識別疾病相關miRNA和gene的方法研究
發(fā)布時間:2022-01-26 05:05
Micro RNA(mi RNA)是一類內生的小的非編碼基因,在轉錄后調控以及其他重要生物過程中起重要作用。最近,積累的證據(jù)表明mi RNA廣泛參與各種疾病。因此,識別疾病相關的mi RNA可以幫助我們了解疾病潛在的發(fā)病機制并且可以幫助我們識別新的生物標志。然而,由于其廣泛參與各種生物過程,識別出哪些mi RNA與哪種疾病相關是非常不易的。識別人類疾病基因(gene)在生物醫(yī)學研究中是一項重要的工作,除了直接識別個體疾病基因的實驗和臨床方法外,還有越來越多的方法通過計算方法預測更多的疾病基因。在本文中,我們分別提出兩種方法來識別疾病相關的mi RNA和gene,我們首先提出了一種名為mi RSub Path的新方法,通過三個步驟來鑒定疾病相關的mi RNA。候選基因來自于功能失調的顯著子通路,然后根據(jù)mi RNA和基因關聯(lián)確定候選mi RNA。最后,根據(jù)這些候選mi RNA在功能相似性網絡中與一些種子mi RNA的功能相似分數(shù)來進行排序。實際數(shù)據(jù)集的結果顯示,所提出的mi RSub Path方法比先前的方法更強健并且可以鑒定更多的疾病相關的m...
【文章來源】:溫州大學浙江省
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
根據(jù)子通路和miRNA功能相似性網絡識別疾病相關miRNA的主要工作流程
圖 3-1 在基本模型和三個條件模型中檢測到的 10 個顯著位點Figure 3-1 The ten significant loci detected in the basic model and the threeconditional models圖 3-1 中圓點是加性效應,紅色,綠色和藍色分別表示純加性效應,種族特
候選基因的遺傳結構
【參考文獻】:
期刊論文
[1]急性心肌梗死和急性腦梗死m(xù)iRNA疾病標志物的初步篩查[J]. 杜守治,董斌,齊中華. 中國醫(yī)科大學學報. 2017(08)
[2]miRNA-146a與肺部疾病的研究進展[J]. 李文婷,劉真,賈赤宇. 中華損傷與修復雜志(電子版). 2014(04)
[3]全基因組關聯(lián)分析對銀屑病遺傳學研究的啟示[J]. 張學軍. 浙江大學學報(醫(yī)學版). 2009(04)
[4]生物信息學:融合生物科學與計算機科技的新學科[J]. 陳穎健. 求是. 2003(07)
博士論文
[1]基于HMM方法的蛋白質局部片段結構屬性的預測研究[D]. 余建勇.上海交通大學 2013
[2]基于圖和復雜網絡理論的蛋白質相互作用數(shù)據(jù)分析與應用研究[D]. 尤著宏.中國科學技術大學 2010
[3]基因組轉錄調控元件的特征分析與識別算法研究[D]. 杜耀華.國防科學技術大學 2006
本文編號:3609872
【文章來源】:溫州大學浙江省
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
根據(jù)子通路和miRNA功能相似性網絡識別疾病相關miRNA的主要工作流程
圖 3-1 在基本模型和三個條件模型中檢測到的 10 個顯著位點Figure 3-1 The ten significant loci detected in the basic model and the threeconditional models圖 3-1 中圓點是加性效應,紅色,綠色和藍色分別表示純加性效應,種族特
候選基因的遺傳結構
【參考文獻】:
期刊論文
[1]急性心肌梗死和急性腦梗死m(xù)iRNA疾病標志物的初步篩查[J]. 杜守治,董斌,齊中華. 中國醫(yī)科大學學報. 2017(08)
[2]miRNA-146a與肺部疾病的研究進展[J]. 李文婷,劉真,賈赤宇. 中華損傷與修復雜志(電子版). 2014(04)
[3]全基因組關聯(lián)分析對銀屑病遺傳學研究的啟示[J]. 張學軍. 浙江大學學報(醫(yī)學版). 2009(04)
[4]生物信息學:融合生物科學與計算機科技的新學科[J]. 陳穎健. 求是. 2003(07)
博士論文
[1]基于HMM方法的蛋白質局部片段結構屬性的預測研究[D]. 余建勇.上海交通大學 2013
[2]基于圖和復雜網絡理論的蛋白質相互作用數(shù)據(jù)分析與應用研究[D]. 尤著宏.中國科學技術大學 2010
[3]基因組轉錄調控元件的特征分析與識別算法研究[D]. 杜耀華.國防科學技術大學 2006
本文編號:3609872
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