寧夏回族人群15個(gè)STR基因座的遺傳多態(tài)性及應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2020-09-11 09:07
寧夏是少數(shù)民族自治區(qū),通過(guò)對(duì)寧夏地區(qū)回族群體進(jìn)行遺傳多樣性的研究,能使我國(guó)這一多民族國(guó)家的民族群體研究資料得到一定程度的豐富,同時(shí)對(duì)民族群體間遺傳結(jié)構(gòu)的探究和寧夏人群起源遷徙路徑的探尋有著極為重要的價(jià)值。短串聯(lián)重復(fù)序列(STR),作為一種遺傳穩(wěn)定性較強(qiáng)、多態(tài)性較高的DNA遺傳標(biāo)記,擴(kuò)增片段短,實(shí)驗(yàn)效率高,可進(jìn)行多位點(diǎn)復(fù)合擴(kuò)增,適用于微量檢材DNA的檢驗(yàn)分析,是進(jìn)行親子鑒定、群體遺傳學(xué)結(jié)構(gòu)研究及個(gè)體識(shí)別的重要手段。本論文通過(guò)對(duì)寧夏回族和寧夏漢族人群15個(gè)STR基因座的遺傳多態(tài)性進(jìn)行調(diào)查,應(yīng)用Identifiler Plus試劑盒檢測(cè)15個(gè)STR基因座(CSF1PO、D13S317、D16S539、D18S51、D19S433、D21S11、D2S1338、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、FGA、TH01、TPOX、vWA)的基因分型,使用Modified-Powerstates統(tǒng)計(jì)軟件計(jì)算各等位基因分布頻率等法醫(yī)遺傳學(xué)數(shù)據(jù),根據(jù)等位基因頻率計(jì)算結(jié)果,應(yīng)用POPTREE2軟件計(jì)算不同人群相互間的遺傳距離,使用鄰接法(Neighbor-Joining method,NJ)繪制不同民族人群的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。最后一章綜述了 15個(gè)STR基因座的法醫(yī)學(xué)應(yīng)用及當(dāng)前DNA數(shù)據(jù)庫(kù)的情況,為后來(lái)回族基因座的遺傳多態(tài)性研究工作者提供理論和實(shí)際操作上的幫助。同時(shí)為不同人群的基因組學(xué)探討提供一定的遺傳學(xué)資料。論文的主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果歸納如下:1.通過(guò)對(duì)寧夏五個(gè)地區(qū)回族人群血樣的檢測(cè)(大武口區(qū)、興慶區(qū)、利通區(qū)、同心縣、海原縣),每地區(qū)200例人口,獲取了 15個(gè)基因座的遺傳多態(tài)性資料,其中:大武口回族共檢出178個(gè)等位基因、463種基因型,興慶區(qū)回族共檢出143個(gè)等位基因、427種基因型,利通區(qū)回族共檢出151個(gè)等位基因、435種基因型,同心縣回族共檢出136個(gè)等位基因、467種基因型,海原縣回族共檢出151個(gè)等位基因、450種基因型。各基因型頻率分布均符合哈迪-溫伯格定律(Hardy-Weinberg)。分別統(tǒng)計(jì)出了各地回族群體不同基因座的H、Pm、DP、PIC及PE值。TDP代表累計(jì)個(gè)體識(shí)別率,CEP代表累計(jì)非父排除率,其中:大武口的TDP為0.999 999 999 999 999 98569、CEP 為 0.999 999665,興慶區(qū)的 TDP 為0.999 999 999 999 999 98915、CEP 為 0.999 997735,利通區(qū)的 TDP 為0.999 999 999 999 999 97447、CEP 為 0.999 999204,同心縣的 TDP 為0.999 999 999 999 999 98323、CEP 為 0.999 998017,海原縣的 TDP 為0.999 999 999 999 999 98870、CEP 為 0.999 997070,數(shù)據(jù)結(jié)果顯示,論文中這15個(gè)STR基因座的鑒別能力均較好。研究結(jié)果提示,在15個(gè)STR 位點(diǎn)中,除CSF1PO、TH01、D5S818、TPOX、D3S1358 5 個(gè)位點(diǎn)外,其余10個(gè)位點(diǎn)在五個(gè)地區(qū)回族群體中的遺傳多態(tài)性均較高。從遺傳距離上看,興慶區(qū)與利通區(qū)回族群體間的遺傳距離最近(0.007),大武口區(qū)與同心縣回族群體間的遺傳距離最遠(yuǎn)(0.015)。通過(guò)繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),結(jié)果顯示大武口與興慶區(qū)回族群體首先聚成一支,再與利通區(qū)回族群體聚為一支,同心縣與海原縣回族群體聚成一支,最終匯合在一起。提示在五個(gè)地區(qū)回族群體中,同心縣和海原縣回族群體來(lái)源于一支,大武口和興慶區(qū)回族群體來(lái)源于一支。2.通過(guò)對(duì)寧夏回族人群和漢族人群血樣的檢測(cè),每個(gè)民族598例人口,其中寧夏回族檢出194個(gè)等位基因、615種基因型,寧夏漢族檢出180個(gè)等位基因、588種基因型。15個(gè)STR基因座的基因頻率分布在0.001~0.524之間(寧夏回族),0.001·0.523之間(寧夏漢族),各基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律。寧夏回族TDP為0.999999 999 999 999 99647、寧夏漢族 TDP 為 0.999 999 999 999 999 96947;寧夏回族CEP為0.999 998244、寧夏漢族CEP為0.999 997664。