目的:分析單核細(xì)胞(Mo)向巨噬細(xì)胞(Mφ)分化的過程中,細(xì)胞骨架的調(diào)控相關(guān)基因及信號(hào)通路的表達(dá)變化。方法:CEO數(shù)據(jù)庫(kù)獲得Mo和Mφ的芯片數(shù)據(jù),經(jīng)RStudio軟件分析獲得差異表達(dá)基因(DEGenes),利用STRING在線工具對(duì)DEGenes構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI),Cytoscap軟件篩選出DEGenes的核心模塊;對(duì)篩選出的DEGenes的核心模塊進(jìn)行GO和KEGG分析。結(jié)果:Mφ相對(duì)于Mo的差異表達(dá)基因共476個(gè),主要涉及的信號(hào)通路包括NOD樣受體信號(hào)通路和吞噬體信號(hào)通路,這些通路中CCL18、CXCL8和C3等相關(guān)基因與細(xì)胞骨架的調(diào)控密切相關(guān)。結(jié)論:Mo向Mφ分化過程中細(xì)胞骨架調(diào)控相關(guān)基因的表達(dá)發(fā)生了顯著改變。

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【文章目錄】：
1 資料和方法
    1.1 資料
    1.2 方法
        1.2.1 分析芯片數(shù)據(jù)差異基因
        1.2.2 構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)
        1.2.3 GO和KEGG富集分析DEGenes的核心模塊
2 結(jié)果
    2.1 經(jīng)RStudio軟件獲得DEGenes
    2.2 構(gòu)建PPI
    2.3 GO和KEGG富集分析DEGenes
3 討論



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