背景與目的:病毒是自然界最豐富的物種之一,很多病毒嚴重威脅人類健康。近年來,新發(fā)突發(fā)病毒性傳染病多次發(fā)生,鑒于其高度的不可預測性、突發(fā)性、病死率高的特點,極易引起社會群體性恐慌�；诘诙咄繙y序的病毒宏基因組學技術直接對環(huán)境中所有的病毒核酸序列進行檢測,為調查已知和未知病毒提供了高效工具,成為發(fā)現(xiàn)新病毒的有效手段。蝙蝠分布范圍廣泛,是許多病毒的自然宿主,能攜帶包括多種人獸共患病毒在內的170多種病毒。蝙蝠可以通過中間宿主動物、氣溶膠或抓咬傷等方式將病毒傳播給人類。我國云南省西南邊境與東南亞國家接壤,戰(zhàn)略意義突出,是多種病毒性疾病的疫源地,研究發(fā)現(xiàn)該地區(qū)蝙蝠攜帶有多種人獸共患病毒。本研究旨在調查云南普洱地區(qū)蝙蝠攜帶病毒的多樣性并發(fā)現(xiàn)新病毒,對防止野生動物源性病毒,特別是蝙蝠源性病毒傳播給人類提供指導意義。方法:在不影響蝙蝠種群延續(xù)的情況下,本研究于2016年7⁹月在云南普洱各地隨機收集84份外表健康的蝙蝠樣品,通過PCR方法鑒定蝙蝠品種。利用本實驗室建立好的高通量測序樣品前處理方法對蝙蝠組織樣品處理并進行Hiseq高通量測序;利用生物信息分析平臺對測序后的大量數(shù)...

【文章頁數(shù)】：74 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
引言
第一部分 蝙蝠病毒宏基因組學研究
    材料與方法
        1 主要儀器和試劑
        2 生物信息軟件
        3 蝙蝠樣品采集
        4 蝙蝠種類鑒定及解剖
        5 高通量測序前組織樣品處理
        6 IlluminaHiseq測序
        7 測序后生物信息分析
    結果
        1 蝙蝠種類鑒定結果
        2 測序樣品質量鑒定結果
        3 病毒宏基因組分析結果
    討論
第二部分 蝙蝠新病毒的鑒定
    材料與方法
        1 實驗儀器、主要試劑和耗材
        2 樣品、細胞系和實驗動物
        3 生物信息軟件
        4 特異性引物設計
        5 病毒核酸提取
        6 病毒RNA反轉錄
        7 病毒流行病學篩查
        8 病毒基因組擴增
        9 制備DNA分子單克隆
        10 實時熒光定量PCR
        11 DPRV致病性實驗
        12 構建病毒進化樹
        13 非同義突變替換率/同義突變替換率(dN/dS)比率分析
    結果
        1 新型漢坦病毒DodeHV
        2 新型彈狀病毒DPRV
    討論
研究結論
參考文獻
綜述
    綜述參考文獻
倫理證明
攻讀學位期間的研究成果
致謝



本文編號：3771362