空腸彎曲菌Ⅵ型分泌系統(tǒng)結(jié)構(gòu)特征和菌株中分布
發(fā)布時(shí)間:2021-11-08 01:27
目的明確中國(guó)空腸彎曲菌Ⅵ型分泌系統(tǒng)基因簇的結(jié)構(gòu)特征及其在菌株中的分布。方法對(duì)中國(guó)不同來(lái)源空腸彎曲菌菌株進(jìn)行全基因組測(cè)序,并與數(shù)據(jù)庫(kù)不同來(lái)源空腸彎曲菌菌株基因組序列和VI型分泌系統(tǒng)基因簇做比較分析。結(jié)果 52株空腸彎曲菌經(jīng)基因組系統(tǒng)發(fā)育分析被分為了6個(gè)進(jìn)化分支,對(duì)應(yīng)不同來(lái)源的菌株。空腸彎曲菌的Ⅵ型分泌系統(tǒng)基因簇大小約14 kb,包含14個(gè)基因,其中hcp等9個(gè)主要基因與其他細(xì)菌T6SS相同基因的同源性較高,但仍具有空腸彎曲菌獨(dú)特的基因簇結(jié)構(gòu)。有36.5%(19/52)空腸彎曲菌菌株含有Ⅵ型分泌系統(tǒng)基因簇,主要為雞來(lái)源分支和混合來(lái)源分支中的雞來(lái)源菌株;有83.3%(10/12)中國(guó)的雞來(lái)源菌株攜帶Ⅵ型分泌系統(tǒng)基因簇。結(jié)論空腸彎曲菌的Ⅵ型分泌系統(tǒng)與雞來(lái)源菌株密切相關(guān)。
【文章來(lái)源】:中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2019,35(11)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
空腸彎曲菌基于基因組SNP的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
3種細(xì)菌T6SS基因簇結(jié)構(gòu)
T6SS基因簇在空腸彎曲菌菌株中的分布
本文編號(hào):3482726
【文章來(lái)源】:中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2019,35(11)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
空腸彎曲菌基于基因組SNP的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
3種細(xì)菌T6SS基因簇結(jié)構(gòu)
T6SS基因簇在空腸彎曲菌菌株中的分布
本文編號(hào):3482726
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