成都某部一起感染Yamagata系乙型流感病毒血凝素基因分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-23 06:51
目的分析成都某部感染乙型流感病毒遺傳進(jìn)化與血凝素(HA)基因突變位點(diǎn)。方法通過犬腎上皮細(xì)胞(MDCK細(xì)胞)體外分離患者咽拭子標(biāo)本流感病毒毒株,用PCR獲取乙型流感病毒HA基因并測(cè)序,與NCBI數(shù)據(jù)庫在線比對(duì)并利用MEGA 6.06軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,分析突變位點(diǎn)。結(jié)果通過MDCK細(xì)胞接種,分離出1株乙型流感病毒株,以感染病例咽拭子核酸及分離毒株的核酸為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增得到1 755 bp全長HA基因,獲得的序列提交至GenBank數(shù)據(jù)庫,獲得基因登錄號(hào)為MH236281。通過在線比對(duì)及系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建,該病例感染的病毒為Yamagata系乙型流感病毒。與乙型流感病毒Yamagata系的代表毒株Influenza B/Yamagata/16/88(GenBank No. M36105)相比,HA基因點(diǎn)突變堿基為57個(gè);與世界衛(wèi)生組織(WHO)推薦的疫苗株Influenza B/Utah/08/2014 (Gen Bank No. KU592766)相比,突變堿基數(shù)為20個(gè)。進(jìn)一步對(duì)HA1氨基酸突變位點(diǎn)進(jìn)行分析,與四川地區(qū)往年流行株相比均發(fā)生了不同程度的突變,其中與2010年四川溫江的...
【文章來源】:第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019,40(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
乙型流感病毒的分離培養(yǎng)Fig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirus圖
?崳壞惴⑸?吮湟歟?直鷂?L176Q和M255V,這2個(gè)位點(diǎn)均不在乙型流感病毒HA1上的抗原決定簇區(qū)域內(nèi)。值得一提的是,HA1的176位點(diǎn)是一個(gè)全新的突變,以往四川流行毒株、Yamagata系的代表毒株InfluenzaB/Yamagata/16/88(GenBankNo.M36105)及WHO推薦的疫苗株InfluenzaB/Utah/08/2014(GenBankNo.KU592766)的HA1176位點(diǎn)均為亮氨酸(leucine,L),而本研究病例感染的乙型流感毒株HA1176位點(diǎn)突變?yōu)楣劝滨0罚╣lutamine,Q),其突變意義仍有待深入研究。圖3免疫熒光檢測(cè)乙型流感病毒感染的MDCK細(xì)胞內(nèi)核蛋白表達(dá)Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcellsinfectedwithinfluenzaBvirusMDCK:Madin-Darbycaninekidney.Originalmagnification:×10010102103VirusgradientdilutionFig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirusOriginalmagnification:×100圖3免疫熒光檢測(cè)乙型流感病毒感染MDCK細(xì)胞內(nèi)核蛋白表達(dá)Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcellsinfectedwithinfluenzaBvirusMDCK:Madin-Darbycaninekidneycell.Originalmagnification:×100以感染病例咽拭子和分離毒株提取的病毒核酸為模板,均可擴(kuò)增出大小為1755bp的目的片段(圖4),二者測(cè)序序列一致,提交至,二者測(cè)序序列一致,提交至GenBank數(shù)據(jù)庫,獲得數(shù)據(jù)庫,獲得GenBank登錄號(hào)為MH236281。Fig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirusOriginalmagnification:×100圖3免疫熒光檢測(cè)乙型流感病毒感染MDCK細(xì)胞內(nèi)核蛋白表達(dá)Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcells
為MH236281。Fig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirusOriginalmagnification:×100圖3免疫熒光檢測(cè)乙型流感病毒感染MDCK細(xì)胞內(nèi)核蛋白表達(dá)Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcellsinfectedwithinfluenzaBvirusMDCK:Madin-Darbycaninekidneycell.Originalmagnification:×100以感染病例咽拭子和分離毒株提取的病毒核酸為模板,均可擴(kuò)增出大小為1755bp的目的片段(圖4),二者測(cè)序序列一致,提交至GenBank數(shù)據(jù)庫,獲得GenBank登錄號(hào)為MH236281。圖4乙型流感病毒HA基因PCR產(chǎn)物電泳圖Fig4ElectrophoresisofPCRproductoftheinfluenzaBHAgeneHA:Hemagglutinin;M:Marker;1:Throatswabnucleicacidastemplate;2:Isolatedvirusstrainnucleicacidastemplate圖5基于HA基因的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹Fig5PhylogeneticevolutionarytreebasedontheHAgeneThe20171123(MH236281)isthesequenceobtainedinthisstudy.ThenumbersinparenthesesindicatetheaccessionnumberinGenBank.Thenumberateachbranchpointsisthepercentagesupportedbybootstrap.Bar:0.01sequencedivergence.HA:Hemagglutinin圖4乙型流感病毒HA基因PCR產(chǎn)物電泳圖Fig4ElectrophoresisofthePCRproductoftheinfluenzaBHAgeneagglutinin;M:Marker;1:Throatswabnucleicacidastemplate;2:Isolatedvirusstrainnucleicacidastemplate病毒HA基因系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹HA基因核酸序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,結(jié)果如圖5所示,本研究感染病例HA基ankNo.MH236281)均與Yamagata系的代表毒株InfluenzaB/Yamagata/16/88No.M36105)處在相同的進(jìn)化分枝上,而與Victoria系的代表毒株Influenz
