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用EPR技術(shù)測量蛋白質(zhì)分子內(nèi)選定位點(diǎn)之間的距離

發(fā)布時(shí)間:2022-02-10 04:12
  生物大分子(如蛋白質(zhì))的結(jié)構(gòu)與功能研究是現(xiàn)代生物學(xué)的重要研究領(lǐng)域。定點(diǎn)自旋標(biāo)記結(jié)合電子順磁共振(Site-Directed Spin Labeling ElectronParamagnetic Resonance,SDSL-EPR)技術(shù)是目前可以在生理環(huán)境下研究蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)的主要方法之一。SDSL-EPR技術(shù)利用SDSL技術(shù)在生物分子內(nèi)的目的位點(diǎn)選擇性地標(biāo)記上含有未偶自旋的氮氧自由基,再通過EPR技術(shù)測量未偶自旋的波譜狀態(tài),通過波譜解析,可以獲得標(biāo)記位點(diǎn)的運(yùn)動(dòng)狀態(tài)和兩個(gè)未偶自旋間的距離及其變化。其距離測量方法的特點(diǎn)是測距范圍寬,受其它因素影響小,對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和構(gòu)象變化分析更加有效。SDSL-EPR可研究溶液中類似生理環(huán)境下的蛋白質(zhì),更加適合用于測量結(jié)構(gòu)變化的動(dòng)態(tài)過程,解決了許多生物學(xué)研究中的難點(diǎn)問題,例如難以獲得結(jié)晶的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析、膜蛋白和大分子蛋白復(fù)合體的構(gòu)象分析、溶液狀態(tài)下蛋白質(zhì)的動(dòng)態(tài)變化、蛋白質(zhì)之間和蛋白質(zhì)與膜之間的相互作用等。SDSL-EPR距離測量方法目前仍然存在一些問題:由于生物樣品的多樣性,實(shí)際測量中許多因素都可能引起連續(xù)波電子順磁共振(Continues Wave ... 

