發(fā)布時間：2020-12-07 14:31

　　目的采用微陣列技術(shù)分析加味腦泰方干預(yù)前后血管性癡呆（VD）模型大鼠海馬組織m RNA表達譜,以探究其治療VD的分子機制。方法采用雙側(cè)頸總動脈結(jié)扎術(shù)制作VD大鼠模型,給予加味腦泰方治療30 d,HE染色和水迷宮實驗評價治療效果,Agilent mRNA表達譜芯片獲取加味腦泰方干預(yù)前后VD模型大鼠海馬組織m RNA表達數(shù)據(jù),微陣列分析篩選顯著差異表達的基因,構(gòu)建蛋白與蛋白相互作用（PPI）網(wǎng)絡(luò),GO和Pathway富集分析差異基因主要參與的生物學過程和信號通路,利用免疫組化和實時熒光定量PCR（qRT-PCR）驗證芯片分析結(jié)果。結(jié)果 HE染色和水迷宮實驗顯示VD大鼠呈現(xiàn)腦缺血、海馬神經(jīng)細胞損傷、空間學習記憶能力下降,加味腦泰方可以部分逆轉(zhuǎn)該現(xiàn)象。微陣列技術(shù)分析篩選出加味腦泰方干預(yù)前后差異表達的基因469個,其中上調(diào)180個,下調(diào)289個,IL6、FGF2、TNF、IL1b等可能是其治療VD的主要藥效靶點,免疫組化和qRT-PCR驗證了該分析結(jié)果。GO和Pathway富集分析顯示,這些基因與炎癥反應(yīng)、凋亡過程等生物學過程密切相關(guān),主要參與了TNF信號通路、Toll樣受體信號通路、細胞凋亡途徑... 

【文章來源】：中草藥. 2019年24期 第6064-6072頁 北大核心

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

加味腦泰方對VD大鼠學習和記憶能力的影響

差異表達基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及功能分析

差異表達基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及功能分析結(jié)果見圖3。將469個差異表達的基因?qū)氲絊TRING數(shù)據(jù)庫獲取這些基因的PPI網(wǎng)絡(luò)（圖3-A），排除部分非編碼基因和lncRNA等未獲得蛋白相互作用信息外，共有174個基因編碼的蛋白之間存在351種相互作用關(guān)系。網(wǎng)絡(luò)中根據(jù)每個蛋白相互作用關(guān)系的多少來確定節(jié)點的大小和顏色深度，其中處于網(wǎng)絡(luò)中心擁有最多相互作用的蛋白為Il6(degree=32），其次為Fgf2(degree=17）和Tnf(degree=17）、Il1b(degree=15）。對PPI網(wǎng)絡(luò)中的基因進行GO和通路富集分析描述這些基因在疾病發(fā)生發(fā)展中參與的生物學過程。GO富集結(jié)果表明加味腦泰方干預(yù)后主要影響了急性炎癥反應(yīng)、衰老、JUN激酶活性的正調(diào)控、凋亡過程、血管生成、缺氧反應(yīng)、細胞對神經(jīng)生長因子刺激的反應(yīng)等生物學過程（圖3-C），通路富集分析顯示這些基因主要參與了TNF信號通路、Toll樣受體信號通路、c GMP-PKG信號通路、細胞凋亡途徑、PI3K-Akt信號通路和MAPK信號通路（圖3-D）。同時利用STRING數(shù)據(jù)庫的kmeans＿clusters功能對網(wǎng)絡(luò)進行拓撲模塊（Cluster）分析，獲得2個重要的拓撲模塊（圖3-B）。其中Cluster1處于PPI網(wǎng)絡(luò)中心，可能是加味腦泰方治療VD大鼠的重要藥效途徑，主要與凋亡途徑、調(diào)節(jié)炎癥和免疫信號通路（NOD-like receptor signaling pathway、Toll-like receptor signaling pathway、TNF signaling pathway）密切相關(guān)，而Cluster2主要與核糖體、核蛋白體轉(zhuǎn)運及細胞對神經(jīng)生長因子刺激的反應(yīng)有關(guān)。圖3 差異表達基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及功能分析

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]腦泰方湯劑和膠囊劑中化學成分的定量研究[D]. 陳鎮(zhèn).湖南中醫(yī)藥大學 2005



本文編號：2903424