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MiR-526a參與RLRs介導先天性免疫應(yīng)答的分子機制研究

發(fā)布時間:2020-11-11 13:05
   腸道病毒71型(Enterovirus,EV71)包含單股正鏈RNA基因組,屬于小RNA病毒科(picornavirus family)腸道病毒屬成員,其感染嬰幼兒后能引起手足口。╤and-foot-mouth disease,HFMD)。EV71基因組長約7.5Kb (kilobase, Kb),僅由一個開放閱讀框構(gòu)成,編碼一個多聚蛋白前體,這個多聚蛋白前體能裂解成四個結(jié)構(gòu)蛋白(VP1、VP2、VP3和VP4),七個非結(jié)構(gòu)蛋白(2A、2B、2C和3A、3B、3C和3D)。雖然有研究表明IFN-I(type I interferon,IFN-I)能保護細胞抵抗EV71的感染,然而EV71并不誘導IFN-I的產(chǎn)生。最近研究發(fā)現(xiàn)EV71能夠通過阻斷RIG-I、干擾素調(diào)節(jié)因子7(interferon regulated factor7,IRF7)以及I型干擾素受體(IFN-I receptor, IFNAR)的表達來抑制干擾素誘導基因(Interferon-stimulated gene, ISG)的激活。 宿主通過模式識別受體(pattern recognition receptor,PRR)和病原微生物的病原相關(guān)分子模式(pathogen-associated molecular pattern,PAMP)的相互作用來識別病毒和入侵微生物。PRR包括了膜受體和胞質(zhì)受體。膜受體為Toll樣受體(Toll-like receptors, TLRs),而胞質(zhì)受體包括NOD樣受體(NOD-like receptor,NLRs)以及RLR樣受體((RIG-I-like receptor,RLRs)。RLR樣受體包括RIG-I(retinoid acid-inducible gene I, RIG-I)和MDA-5(melanomadifferentiation-associated gene5, MDA-5)。RIG-I和MDA-5都包含CARD結(jié)構(gòu)域(caspase recruitment domains),結(jié)合非帽化的RNA后與同樣含有CARD結(jié)構(gòu)域的線粒體抗病毒蛋白(mitochondrial antiviral signaling,MAVS)結(jié)合,導致MAVS和IKK激酶(I B kinase)結(jié)合,然后以此為平臺募集下游不同的信號分子組成不同的調(diào)控復(fù)合物,最終激活核因子B(nuclear factor-kappaB,NF-B)和干擾素調(diào)節(jié)因子3(interferon regulated factor,IRF3),進而起始-干擾素(interferon-β,IFN-)的表達及IFN介導的抗病毒免疫。RIG-I信號通路受泛素化、去泛素化、磷酸化以及去磷酸化的調(diào)控。前期報道腫瘤抑制因子圓柱瘤基因(Cylindromatosis,CYLD)可以通過調(diào)控RIG-I的泛素化參與宿主的先天性免疫應(yīng)答信號傳導途徑。在樹突狀細胞(Dendritic cells, DC)中缺失CYLD會誘導持續(xù)泛素化RIG-I,并增強TANK結(jié)合激酶1(TANK-binding kinase1,TBK1)和IκB激酶(The IκB kinase,IKK)的活性。除了RIG-I, CYLD同樣能去除核因子Kappa B基本調(diào)節(jié)因子(Nuclear factor-Kappa B essential modulator,NEMO)、IKK、腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子2(TNF receptor-associated factor2,TRAF2)以及B細胞淋巴瘤蛋白3(B-cell CLL/lymphoma3,Bcl-3)的K63位泛素化來負調(diào)控NF-B和c-Jun N末端激酶(Jun N-terminal kinase,JNK)信號通路。這些發(fā)現(xiàn)確定了CYLD成為抗病毒先天性免疫應(yīng)答的關(guān)鍵調(diào)控分子。 MicroRNA(miRNA)是一類高度保守的非編碼小RNA分子,平均長度為22nt(nucleotide,nt)。miRNA通過與靶基因的3’UTR(untranslational region,UTR)結(jié)合來抑制基因表達。miRNA參與調(diào)節(jié)許多生命進程,發(fā)揮重要的作用。近來報道了在單核細胞核巨噬細胞中miRNA參與調(diào)控先天性免疫應(yīng)答,如miR-146a靶向白介素1受體相關(guān)激酶1(IL-1R associated kinase1,IRAK1)和腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子6(TNF receptor associated factor6,TRAF6)來負調(diào)控RIG-I樣受體(RIG-I-like receptor,RLR)信號通路。然而到目前為止尚未發(fā)現(xiàn)關(guān)于EV71通過miRNA調(diào)控RIG-I信號通路的報道。本研究發(fā)現(xiàn): 1. miR-526a的表達受RNA病毒誘導激活的IRF3/7轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控:利用熒光定量PCR(quantitative polymerase chain reactin,q-PCR)的方法,發(fā)現(xiàn)RNA病毒感染可以顯著促進細胞內(nèi)miR-526a的表達;通過RNA干涉手段,發(fā)現(xiàn)IRF3、7敲低細胞中水泡性口炎病毒(vesicular stomatitis virus,VSV)誘導的miR-526a上調(diào)被顯著抑制,以上結(jié)果提示我們miR-526a的表達受RNA病毒誘導激活的IRF3/7轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控。 