耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的生物學(xué)信息預(yù)測(cè)
發(fā)布時(shí)間:2021-06-22 08:55
目的在線軟件分析耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的生物學(xué)信息,為防治金黃色葡萄球菌感染提供理論基礎(chǔ)。方法采用在線分析系統(tǒng)蛋白質(zhì)EXPASYP Protemic(http://www. espasy. org)中的Protparam(http://expasy.org/tools/protparam.html),分析耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的分子質(zhì)量、分子式,氨基酸數(shù)目、等電點(diǎn)、正負(fù)電荷殘基,預(yù)測(cè)該蛋白的穩(wěn)定性等理化性質(zhì);利用在線分析蛋白質(zhì)軟件Protscale(http://www.espasy.org/cgibin/protscale.p1)分析EsxA蛋白親(疏)水性;采用SOPMA軟件預(yù)測(cè)和分析耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的二、三級(jí)結(jié)構(gòu)。結(jié)果 EsxA蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)α螺旋(Hh)占26.15%(68個(gè)),延伸鏈(Ee)占32.69%(85個(gè)),無(wú)規(guī)則卷曲(Cc)占33.46%(87個(gè))。蛋白分子質(zhì)量為30 428.46 ku;理論pI值為8.18;氨基酸序列Ala占1.9%,Arg占1.9%,Val占3.5%?赡苁怯H水性蛋白;預(yù)測(cè)耐甲氧西林金黃色葡萄球菌E...
【文章來(lái)源】:中國(guó)校醫(yī). 2020,34(02)
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 基因信息
1.2 生物學(xué)信息預(yù)測(cè)
1.2.1 基因及蛋白序列
1.2.2 蛋白的理化性質(zhì)及親(疏)水性分析
1.2.3 蛋白的跨膜區(qū)、信號(hào)肽分析
1.2.4 蛋白的糖基化及磷酸化生物信息學(xué)分析
1.2.5 蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.2.6 蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)及建模
2 結(jié)果
2.1 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的氨基酸序列
2.2 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的理化性質(zhì)及親(疏)水性
2.3 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域與信號(hào)肽
2.4 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的糖基化和磷酸化分析
2.5 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)
2.6 預(yù)測(cè)MRSAEsxA蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]皮膚軟組織感染患者金黃色葡萄球菌感染狀況研究[J]. 萬(wàn)東芳,萬(wàn)永山,朱紅軍,王鳳娥,侯建明. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2019(01)
[2]血吸蟲絲氨酸/蘇氨酸-蛋白激酶RIO2的生物學(xué)信息預(yù)測(cè)[J]. 趙珍,阿孜爾古麗·阿布都克日木,屈艷琳,戴軍,丁劍冰,于濤. 寄生蟲病與感染性疾病. 2018(04)
[3]幽門螺桿菌CagA基因編碼蛋白的生物信息學(xué)分析[J]. 阿孜爾古麗·阿布都克日木,阿布都哈巴爾·阿布都克日木,劉玉梅,許海峰,孜拜旦·吐爾遜,熱比亞·努力,孜來(lái)古麗·米吉提,德力夏提·依米提,于濤. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2018(03)
[4]金黃色葡萄球菌IsdA蛋白B細(xì)胞線性抗原表位的預(yù)測(cè)與鑒定[J]. 白靚,成巖,曹瑞珍,張國(guó)文,張樹軍. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2016(04)
[5]金黃色葡萄球菌ClfA蛋白Th表位鑒定及其免疫原性分析(英文)[J]. 李揚(yáng),李志杰,李亞剛,葉軍鋒. 微生物學(xué)報(bào). 2013(09)
本文編號(hào):3242547
【文章來(lái)源】:中國(guó)校醫(yī). 2020,34(02)
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 基因信息
1.2 生物學(xué)信息預(yù)測(cè)
1.2.1 基因及蛋白序列
1.2.2 蛋白的理化性質(zhì)及親(疏)水性分析
1.2.3 蛋白的跨膜區(qū)、信號(hào)肽分析
1.2.4 蛋白的糖基化及磷酸化生物信息學(xué)分析
1.2.5 蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.2.6 蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)及建模
2 結(jié)果
2.1 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的氨基酸序列
2.2 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的理化性質(zhì)及親(疏)水性
2.3 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域與信號(hào)肽
2.4 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的糖基化和磷酸化分析
2.5 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌EsxA蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)
2.6 預(yù)測(cè)MRSAEsxA蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]皮膚軟組織感染患者金黃色葡萄球菌感染狀況研究[J]. 萬(wàn)東芳,萬(wàn)永山,朱紅軍,王鳳娥,侯建明. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2019(01)
[2]血吸蟲絲氨酸/蘇氨酸-蛋白激酶RIO2的生物學(xué)信息預(yù)測(cè)[J]. 趙珍,阿孜爾古麗·阿布都克日木,屈艷琳,戴軍,丁劍冰,于濤. 寄生蟲病與感染性疾病. 2018(04)
[3]幽門螺桿菌CagA基因編碼蛋白的生物信息學(xué)分析[J]. 阿孜爾古麗·阿布都克日木,阿布都哈巴爾·阿布都克日木,劉玉梅,許海峰,孜拜旦·吐爾遜,熱比亞·努力,孜來(lái)古麗·米吉提,德力夏提·依米提,于濤. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2018(03)
[4]金黃色葡萄球菌IsdA蛋白B細(xì)胞線性抗原表位的預(yù)測(cè)與鑒定[J]. 白靚,成巖,曹瑞珍,張國(guó)文,張樹軍. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2016(04)
[5]金黃色葡萄球菌ClfA蛋白Th表位鑒定及其免疫原性分析(英文)[J]. 李揚(yáng),李志杰,李亞剛,葉軍鋒. 微生物學(xué)報(bào). 2013(09)
本文編號(hào):3242547
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