CD40 -1CT多態(tài)性位點(diǎn)與腦卒中發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)分析和Chd7基因誘變小鼠模型的差異表達(dá)基因驗(yàn)證
發(fā)布時(shí)間:2022-01-23 12:21
腦卒中是最常見(jiàn)的一種危害極大的急性疾病,指由血管堵塞導(dǎo)致血液無(wú)法把氧氣供給腦部引起神經(jīng)組織因缺氧而損傷,或者由腦部血管破裂血細(xì)胞流入神經(jīng)組織引起損傷的一類疾病。截止2017年1月,我國(guó)共有大于1100萬(wàn)腦卒中患者,每年新增約240萬(wàn)患者,每年約110萬(wàn)病人因腦卒中致死。腦卒中可分為缺血性腦卒中出血性腦卒中兩大類,其中缺血性腦卒中約占80%。家系、雙胞胎、動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的研究表明,遺傳因素是腦卒中發(fā)生的重要風(fēng)險(xiǎn)因素。CD40/CD40L在人體免疫反應(yīng)、炎癥反應(yīng)和凝血過(guò)程中發(fā)揮重要作用,CD40基因是腦卒中發(fā)生的潛在風(fēng)險(xiǎn)因子。CD40-1C>T單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)位于CD40基因的Kozak序列,研究表明該位點(diǎn)的變異影響CD40蛋白的表達(dá)。本文通過(guò)病例-對(duì)照實(shí)驗(yàn),選擇CD40-1C>T單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)在由498例腦卒中患者(338例缺血性腦卒中和160例出血性腦卒中)和498例健康對(duì)照組成的中國(guó)漢族人口樣本中進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。經(jīng)過(guò)協(xié)變量的回歸方程校正,發(fā)現(xiàn)CD40-1C>T位點(diǎn)與整體腦卒中(Padjusted=0.001,OR=1.41[95%CI=1.15-...
【文章來(lái)源】:上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
腦卒中發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)因素Figure1-1Riskfatorofstroke
信度高、成本較低,缺點(diǎn)是只適合做少量樣本的測(cè)的分型技術(shù)有 TaqMan 探針?lè)ê?HRM(High R線)法。TaqMan 探針?lè)ㄊ钱?dāng)前應(yīng)用最廣的高通量 一段首尾分別為熒光基團(tuán)和淬滅物、包含 SNP 位與淬滅物同處在探針上是,淬滅物使熒光基團(tuán)不PCR 反應(yīng)中聚合酶將探針酶切,發(fā)光基團(tuán)脫離發(fā)便能識(shí)別樣本的基因型,SNP 分型需要加入兩個(gè)TaqMan 分型原理如圖 1-3 所示。TaqMan 分型在具有明顯的優(yōu)勢(shì),靈敏度高,分型結(jié)果穩(wěn)定、可靠,片價(jià)格較高,且探針的定制周期長(zhǎng)。方法運(yùn)用實(shí)時(shí)定量熒光 PCR(Real-Time PCR)技線,檢測(cè) DNA 片段的微小差異。HRM 分型技術(shù)、成本低等優(yōu)點(diǎn),但是對(duì) 120bp 以上長(zhǎng)度的片段對(duì) G/C 的區(qū)分效果不好,因此應(yīng)用受到一定的限
圖 1-3 CHD7 蛋白結(jié)構(gòu)模式圖Figure 1-3 Schematic representation of CHD7 proteinCHD7 蛋白在幾種模式生物中都是同源的,包括果蠅、斑馬魚(yú)和小鼠。在體內(nèi)(in vivo)和體外(in vitro)系統(tǒng)研究中,研究者們發(fā)現(xiàn)了 CHD 家族蛋白的許多功能,比如結(jié)合甲基化組蛋白[47-49](methylated histone binding)、結(jié)合 DNA[50-52](DNA binding)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控[48, 49, 53-56]、細(xì)胞循環(huán)調(diào)控[48, 57]、細(xì)胞凋亡調(diào)控[58, 59]、染色質(zhì)重構(gòu)[45, 52, 57, 60-62]和胚胎干細(xì)胞多能性[63]。CHD 蛋白家族有兩個(gè)核心結(jié)構(gòu),一為 N-末端染色質(zhì)域的串聯(lián),這一結(jié)構(gòu)賦予CHD 家族蛋白結(jié)合甲基化組蛋白的功能[64];二為類似于 SNF2 結(jié)構(gòu)域的 ATP 酶/解旋酶結(jié)構(gòu)域,這一結(jié)構(gòu)具有染色質(zhì)重構(gòu)活性。CHD 蛋白家族的九個(gè)成員都有這兩個(gè)結(jié)構(gòu),而根據(jù)成員含有的其他結(jié)構(gòu)域的不同,又能把該家族分成三個(gè)亞組[65, 66]:(1)CHD1 和 CHD2 ;(2)CHD3、CHD4 和 CHD5;(3)CHD6、CHD7、CHD8和 CHD9。研究者在人類中進(jìn)行的 Chd7 基因表達(dá)分析中發(fā)現(xiàn),在胚胎發(fā)育的前 22 天,Chd7 基因的表達(dá)無(wú)處不在,之后在與 CHARGE 綜合癥相關(guān)的組織中檢測(cè)到 Chd7
