質(zhì)譜鑒定
        2.3.2 IRE1與CHIP相互作用的驗證
    2.4 小結(jié)
第三章 CHIP對IRE1作用的分子機制研究
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 實驗材料
        3.2.2 實驗方法
    3.3 實驗結(jié)果
        3.3.1 CHIP在體內(nèi)泛素化IRE1
        3.3.2 CHIP對IRE1的泛素化修飾方式的研究
    3.4 小結(jié)
第四章 CHIP對IRE1的激酶活性及信號通路的影響
    4.1 引言
    4.2 材料和方法
        4.2.1 實驗材料
        4.2.2 實驗方法
    4.3 實驗結(jié)果
        4.3.1 GA引起的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力對IRE1的激活的影響
        4.3.2 CHIP對IRE1下游相關(guān)通路的影響
        4.3.3 IRE1的泛素化修飾對其激酶活性和IRE1/TRAF2/JNK通路的影響
        4.3.4 去泛素化酶OTUB1對IRE1/TRAF2/JNK通路的影響
        4.3.5 CHIP對其他UPR通路的影響
            4.3.5.1 CHIP對ATF6通路的影響
            4.3.5.2 CHIP對PERK通路的影響
    4.4 小結(jié)
第五章 IRE1/TRAF2/JNK通路在細胞老化過程中的作用
    5.1 引言
    5.2 材料與方法
        5.2.1 實驗材料
        5.2.2 實驗方法
    5.3 實驗結(jié)果
        5.3.1 IRE1/TRAF2/JNK通路對細胞老化的作用
        5.3.2 CHIP在細胞老化中的作用
    5.4 小結(jié)
第六章 討論
基本結(jié)論
參考文獻
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本文編號:3988672

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