發(fā)育大鼠腦成像數(shù)據(jù)處理方法研究及應用
發(fā)布時間:2022-01-11 02:52
認識并了解腦發(fā)育的過程,能夠為重大腦疾病的“早預防、早診斷、早干預、早治療”提供重要的依據(jù)。無創(chuàng)的分子影像技術(shù)為腦發(fā)育的研究提供了有力的手段。動物實驗在腦發(fā)育研究中具有不可替代的作用,如基因、環(huán)境、藥物等對腦發(fā)育的影響,都需要首先利用動物模型進行研究。大鼠因其疾病模型豐富、生長周期短等優(yōu)點,是腦發(fā)育研究常用的動物模型。雖然目前已有多個國內(nèi)外的實驗室建立了成年大鼠的腦影像數(shù)據(jù)分析方法,然而,由于處于不同發(fā)育階段的大鼠在腦形狀、尺寸、以及腦結(jié)構(gòu)等方面均與成年大鼠存在較大差異,目前已有的成年大鼠腦成像數(shù)據(jù)分析平臺并不適用于發(fā)育早期大鼠腦成像的數(shù)據(jù)分析。因此,本論文以發(fā)育期大鼠為研究對象,將其腦發(fā)育過程劃分為新生、幼年和成年三個典型階段,建立了適用于發(fā)育大鼠的多模態(tài)腦影像數(shù)據(jù)分析平臺,包括逐像素統(tǒng)計分析平臺和基于感興趣區(qū)的定量分析平臺。逐像素統(tǒng)計分析方法是目前應用最為廣泛的數(shù)據(jù)分析方法,可客觀地對全腦影像數(shù)據(jù)進行逐個像素的對比分析。標準腦模板和腦地圖集是開展逐像素統(tǒng)計分析需要的重要工具。由于不同大鼠個體的腦在大小和形狀方面都不相同,在進行逐像素統(tǒng)計分析時需要首先把不同個體的腦圖像標準化到統(tǒng)一的...
【文章來源】:鄭州大學河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:99 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
神經(jīng)元活動影響磁共振信號(3)擴散磁共振成像原理
第 1 章 引言電的電子相遇,發(fā)生湮滅反應,其質(zhì)量轉(zhuǎn)化為一對沿相反方向射出的 511keV 的γ光子,這對γ光子穿透人體后被環(huán)繞在生物體外的探測器探測到,經(jīng)后端的核電子學電路處理,完成事例符合處理、數(shù)據(jù)重組和圖像重建等,得到 PET 圖像。PET 圖像強度值的高低與放射性示蹤劑在對應位置的聚集程度有關(guān),放射性示蹤劑的分布與腦功能活動密切相關(guān),因此,PET 常用作腦功能發(fā)育研究。
圖 2. 3 成年大鼠結(jié)構(gòu)像顱骨剝離結(jié)果。紅色區(qū)域為顱內(nèi)組織。(2)FDG-PET 圖像顱骨剝離FDG-PET 圖像是在小動物 PET-CT 一體機上完成采集,由于 FDG-PET 成像是根據(jù)探測 FDG 衰變產(chǎn)生的正電子與生物體內(nèi)負電子湮滅后產(chǎn)生的γ光子進行成像的,F(xiàn)DG 主要分布在生物體內(nèi)需要能量消耗的地方,通過 FDG-PET 圖像很難確定顱內(nèi)組織與顱外的邊界,提取顱內(nèi)組織圖像十分困難。CT 通過探測穿越生物體的 X 射線進行成像,可以很好的檢測出顱骨的位置,顱骨作為腦內(nèi)組織與腦外組織的邊界,可為腦內(nèi)組織圖像的提取提供邊界參考。因此,本論文進行FDG-PET 成像時,同時采集同體位的 CT 像,利用 CT 像確定出腦內(nèi)組織的邊界位置,然后進一步在 FDG-PET 像上提取腦內(nèi)組織圖像。具體作法如下:步驟 1:根據(jù) CT 圖像的灰度直方圖,將 CT 圖做二值化處理,選取二值化后圖像的重心作為種子點,以種子點作為初始點,利用區(qū)域生長法[58, 60]在 CT 圖像上提取出顱骨邊界,并確定出顱內(nèi)圖像的掩膜圖像。步驟 2:由于 CT 圖像的圖像分辨率要高于 PET 圖像,不能直接利用 CT 圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]彌散張量成像觀察電針對缺血性腦卒中大鼠運動皮層-紋狀體神經(jīng)傳導束的影響[J]. 林冰冰,王鮮,柳維林,梁勝祥,楊敏光,陶靜,陳立典. 中國康復理論與實踐. 2017(07)
[2]基于模糊C均值聚類和Canny算子的紅外圖像邊緣識別與缺陷定量檢測[J]. 唐慶菊,劉俊巖,王揚,劉元林,梅晨. 紅外與激光工程. 2016(09)
[3]面向未來的中國科學院腦科學與類腦智能研究——強化基礎研究,推進深度融合[J]. 王力為,許麗,徐萍,于漢超,孔明輝,沈毅,張永清. 中國科學院院刊. 2016(07)
[4]腦科學與類腦研究概述[J]. 蒲慕明,徐波,譚鐵牛. 中國科學院院刊. 2016(07)
[5]缺血性腦卒中的治療研究進展[J]. 孟文婷,李東翔,佟玲. 中國新藥雜志. 2016(10)
[6]基于區(qū)域生長算法的CT序列圖像分割[J]. 潘家輝,朱玲利,鮑蘇蘇. 洛陽師范學院學報. 2015(05)
[7]Recovery mechanisms of somatosensory function in stroke patients: implications of brain imaging studies[J]. Sung Ho Jang. Neuroscience Bulletin. 2013(03)