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]CD40/CD40L基因及其多態(tài)性與動(dòng)脈粥樣硬化的研究進(jìn)展[J]. 吳甜,郭韌,張畢奎. 中南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2012(04)
本文編號(hào):3604338
【文章來(lái)源】:上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
腦卒中發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)因素Figure1-1Riskfatorofstroke
信度高、成本較低,缺點(diǎn)是只適合做少量樣本的測(cè)的分型技術(shù)有 TaqMan 探針?lè)ê?HRM(High R線)法。TaqMan 探針?lè)ㄊ钱?dāng)前應(yīng)用最廣的高通量 一段首尾分別為熒光基團(tuán)和淬滅物、包含 SNP 位與淬滅物同處在探針上是,淬滅物使熒光基團(tuán)不PCR 反應(yīng)中聚合酶將探針酶切,發(fā)光基團(tuán)脫離發(fā)便能識(shí)別樣本的基因型,SNP 分型需要加入兩個(gè)TaqMan 分型原理如圖 1-3 所示。TaqMan 分型在具有明顯的優(yōu)勢(shì),靈敏度高,分型結(jié)果穩(wěn)定、可靠,片價(jià)格較高,且探針的定制周期長(zhǎng)。方法運(yùn)用實(shí)時(shí)定量熒光 PCR(Real-Time PCR)技線,檢測(cè) DNA 片段的微小差異。HRM 分型技術(shù)、成本低等優(yōu)點(diǎn),但是對(duì) 120bp 以上長(zhǎng)度的片段對(duì) G/C 的區(qū)分效果不好,因此應(yīng)用受到一定的限
圖 1-3 CHD7 蛋白結(jié)構(gòu)模式圖Figure 1-3 Schematic representation of CHD7 proteinCHD7 蛋白在幾種模式生物中都是同源的,包括果蠅、斑馬魚(yú)和小鼠。在體內(nèi)(in vivo)和體外(in vitro)系統(tǒng)研究中,研究者們發(fā)現(xiàn)了 CHD 家族蛋白的許多功能,比如結(jié)合甲基化組蛋白[47-49](methylated histone binding)、結(jié)合 DNA[50-52](DNA binding)、轉(zhuǎn)錄調(diào)控[48, 49, 53-56]、細(xì)胞循環(huán)調(diào)控[48, 57]、細(xì)胞凋亡調(diào)控[58, 59]、染色質(zhì)重構(gòu)[45, 52, 57, 60-62]和胚胎干細(xì)胞多能性[63]。CHD 蛋白家族有兩個(gè)核心結(jié)構(gòu),一為 N-末端染色質(zhì)域的串聯(lián),這一結(jié)構(gòu)賦予CHD 家族蛋白結(jié)合甲基化組蛋白的功能[64];二為類似于 SNF2 結(jié)構(gòu)域的 ATP 酶/解旋酶結(jié)構(gòu)域,這一結(jié)構(gòu)具有染色質(zhì)重構(gòu)活性。CHD 蛋白家族的九個(gè)成員都有這兩個(gè)結(jié)構(gòu),而根據(jù)成員含有的其他結(jié)構(gòu)域的不同,又能把該家族分成三個(gè)亞組[65, 66]:(1)CHD1 和 CHD2 ;(2)CHD3、CHD4 和 CHD5;(3)CHD6、CHD7、CHD8和 CHD9。研究者在人類中進(jìn)行的 Chd7 基因表達(dá)分析中發(fā)現(xiàn),在胚胎發(fā)育的前 22 天,Chd7 基因的表達(dá)無(wú)處不在,之后在與 CHARGE 綜合癥相關(guān)的組織中檢測(cè)到 Chd7
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]CD40/CD40L基因及其多態(tài)性與動(dòng)脈粥樣硬化的研究進(jìn)展[J]. 吳甜,郭韌,張畢奎. 中南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2012(04)
本文編號(hào):3604338
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