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海南省海口地區(qū)伊蚊黃病毒的發(fā)現(xiàn)與鑒定

發(fā)布時(shí)間:2020-11-19 05:41
   目的了解海南省?诘貐^(qū)白紋伊蚊攜帶伊蚊黃病毒情況。方法 2019年6-10月,用人誘法在海口采集白紋伊蚊,設(shè)計(jì)特異性引物擴(kuò)增伊蚊黃病毒部分基因片段并測(cè)序;用Mega7.0軟件對(duì)所得病毒核酸序列和GenBank中已知伊蚊黃病毒參考序列進(jìn)行遺傳進(jìn)化關(guān)系分析。結(jié)果共采集165只白紋伊蚊。用優(yōu)化確定1對(duì)特異性引物從1只白紋伊蚊中擴(kuò)增到伊蚊黃病毒HK1,白紋伊蚊帶毒率為0.6%。系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)伊蚊黃病毒HK1序列與分離自日本東京的病毒株(NC012932.1)遺傳關(guān)系最近,相似度為72.51%,但小于84.0%。根據(jù)黃病毒屬定義新種的標(biāo)準(zhǔn),這株伊蚊黃病毒(HK1)為黃病毒屬的新種。結(jié)論在?诘貐^(qū)首次發(fā)現(xiàn)白紋伊蚊攜帶伊蚊黃病毒,應(yīng)增加樣本量持續(xù)開展蚊蟲攜帶病原體監(jiān)測(cè)。
【部分圖文】:

序列,伊蚊,?


2019年6、10月在?趦蓚(gè)地點(diǎn)共采集165只白紋伊蚊(表2)。利用優(yōu)化設(shè)計(jì)的引物篩檢白紋伊蚊,從165只白紋伊蚊中檢測(cè)到1只為陽(yáng)性(圖1),命名為Aedes flavivirus-HK1。海口白紋伊蚊的帶毒率為0.6%(1/165)。將擴(kuò)增的目的條帶測(cè)序,擴(kuò)增片序列長(zhǎng)1 050 bp。2.2 系統(tǒng)進(jìn)化分析

核酸序列,病毒,伊蚊,核酸序列


系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示(圖2),該病毒E基因系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)Aedes flavivirusHK1與分離自日本東京的病毒株(NC012932.1)遺傳關(guān)系最近,相似度為72.51%,但亦小于84.0%,因此,根據(jù)黃病毒屬定義新種的標(biāo)準(zhǔn)[10],Aedes flavivirus-HK1為黃病毒屬的新種。盡管Aedes flavivirusHK1和目前已檢測(cè)的其他伊蚊黃病毒同源性在71.82%~72.51%之間,但遺傳進(jìn)化分析顯示它們位于同一分支,都是經(jīng)典昆蟲相關(guān)黃病毒簇中的伊蚊黃病毒。3 討論
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本文編號(hào):2889781

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