cFDR方法鑒定與體重指數(shù)和冠心病關(guān)聯(lián)的遺傳變異位點(diǎn)
發(fā)布時間:2021-08-06 04:14
全基因組關(guān)聯(lián)研究(Genome-wide Association Studies,GWAS)已經(jīng)成功地鑒定出許多與表型和疾病關(guān)聯(lián)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(Single-nucleotide Polymorphisms,SNPs)。截至目前,在現(xiàn)有樣本量的情況下,GWAS鑒定出與表型和疾病關(guān)聯(lián)的變異位點(diǎn)僅能解釋很小部分的遺傳變異,不超過10%。條件錯誤發(fā)現(xiàn)率(conditional False Discovery Rate,c FDR)方法通過利用關(guān)聯(lián)表型或疾病的GWAS數(shù)據(jù),可以提高研究的統(tǒng)計效能,增加鑒定與表型和疾病關(guān)聯(lián)的SNPs的數(shù)量,而且不需要額外地擴(kuò)大GWAS的樣本含量。c FDR方法的原理是通過計算一組SNPs的期望錯誤發(fā)現(xiàn)率的上限值,即關(guān)聯(lián)表型或疾病的SNPs的關(guān)聯(lián)性檢驗p值均小于疾病的特異性閾值。而且,c FDR分析僅需要疾病的GWAS的匯總統(tǒng)計量數(shù)據(jù),因此優(yōu)于傳統(tǒng)的GWAS分析。目的通過對體重指數(shù)(Body Mass Index,BMI)和冠心。–oronary Artery Disease,CAD)的GWAS數(shù)據(jù)進(jìn)行二次挖掘和重分析,本研究運(yùn)用c FDR方法提高研究的統(tǒng)...
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
研究的技術(shù)路線
肥胖和CAD間的條件分層Q-Q圖
肥胖和CAD的條件曼哈頓圖
本文編號:3325047
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
研究的技術(shù)路線
肥胖和CAD間的條件分層Q-Q圖
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