遼寧省間日瘧原蟲(chóng)裂殖子表面蛋白1基因型及同源性分析
發(fā)布時(shí)間:2023-04-02 02:50
目的分析近10年遼寧省輸入性及本地感染間日瘧病例的瘧原蟲(chóng)裂殖子表面蛋白1(PvMSP-1),并對(duì)其進(jìn)行基因型別BLAST比對(duì)和同源性進(jìn)化樹(shù)分析。方法收集2008-2018年的間日瘧病例樣本,提取瘧原蟲(chóng)基因組DNA,根據(jù)基因ICB5-ICB6區(qū)間片段設(shè)計(jì)引物,進(jìn)行巢氏PCR擴(kuò)增、測(cè)序、序列的比對(duì)以及同源性分析。結(jié)果共分析31份間日瘧核酸樣本,其中Sal-1型有13份,片段位置在470 bp左右,Belem型有18份,片段位置在400 bp左右。將所得出的目標(biāo)產(chǎn)物送上海維基基因測(cè)序公司進(jìn)行測(cè)序,經(jīng)進(jìn)化樹(shù)的比對(duì)分析,31份樣本中Sal-1型有13份,Belem型有5份,Ⅲ型的樣本有13份。PvMSP-1基因ICB5-ICB6片段存在高度多態(tài)性,DNA序列可以結(jié)合流行病學(xué)調(diào)查來(lái)確定感染的來(lái)源。結(jié)論遼寧省在近10年當(dāng)中輸入性及本地感染的PvMSP-1基因型有Sal-1型、Ⅲ型和Belem型,優(yōu)勢(shì)基因型為Sal-1型和Ⅲ型。
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣本采集
1.2 主要試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 測(cè)序與同源性的比對(duì)
2 結(jié)果
2.1 顯微鏡下間日瘧原蟲(chóng)的形態(tài)
2.2 PvMSP-1基因分型
2.3 構(gòu)建基因進(jìn)化樹(shù)
2.4各基因型代表株核苷酸的同源性比較
3 討論
本文編號(hào):3778381
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1 材料與方法
1.1 樣本采集
1.2 主要試劑
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.4 測(cè)序與同源性的比對(duì)
2 結(jié)果
2.1 顯微鏡下間日瘧原蟲(chóng)的形態(tài)
2.2 PvMSP-1基因分型
2.3 構(gòu)建基因進(jìn)化樹(shù)
2.4各基因型代表株核苷酸的同源性比較
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