Cidec基因敲除小鼠腸道菌群的特征
發(fā)布時間:2022-01-20 12:45
目的:探究Cidec敲除(CIDEC-KO)小鼠腸道菌群的結(jié)構(gòu)。方法:隨機分別挑選體重相近、2月齡5只野生型和5只Cidec敲除的雄性小鼠,收集兩種基因型小鼠經(jīng)高脂飼料16周喂養(yǎng)前后的新鮮糞便。提取糞便中的細菌基因組,對菌群基因組16S r RNA基因V4高變區(qū)進行測序,對數(shù)據(jù)進行PCoA分析、Alpha多樣性分析及LEf Se分析。結(jié)果:屬水平下的LEf Se分析顯示,在普通飼料喂養(yǎng)條件下,Cidec缺失小鼠對比野生型小鼠糞便中PrevotellaceaUCG001屬豐度顯著上升,Blautia屬、Streptococcus屬、LachnospiraceaeUCG006屬豐度顯著下降。與同月齡同高脂喂養(yǎng)的野生型小鼠比,Cidec敲除小鼠糞便中RuminococcaceaeUCG014屬豐度顯著下降。進一步比較同一種基因型下飲食對腸道菌群的改變,發(fā)現(xiàn)在喂養(yǎng)高脂飼料后,某些屬的豐度僅在Cidec缺失小鼠中發(fā)生顯著變化,但是在野生型小鼠中未發(fā)現(xiàn)有顯著變化,這些...
【文章來源】:現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2020,20(03)
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
Alpha多樣性分析高脂及普通飼料喂養(yǎng)條件下野生型以及Cidec敲除小鼠腸道菌群
圖1 Alpha多樣性分析高脂及普通飼料喂養(yǎng)條件下野生型以及Cidec敲除小鼠腸道菌群2.4 高脂飼料喂養(yǎng)條件下野生型小鼠和Cidec敲除小鼠糞便中的差異物種
2.5 野生型小鼠及Cidec缺失小鼠在高脂飼料喂養(yǎng)前后糞便中的差異物種通過LEf Se進一步分析比較同一種基因型下飲食對腸道菌群的改變,圖5和圖6分別顯示高脂喂養(yǎng)前后的野生型及Cidec缺失小鼠糞便中在屬水平下顯著變化的菌群,并根據(jù)LEf Se分析結(jié)果繪制兩個基因型的腸道菌群在高脂喂養(yǎng)后變化菌屬的韋恩圖如圖6所示。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Ablation of gut microbiota alleviates obesity-induced hepatic steatosis and glucose intolerance by modulating bile acid metabolism in hamsters[J]. Lulu Sun,Yuanyuan Pang,Xuemei Wang,Qing Wu,Huiying Liu,Bo Liu,George Liu,Min Ye,Wei Kong,Changtao Jiang. Acta Pharmaceutica Sinica B. 2019(04)
[2]Inulin Can Alleviate Metabolism Disorders in ob/ob Mice by Partially Restoring Leptinrelated Pathways Mediated by Gut Microbiota[J]. Xiaofeng Song,Liang Zhong,Na Lyu,Fei Liu,Boxing Li,Yanan Hao,Yong Xue,Jing Li,Yuqing Feng,Yue Ma,Yongfei Hu,Baoli Zhu. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2019(01)
本文編號:3598851
【文章來源】:現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2020,20(03)
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
Alpha多樣性分析高脂及普通飼料喂養(yǎng)條件下野生型以及Cidec敲除小鼠腸道菌群
圖1 Alpha多樣性分析高脂及普通飼料喂養(yǎng)條件下野生型以及Cidec敲除小鼠腸道菌群2.4 高脂飼料喂養(yǎng)條件下野生型小鼠和Cidec敲除小鼠糞便中的差異物種
2.5 野生型小鼠及Cidec缺失小鼠在高脂飼料喂養(yǎng)前后糞便中的差異物種通過LEf Se進一步分析比較同一種基因型下飲食對腸道菌群的改變,圖5和圖6分別顯示高脂喂養(yǎng)前后的野生型及Cidec缺失小鼠糞便中在屬水平下顯著變化的菌群,并根據(jù)LEf Se分析結(jié)果繪制兩個基因型的腸道菌群在高脂喂養(yǎng)后變化菌屬的韋恩圖如圖6所示。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Ablation of gut microbiota alleviates obesity-induced hepatic steatosis and glucose intolerance by modulating bile acid metabolism in hamsters[J]. Lulu Sun,Yuanyuan Pang,Xuemei Wang,Qing Wu,Huiying Liu,Bo Liu,George Liu,Min Ye,Wei Kong,Changtao Jiang. Acta Pharmaceutica Sinica B. 2019(04)
[2]Inulin Can Alleviate Metabolism Disorders in ob/ob Mice by Partially Restoring Leptinrelated Pathways Mediated by Gut Microbiota[J]. Xiaofeng Song,Liang Zhong,Na Lyu,Fei Liu,Boxing Li,Yanan Hao,Yong Xue,Jing Li,Yuqing Feng,Yue Ma,Yongfei Hu,Baoli Zhu. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2019(01)
本文編號:3598851
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