白假絲酵母菌毒力相關(guān)的RAPD條帶的克隆及其生物信息學(xué)分析
【部分圖文】:
采用隨機(jī)引物P2對5株菌株進(jìn)行RAPD擴(kuò)增。根據(jù)前期研究結(jié)果,450 bp與磷脂酶、蛋白酶具有較高的相關(guān)性。該試驗(yàn)中,菌株1、菌株5中擴(kuò)增出450 bp條帶。2.2 切膠回收
經(jīng)切膠回收的450 bp DNA與T載體連接后,經(jīng)轉(zhuǎn)化、涂板,挑取白色菌落,進(jìn)行菌落PCR鑒定。其中菌株5的5-3、5-4為陽性菌落。挑取菌落5-3、5-4,經(jīng)搖菌后送測序。2.4 測序結(jié)果
將上述結(jié)果在NCBI網(wǎng)站上使用Blast功能(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)進(jìn)行比對。該結(jié)果與白假絲酵母菌SC5314的Abp1p(ABP1)蛋白編碼基因相似度最高(98%),見圖5。因此,可以確定,該基因?yàn)榘准俳z酵母菌ABP1的編碼基因。圖5 測序比對結(jié)果圖
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本文編號:2888949
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