青海省多房棘球絳蟲分子種系發(fā)生研究
發(fā)布時間:2023-02-11 15:52
目的對青海省多房棘球絳蟲分離株Cox1、Nad1基因進行擴增和測序,并構建系統(tǒng)進化樹及分子鐘,為推測其進化關系及起源提供參考依據(jù)。方法收集2017年青海省人民醫(yī)院收治的22份肝多房棘球蚴病患者術后標本,對多房棘球蚴線粒體DNA Cox1、Nad1基因進行PCR擴增和測序,并與Gen Bank數(shù)據(jù)庫中的棘球屬絳蟲Cox1基因和Nad1基因序列進行比對,觀察種內變異情況并構建進化樹和分子鐘。結果所有多房棘球絳蟲標本與Gen Bank數(shù)據(jù)庫中檢索的多房棘球絳蟲亞洲株Cox1、Nad1基因序列同源性均達99%以上,共獲得6種不同基因型,其中有2個分離株在Gen Bank數(shù)據(jù)庫中未找到同源性100%的基因序列。系統(tǒng)進化樹顯示,收集的多房棘球絳蟲標本與多房棘球絳蟲亞洲株聚類效果明顯;分子鐘推測青海地區(qū)多房棘球絳蟲起源于9.4萬年前。結論本研究發(fā)現(xiàn)青海省多房棘球絳蟲存在6種不同基因型,其中首次發(fā)現(xiàn)2種基因型。青海地區(qū)多房棘球絳蟲優(yōu)勢株為亞洲株,起源時間約在9.4萬年前。
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本文編號:3740684
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