【文章來源】:中國人民解放軍軍事科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】:108 頁

【學(xué)位級別】:博士

【文章目錄】:
縮略詞表
摘要
Abstract
前言
第一章 EPR 距離測量原理及其應(yīng)用
    1 定點(diǎn)自旋標(biāo)記技術(shù)(SDSL)
    2 EPR 距離測量原理
        2.1 偶極-偶極耦合作用
        2.2 EPR 距離計(jì)算方法
            2.2.1 CW-EPR 距離計(jì)算方法
            2.2.2 Pulsed EPR 距離計(jì)算方法
            2.2.3 CW-EPR 與 Pulsed EPR 比較
    3 EPR 距離測量在生物研究中的應(yīng)用
        3.1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究
        3.2 蛋白質(zhì)相互作用
        3.3 核酸分子研究
        3.4 長距離的測量應(yīng)用
第二章 連續(xù)波 EPR 距離計(jì)算軟件
    1 軟件簡介
    2 波譜擬合
        2.1 各類型實(shí)驗(yàn)譜擬合
        2.2 波譜反擬合程序
        2.3 高斯擬合程序
        2.4 擬合過程的方法改進(jìn)
    3 距離計(jì)算
        3.1 增寬函數(shù)的擬合
        3.2 波譜中心點(diǎn)的選擇
    4 本章總結(jié)
第三章 雙自旋距離刻度分子標(biāo)尺
    1 標(biāo)尺分子的設(shè)計(jì)
    2 C60單/雙自旋分子的合成與鑒定
        2.1 材料與方法
            2.1.1 主要分析儀器
            2.1.2 C60單/雙加成化合物的合成及分離
            2.1.3 C60單/雙自旋化合物的合成與鑒定
        2.2 結(jié)果與討論
            2.2.1 紫外吸收譜
            2.2.2 室溫 CW-EPR 實(shí)驗(yàn)
            2.2.3 穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)
        2.3 小結(jié)
    3 標(biāo)尺分子距離測量實(shí)驗(yàn)
        3.1 材料與方法
            3.1.1 設(shè)備與材料
            3.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2 結(jié)果與分析
            3.2.1 不同溫度下 C60單/雙自旋分子 EPR 波譜
            3.2.2 不同濃度下 C60單/雙自旋分子 EPR 波譜
            3.2.3 不同溶劑下 C60單/雙自旋分子 EPR 波譜
            3.2.4 微波功率對 C60單/雙自旋分子 EPR 波譜的影響
            3.2.5 本底信號(hào)
        3.3 小結(jié)
    4 距離刻度實(shí)驗(yàn)及刻度標(biāo)尺的建立
        4.1 不同濃度下波譜增寬效應(yīng)與雙基間距離的關(guān)系
        4.2 不同溫度下波譜增寬效應(yīng)與雙基間距離的關(guān)系
        4.3 不同功率下波譜增寬效應(yīng)與雙基間距離的關(guān)系
        4.4 不同溶劑下波譜增寬效應(yīng)與雙基間距離的關(guān)系
    5 本章總結(jié)
第四章 距離測量蛋白質(zhì)實(shí)驗(yàn)?zāi)P偷臉?gòu)建
    1 單/雙 Cys 點(diǎn)突變 hLSECtin-CRD 結(jié)構(gòu)域蛋白質(zhì)模型的設(shè)計(jì)
    2 膜蛋白 hLSECtin-CRD 結(jié)構(gòu)域(野生型)的表達(dá)
        2.1 實(shí)驗(yàn)材料與設(shè)備
            2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
            2.1.2 主要試劑與設(shè)備
        2.2 實(shí)驗(yàn)方法
            2.2.1 載體構(gòu)建
            2.2.2 hLSECtin-CRD 結(jié)構(gòu)域蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)
            2.2.3 SDS-PAGE 檢測
            2.2.4 Western blotting 檢測
            2.2.5 透射電鏡檢測
            2.2.6 生物功能檢測
            2.2.7 數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計(jì)分析
        2.3 結(jié)果
            2.3.1 原核表達(dá)載體構(gòu)建
            2.3.2 常規(guī)原核表達(dá)載體蛋白表達(dá)結(jié)果
            2.3.3 Tat-hLSECtin-CRD 蛋白表達(dá)結(jié)果
            2.3.4 細(xì)胞亞顯微結(jié)構(gòu)
            2.3.5 Tat-hLSECtin-CRD 生物功能檢測結(jié)果
            2.3.6 小結(jié)
    3 單/雙 Cys 點(diǎn)突變 hLSECtin-CRD 結(jié)構(gòu)域蛋白的表達(dá)與純化
        3.1 材料與設(shè)備
        3.2 實(shí)驗(yàn)方法
            3.2.1 單/雙 Cys 點(diǎn)突變的引入
            3.2.2 原核載體表達(dá)與純化
            3.2.3 真核載體表達(dá)與純化
        3.3 結(jié)果
            3.3.1 單/雙 Cys 點(diǎn)突變 hLSECtin-CRD 結(jié)構(gòu)域蛋白的原核表達(dá)與純化
            3.3.2 單/雙 Cys 點(diǎn)突變 hLSECtin-CRD 結(jié)構(gòu)域蛋白的真核表達(dá)與純化
    4 本章總結(jié)
第五章 總結(jié)與討論
參考文獻(xiàn)
文獻(xiàn)綜述
    參考文獻(xiàn)
個(gè)人簡歷
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]電子順磁共振測量蛋白質(zhì)分子內(nèi)選定位點(diǎn)之間距離的方法及應(yīng)用[J]. 吳可.  生物物理學(xué)報(bào). 2010(04)
[2]EPR波譜擬合-傅里葉去卷積距離計(jì)算方法[J]. 郭林超,王長振,叢建波,先宏,吳可.  波譜學(xué)雜志. 2010(01)
[3]電磁脈沖對大鼠肝臟線粒體膜流動(dòng)性及脂質(zhì)過氧化的影響[J]. 王長振,叢建波,先宏,曹曉哲,孫存普,吳可.  中華勞動(dòng)衛(wèi)生職業(yè)病雜志. 2002(04)
[4]中國地鼠肺正常細(xì)胞V79和癌變細(xì)胞V79-B1膜上巰基結(jié)合位置的性質(zhì)[J]. 忻文娟,趙保路,張建中.  中國科學(xué)(B輯 化學(xué) 生物學(xué) 農(nóng)學(xué) 醫(yī)學(xué) 地學(xué)). 1984(05)



本文編號(hào):3618225

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