目的利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法研究高溫環(huán)境對(duì)德國小蠊基因表達(dá)的影響,以及這些基因的功能富集類別和參與代謝通路,進(jìn)而推測德國小蠊的高溫應(yīng)答分子機(jī)制。方法以25℃環(huán)境為對(duì)照,對(duì)40℃高溫處理2 h的德國小蠊成蟲進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,計(jì)算差異表達(dá)基因,利用Gene Ontology database基因功能富集數(shù)據(jù)庫和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）基因及基因組京都信息數(shù)據(jù)庫分析基因功能富集和代謝途徑。結(jié)果測序數(shù)據(jù)經(jīng)篩選后,得到93 725 712個(gè)讀序,計(jì)算生成高溫應(yīng)答上調(diào)表達(dá)基因524個(gè)、下調(diào)表達(dá)基因525個(gè)。高溫應(yīng)答基因功能富集到14個(gè)類別和30個(gè)KEGG代謝途徑,基因分類包括真菌防御反應(yīng)、脅迫應(yīng)答、苯丙氨酸4單加氧酶活性、L苯丙氨酸分解代謝、細(xì)胞外區(qū)、色氨酸5單加氧酶活性、芳香化酶活性、鐵離子結(jié)合、氨基酸結(jié)合、膜結(jié)合細(xì)胞器、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜、氧化還原酶活性、羧酸酯水解酶活性和信息素應(yīng)答等方面。結(jié)論德國小蠊可能從真菌防御反應(yīng)、脅迫應(yīng)答等幾個(gè)方面應(yīng)對(duì)高溫脅迫,為揭示德國小蠊高溫應(yīng)答和耐受分子機(jī)制提供基礎(chǔ)。 

【文章來源】：中國媒介生物學(xué)及控制雜志. 2020,31(01)

【文章頁數(shù)】：4 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試蟲飼養(yǎng)與處理
    1.2 RNA提取與測序
    1.3 測序數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
    2.1 測序與差異表達(dá)基因
    2.2 GO和KEGG數(shù)據(jù)分析
3 討論
    3.1 高溫引起德國小蠊的基因表達(dá)變化
    3.2 高溫應(yīng)答基因


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]沙蔥螢葉甲幼蟲對(duì)溫度脅迫響應(yīng)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D]. 單艷敏.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018



本文編號(hào)：3429141