蛋白質(zhì)磷酸化翻譯后修飾在病毒的復(fù)制和抑制宿主細(xì)胞功能方面發(fā)揮重要的作用。然而,利用實(shí)驗(yàn)的方法識(shí)別磷酸化位點(diǎn)既費(fèi)時(shí)費(fèi)力又耗財(cái)。因此基于蛋白質(zhì)氨基酸序列發(fā)展一種機(jī)器學(xué)習(xí)方法對(duì)病毒蛋白磷酸化位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè)顯得非常有必要。研究結(jié)合支持向量機(jī)提出識(shí)別病毒蛋白磷酸化位點(diǎn)的新方法。采用權(quán)重氨基酸成分和屬性分組編碼對(duì)病毒蛋白殘基的氨基酸物理化學(xué)性質(zhì)和序列信息進(jìn)行特征提取,通過10倍交叉驗(yàn)證,絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸磷酸化位點(diǎn)的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率分別達(dá)到82.0%、85.8%和92.4%。運(yùn)用該預(yù)測(cè)模型對(duì)絲氨酸殘基磷酸化的激酶組進(jìn)行分類評(píng)估,CMGC、AGC和CAMK激酶組的馬氏相關(guān)系數(shù)分別達(dá)到69.3%、68.8%和68.2%。結(jié)果表明:構(gòu)建的方法可以有效地預(yù)測(cè)激酶特異性的磷酸化位點(diǎn)。

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本文編號(hào)：3880371