2. miR-526a促進RIG-I信號通路的激活:通過合成miR-526a模擬物以及抑制劑,利用IFN-、NF-B以及IRF3報告基因活性檢測方法,發(fā)現(xiàn)miR-526a模擬物可以顯著增強RIG-I信號通路的激活,這種激活活性可以被miR-526a抑制劑阻斷;利用q-PCR以及AlphaLISA技術(shù),發(fā)現(xiàn)miR-526a能夠促進病毒誘導的IFN-的轉(zhuǎn)錄和分泌;利用q-PCR方法,發(fā)現(xiàn)miR-526a的過表達能夠激活I(lǐng)FN-的下游誘導基因ISG56、ISG54、白介素-8(interleukin-8,IL-8)以及趨化因子配體-2(Chemokine (C-X-C motif) ligand2,CXCL-2)的表達,以上結(jié)果顯示miR-526a是參與調(diào)控RIG-I信號通路的正調(diào)控因子。 3.miR-526a抑制VSV和NDV病毒的復(fù)制:用免疫印跡檢測發(fā)現(xiàn)miR-526a模擬物能夠抑制VSV病毒感染后VSV-G蛋白的表達;以新城疫病毒NDV-GFP(Newcastle Disease Virus,NDV)病毒感染細胞為模型,利用熒光顯微鏡以及流式細胞術(shù)檢測方法發(fā)現(xiàn)miR-526a模擬物可以顯著抑制NDV病毒在細胞內(nèi)的復(fù)制,以上結(jié)果提示我們miR-526a可以抑制RNA病毒復(fù)制。 4.miR-526a通過靶向CYLD激活RIG-I信號通路:通過生物信息學軟件TargetScan等預(yù)測,發(fā)現(xiàn)CYLD是miR-526a潛在的靶點。檢測帶有不同位置的CYLD3’UTR熒光素酶報告基因的活性發(fā)現(xiàn)CYLD存在miR-526a作用位點;利用q-PCR以及免疫印跡方法,發(fā)現(xiàn)miR-526a模擬物能夠下調(diào)CYLD的轉(zhuǎn)錄水平以及蛋白水平。利用細胞泛素化實驗,發(fā)現(xiàn)miR-526a模擬物可以增強病毒誘導的RIG-I K63位泛素化水平,而miR-526a抑制劑可以抑制病毒誘導的RIG-I的泛素化;利用免疫印跡實驗,發(fā)現(xiàn)miR-526a模擬物可以增強病毒誘導的IKK/、I B及IRF3的磷酸化,以上實驗說明miR-526a通過靶向CYLD增強RIG-I的K63位泛素化修飾,進而激活RIG-I信號通路。 5. EV71病毒利用3C蛋白酶靶向miR-526a抑制RIG-I信號通路的激活:利用q-PCR以及免疫印跡技術(shù),發(fā)現(xiàn)EV71病毒感染后下調(diào)miR-526a的表達、IRF7的激活以及IFN-的產(chǎn)生,以上表型均由EV71的3C蛋白酶介導;通過免疫印跡技術(shù),發(fā)現(xiàn)miR-526a模擬物及CYLD的小干擾RNA(small interference RNA,siRNA)能夠抑制EV71病毒的復(fù)制以及EV71VP1蛋白的表達,以上結(jié)果說明EV71通過靶向miR-526a阻斷RIG-I信號通路的激活。 綜上所述,我們發(fā)現(xiàn)病毒感染巨噬細胞后能顯著上調(diào)miR-526a,并依賴IRF3/7的激活。而miR-526a通過靶向CYLD,去除RIG-I的K63位泛素化正調(diào)控VSV介導的IRF3和NF-B的激活。進一步發(fā)現(xiàn)了EV71的3C蛋白酶能夠抑制miR-526a的表達,過表達miR-526a能夠抑制EV71的復(fù)制。因此本研究第一次發(fā)現(xiàn)了miR-526a是RIG-I信號通路的一個正調(diào)控因子,并且EV71通過抑制miR-526a來抑制RIG-I介導的IFN-I產(chǎn)生。
【學位單位】:中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院
【學位級別】:博士
【學位年份】:2014
【中圖分類】:R392
【文章目錄】:
目錄
縮略詞表
摘要
Abstract
前言
    一、EV71 逃逸宿主天然免疫與其致病性
    二、RLR 信號通路與抗病毒感染
    三、microRNA 參與先天性免疫應(yīng)答
    四、本課題研究的科學問題
材料與方法
    1 材料
        1.1 細胞株
        1.2 菌毒株、質(zhì)粒與 RNA 合成物
        1.3 常用試劑盒
        1.4 分子生物學及細胞生物學試劑
        1.5 抗體
        1.6 其它化學試劑
        1.7 主要實驗儀器
    2 實驗方法
        2.1 病毒擴增
        2.2 病毒感染
        2.3 細胞培養(yǎng)
        2.4 RNA 提取
        2.5 反轉(zhuǎn)錄
        2.6 熒光定量 PCR
        2.7 CYLD 3’UTR luciferase 質(zhì)粒的構(gòu)建
        2.8 luciferase reporter 檢測
        2.9 免疫沉淀
        3.0 免疫印跡
        3.1 流式細胞術(shù)檢測
        3.2 AlphaLISA 檢測 IFN- 水平
        3.3 統(tǒng)計學分析
結(jié)果
    1 miR-526a 的表達受 RNA 病毒誘導激活的 IRF3/7 轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控
    2 miR-526a 促進 RIG-I 信號通路的激活
    3 miR-526a 抑制 VSV、NDV 及 EV71 病毒的復(fù)制
    4 miR-526a 通過靶向 CYLD 激活 RIG-I 信號通路
討論
結(jié)論
參考文獻
文獻綜述
    摘要
    Abstract
    參考文獻
代表性論文
個人簡歷
致謝

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本文編號:2879217

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