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]今年我國流感流行的深度解析[J]. 周密,李雷雷,毛晨梅,胡必杰. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2018(04)
本文編號(hào):3603827
【文章來源】:第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019,40(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
乙型流感病毒的分離培養(yǎng)Fig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirus圖
?崳壞惴⑸?吮湟歟?直鷂?L176Q和M255V,這2個(gè)位點(diǎn)均不在乙型流感病毒HA1上的抗原決定簇區(qū)域內(nèi)。值得一提的是,HA1的176位點(diǎn)是一個(gè)全新的突變,以往四川流行毒株、Yamagata系的代表毒株InfluenzaB/Yamagata/16/88(GenBankNo.M36105)及WHO推薦的疫苗株InfluenzaB/Utah/08/2014(GenBankNo.KU592766)的HA1176位點(diǎn)均為亮氨酸(leucine,L),而本研究病例感染的乙型流感毒株HA1176位點(diǎn)突變?yōu)楣劝滨0罚╣lutamine,Q),其突變意義仍有待深入研究。圖3免疫熒光檢測(cè)乙型流感病毒感染的MDCK細(xì)胞內(nèi)核蛋白表達(dá)Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcellsinfectedwithinfluenzaBvirusMDCK:Madin-Darbycaninekidney.Originalmagnification:×10010102103VirusgradientdilutionFig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirusOriginalmagnification:×100圖3免疫熒光檢測(cè)乙型流感病毒感染MDCK細(xì)胞內(nèi)核蛋白表達(dá)Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcellsinfectedwithinfluenzaBvirusMDCK:Madin-Darbycaninekidneycell.Originalmagnification:×100以感染病例咽拭子和分離毒株提取的病毒核酸為模板,均可擴(kuò)增出大小為1755bp的目的片段(圖4),二者測(cè)序序列一致,提交至,二者測(cè)序序列一致,提交至GenBank數(shù)據(jù)庫,獲得數(shù)據(jù)庫,獲得GenBank登錄號(hào)為MH236281。Fig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirusOriginalmagnification:×100圖3免疫熒光檢測(cè)乙型流感病毒感染MDCK細(xì)胞內(nèi)核蛋白表達(dá)Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcells
為MH236281。Fig2IsolationandincubationofinfluenzaBvirusOriginalmagnification:×100圖3免疫熒光檢測(cè)乙型流感病毒感染MDCK細(xì)胞內(nèi)核蛋白表達(dá)Fig3ImmunofluorescencedetectionofnucleoproteinexpressioninMDCKcellsinfectedwithinfluenzaBvirusMDCK:Madin-Darbycaninekidneycell.Originalmagnification:×100以感染病例咽拭子和分離毒株提取的病毒核酸為模板,均可擴(kuò)增出大小為1755bp的目的片段(圖4),二者測(cè)序序列一致,提交至GenBank數(shù)據(jù)庫,獲得GenBank登錄號(hào)為MH236281。圖4乙型流感病毒HA基因PCR產(chǎn)物電泳圖Fig4ElectrophoresisofPCRproductoftheinfluenzaBHAgeneHA:Hemagglutinin;M:Marker;1:Throatswabnucleicacidastemplate;2:Isolatedvirusstrainnucleicacidastemplate圖5基于HA基因的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹Fig5PhylogeneticevolutionarytreebasedontheHAgeneThe20171123(MH236281)isthesequenceobtainedinthisstudy.ThenumbersinparenthesesindicatetheaccessionnumberinGenBank.Thenumberateachbranchpointsisthepercentagesupportedbybootstrap.Bar:0.01sequencedivergence.HA:Hemagglutinin圖4乙型流感病毒HA基因PCR產(chǎn)物電泳圖Fig4ElectrophoresisofthePCRproductoftheinfluenzaBHAgeneagglutinin;M:Marker;1:Throatswabnucleicacidastemplate;2:Isolatedvirusstrainnucleicacidastemplate病毒HA基因系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹HA基因核酸序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,結(jié)果如圖5所示,本研究感染病例HA基ankNo.MH236281)均與Yamagata系的代表毒株InfluenzaB/Yamagata/16/88No.M36105)處在相同的進(jìn)化分枝上,而與Victoria系的代表毒株Influenz
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]今年我國流感流行的深度解析[J]. 周密,李雷雷,毛晨梅,胡必杰. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2018(04)
本文編號(hào):3603827
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