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識(shí)別疾病相關(guān)miRNA和gene的方法研究

發(fā)布時(shí)間:2022-01-26 05:05
  Micro RNA(mi RNA)是一類內(nèi)生的小的非編碼基因,在轉(zhuǎn)錄后調(diào)控以及其他重要生物過程中起重要作用。最近,積累的證據(jù)表明mi RNA廣泛參與各種疾病。因此,識(shí)別疾病相關(guān)的mi RNA可以幫助我們了解疾病潛在的發(fā)病機(jī)制并且可以幫助我們識(shí)別新的生物標(biāo)志。然而,由于其廣泛參與各種生物過程,識(shí)別出哪些mi RNA與哪種疾病相關(guān)是非常不易的。識(shí)別人類疾病基因(gene)在生物醫(yī)學(xué)研究中是一項(xiàng)重要的工作,除了直接識(shí)別個(gè)體疾病基因的實(shí)驗(yàn)和臨床方法外,還有越來越多的方法通過計(jì)算方法預(yù)測(cè)更多的疾病基因。在本文中,我們分別提出兩種方法來識(shí)別疾病相關(guān)的mi RNA和gene,我們首先提出了一種名為mi RSub Path的新方法,通過三個(gè)步驟來鑒定疾病相關(guān)的mi RNA。候選基因來自于功能失調(diào)的顯著子通路,然后根據(jù)mi RNA和基因關(guān)聯(lián)確定候選mi RNA。最后,根據(jù)這些候選mi RNA在功能相似性網(wǎng)絡(luò)中與一些種子mi RNA的功能相似分?jǐn)?shù)來進(jìn)行排序。實(shí)際數(shù)據(jù)集的結(jié)果顯示,所提出的mi RSub Path方法比先前的方法更強(qiáng)健并且可以鑒定更多的疾病相關(guān)的m... 

【文章來源】:溫州大學(xué)浙江省

【文章頁數(shù)】:56 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

識(shí)別疾病相關(guān)miRNA和gene的方法研究


根據(jù)子通路和miRNA功能相似性網(wǎng)絡(luò)識(shí)別疾病相關(guān)miRNA的主要工作流程

基本模型,位點(diǎn),加性效應(yīng),模型


圖 3-1 在基本模型和三個(gè)條件模型中檢測(cè)到的 10 個(gè)顯著位點(diǎn)Figure 3-1 The ten significant loci detected in the basic model and the threeconditional models圖 3-1 中圓點(diǎn)是加性效應(yīng),紅色,綠色和藍(lán)色分別表示純加性效應(yīng),種族特

遺傳結(jié)構(gòu)


候選基因的遺傳結(jié)構(gòu)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]急性心肌梗死和急性腦梗死m(xù)iRNA疾病標(biāo)志物的初步篩查[J]. 杜守治,董斌,齊中華.  中國醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(08)
[2]miRNA-146a與肺部疾病的研究進(jìn)展[J]. 李文婷,劉真,賈赤宇.  中華損傷與修復(fù)雜志(電子版). 2014(04)
[3]全基因組關(guān)聯(lián)分析對(duì)銀屑病遺傳學(xué)研究的啟示[J]. 張學(xué)軍.  浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2009(04)
[4]生物信息學(xué):融合生物科學(xué)與計(jì)算機(jī)科技的新學(xué)科[J]. 陳穎健.  求是. 2003(07)

博士論文
[1]基于HMM方法的蛋白質(zhì)局部片段結(jié)構(gòu)屬性的預(yù)測(cè)研究[D]. 余建勇.上海交通大學(xué) 2013
[2]基于圖和復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)理論的蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)分析與應(yīng)用研究[D]. 尤著宏.中國科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2010
[3]基因組轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件的特征分析與識(shí)別算法研究[D]. 杜耀華.國防科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2006



本文編號(hào):3609872

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