[8]A Comparison of Brain Activity between Healthy Subjects and Stroke Patients on fMRI by Acupuncture Stimulation[J]. Seung-Yeon Cho,Mia Kim,Jong Joo Sun,Geon-Ho Jahng,Hengjun J Kim,Seong-Uk Park,Woo-Sang Jung,Chang-Nam Ko,Jung-Mi Park. Chinese Journal of Integrative Medicine. 2013(04)
[9]基于list-mode數(shù)據(jù)的PET斷層重建原理與實現(xiàn)[J]. 張斌,單保慈,贠明凱,趙書俊. 生物醫(yī)學工程學雜志. 2012(05)
[10]基于像素的形態(tài)學分析算法的研究進展[J]. 程傳力,趙書俊,聶彬彬,單保慈,校審. 中國醫(yī)學影像技術(shù). 2011(12)
本文編號:3581937
【文章來源】:鄭州大學河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:99 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
神經(jīng)元活動影響磁共振信號(3)擴散磁共振成像原理
第 1 章 引言電的電子相遇,發(fā)生湮滅反應,其質(zhì)量轉(zhuǎn)化為一對沿相反方向射出的 511keV 的γ光子,這對γ光子穿透人體后被環(huán)繞在生物體外的探測器探測到,經(jīng)后端的核電子學電路處理,完成事例符合處理、數(shù)據(jù)重組和圖像重建等,得到 PET 圖像。PET 圖像強度值的高低與放射性示蹤劑在對應位置的聚集程度有關(guān),放射性示蹤劑的分布與腦功能活動密切相關(guān),因此,PET 常用作腦功能發(fā)育研究。
圖 2. 3 成年大鼠結(jié)構(gòu)像顱骨剝離結(jié)果。紅色區(qū)域為顱內(nèi)組織。(2)FDG-PET 圖像顱骨剝離FDG-PET 圖像是在小動物 PET-CT 一體機上完成采集,由于 FDG-PET 成像是根據(jù)探測 FDG 衰變產(chǎn)生的正電子與生物體內(nèi)負電子湮滅后產(chǎn)生的γ光子進行成像的,F(xiàn)DG 主要分布在生物體內(nèi)需要能量消耗的地方,通過 FDG-PET 圖像很難確定顱內(nèi)組織與顱外的邊界,提取顱內(nèi)組織圖像十分困難。CT 通過探測穿越生物體的 X 射線進行成像,可以很好的檢測出顱骨的位置,顱骨作為腦內(nèi)組織與腦外組織的邊界,可為腦內(nèi)組織圖像的提取提供邊界參考。因此,本論文進行FDG-PET 成像時,同時采集同體位的 CT 像,利用 CT 像確定出腦內(nèi)組織的邊界位置,然后進一步在 FDG-PET 像上提取腦內(nèi)組織圖像。具體作法如下:步驟 1:根據(jù) CT 圖像的灰度直方圖,將 CT 圖做二值化處理,選取二值化后圖像的重心作為種子點,以種子點作為初始點,利用區(qū)域生長法[58, 60]在 CT 圖像上提取出顱骨邊界,并確定出顱內(nèi)圖像的掩膜圖像。步驟 2:由于 CT 圖像的圖像分辨率要高于 PET 圖像,不能直接利用 CT 圖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]彌散張量成像觀察電針對缺血性腦卒中大鼠運動皮層-紋狀體神經(jīng)傳導束的影響[J]. 林冰冰,王鮮,柳維林,梁勝祥,楊敏光,陶靜,陳立典. 中國康復理論與實踐. 2017(07)
[2]基于模糊C均值聚類和Canny算子的紅外圖像邊緣識別與缺陷定量檢測[J]. 唐慶菊,劉俊巖,王揚,劉元林,梅晨. 紅外與激光工程. 2016(09)
[3]面向未來的中國科學院腦科學與類腦智能研究——強化基礎研究,推進深度融合[J]. 王力為,許麗,徐萍,于漢超,孔明輝,沈毅,張永清. 中國科學院院刊. 2016(07)
[4]腦科學與類腦研究概述[J]. 蒲慕明,徐波,譚鐵牛. 中國科學院院刊. 2016(07)
[5]缺血性腦卒中的治療研究進展[J]. 孟文婷,李東翔,佟玲. 中國新藥雜志. 2016(10)
[6]基于區(qū)域生長算法的CT序列圖像分割[J]. 潘家輝,朱玲利,鮑蘇蘇. 洛陽師范學院學報. 2015(05)
[7]Recovery mechanisms of somatosensory function in stroke patients: implications of brain imaging studies[J]. Sung Ho Jang. Neuroscience Bulletin. 2013(03)
[8]A Comparison of Brain Activity between Healthy Subjects and Stroke Patients on fMRI by Acupuncture Stimulation[J]. Seung-Yeon Cho,Mia Kim,Jong Joo Sun,Geon-Ho Jahng,Hengjun J Kim,Seong-Uk Park,Woo-Sang Jung,Chang-Nam Ko,Jung-Mi Park. Chinese Journal of Integrative Medicine. 2013(04)
[9]基于list-mode數(shù)據(jù)的PET斷層重建原理與實現(xiàn)[J]. 張斌,單保慈,贠明凱,趙書俊. 生物醫(yī)學工程學雜志. 2012(05)
[10]基于像素的形態(tài)學分析算法的研究進展[J]. 程傳力,趙書俊,聶彬彬,單保慈,校審. 中國醫(yī)學影像技術(shù). 2011(12)
本文編號:3581937
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