研究結(jié)果提示,在15個(gè)STR位點(diǎn)中,除CSF1PO、TH01、D3S1358、TPOX 4個(gè)位點(diǎn)外,寧夏回族人群和寧夏漢族人群中的其余11個(gè)位點(diǎn)的遺傳多態(tài)性均較高。運(yùn)用軟件計(jì)算出寧夏回族、寧夏漢族、東北蒙古族、甘肅蒙古族、青海蒙古族、內(nèi)蒙蒙古族、外蒙蒙古族七個(gè)群體間的遺傳距離。寧夏回族與寧夏漢族之間、內(nèi)蒙蒙古族與外蒙蒙古族人群間的遺傳距離最近(0.014),甘肅蒙古族與東北蒙古族人群間的遺傳距離最遠(yuǎn)(0.302)。進(jìn)一步繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),結(jié)果顯示寧夏回族與寧夏漢族群體首先聚成一支,再與內(nèi)蒙蒙古族群體聚為一支,青海蒙古族與東北蒙古族聚為一支,與寧夏和內(nèi)蒙匯合在一起,再與外蒙古、甘肅蒙古族最終匯合。提示寧夏與內(nèi)蒙蒙古族、外蒙蒙古族、青海蒙古族群體間的關(guān)系較近,與東北蒙古族、甘肅蒙古族的關(guān)系較遠(yuǎn)。3.計(jì)算寧夏回族與國(guó)內(nèi)其他7個(gè)地區(qū)回族人口間的遺傳距離(甘肅回族、甘肅臨夏回族、甘肅平?jīng)龌刈、廣西回族、河北滄州回族、遼寧回族、青海回族),同時(shí)繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),結(jié)果提示:寧夏回族與甘肅臨夏回族、河北滄州回族、遼寧回族之間的親緣關(guān)系較為密切(0.005、0.006、0.007),其次甘肅臨夏回族與河北滄州回族、遼寧回族的親緣關(guān)系較為密切(0.006),河北滄州回族與遼寧回族的親緣關(guān)系也較近(0.007),寧夏回族與甘肅回族的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(0.127)。聚類時(shí)七個(gè)地區(qū)的回族聚集在一起,與甘肅回族最終匯合。4.計(jì)算寧夏回族、寧夏漢族與國(guó)內(nèi)15個(gè)其他民族的遺傳距離(東鄉(xiāng)族、撒拉族、哈薩克族、維吾爾族、廣東漢族、河南漢族、裕固族、壯族、彝族、白族、佤族、傣族、哈尼族、黎族),繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),結(jié)果提示:寧夏回族與寧夏漢族、東鄉(xiāng)族、撒拉族之間的親緣關(guān)系較為密切(0.005、0.009、0.008),其次寧夏漢族與撒拉族、廣東漢族的親緣關(guān)系較為密切(0.008、0.008),東鄉(xiāng)族與撒拉族的親緣關(guān)系也較近(0.011),廣東漢族與彝族、哈尼族的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(0.012、0.012),彝族與哈尼族的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(0.013)。聚類時(shí)東鄉(xiāng)族與維吾爾族聚為一支,再與寧夏回族聚為一支,裕固族與藏族聚為一支,再與撒拉族聚為一支,然后與彝族聚類,兩支聚集在一起,與寧夏漢族聚集,河南漢族與哈薩克聚后與白族聚為一支,兩支聚合后,與佤族、哈尼族聚合,壯族、傣族和黎族聚為一支,最終十六個(gè)民族聚集在一起,與廣東漢族最終匯合。5.計(jì)算寧夏回族與國(guó)外11個(gè)地區(qū)不同人群間的遺傳距離(泰國(guó)、日本、白俄羅斯、巴勒斯坦、馬來(lái)西亞、韓國(guó)、印度、澳大利亞、非洲、馬耳他、波美拉尼亞),繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),結(jié)果提示:寧夏回族與泰國(guó)、日本、韓國(guó)之間的親緣關(guān)系較為密切(0.013、0.011、0.013),與印度關(guān)系最遠(yuǎn)(0.127),泰國(guó)與日本、馬來(lái)西亞、韓國(guó)關(guān)系較為密切(0.014、0.022、0.020),日本與韓國(guó)親緣關(guān)系較近(0.012),巴勒斯坦與澳大利亞關(guān)系較近(0.022)。聚類時(shí)寧夏回族與韓國(guó)聚為一支,再與日本相聚,泰國(guó)與馬來(lái)西亞聚為一支,再與寧夏回族、韓國(guó)、日本相聚;白俄羅斯與波美拉尼亞聚類,再與澳大利亞聚集,與馬耳他聚集,與巴勒斯坦聚集,最后與非洲聚為一支;兩支聚合后,與印度最終匯合。6.地理隔離因素大于地理距離的影響;中國(guó)南北民族群體之間具有顯著的遺傳差異;全球不同州人群間具有顯著的遺傳差異;宗教信仰影響民族間的基因交流;相同語(yǔ)系民族間的遺傳關(guān)系較近;地理的分布和歷史資料呈現(xiàn)出的關(guān)系與民族群體間的遺傳關(guān)系吻合;中國(guó)人類起源于非洲的問(wèn)題得到印證。
【學(xué)位單位】:陜西師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R394
【部分圖文】:
簡(jiǎn)式: ̄|逡逑圖2邋核苷酸分子的化學(xué)組成成分示意圖111逡逑Fig.2邋Schematic邋diagram邋of邋the邋chemical邋composition邋of邋nucleotide邋molecules逡逑DNA邐基IS邐基?邐基因{遺傳因子}是具有il傳效應(yīng)的DNA片段逡逑?白
本文編號(hào):2816485
【學(xué)位單位】:陜西師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R394
【部分圖文】:
簡(jiǎn)式: ̄|逡逑圖2邋核苷酸分子的化學(xué)組成成分示意圖111逡逑Fig.2邋Schematic邋diagram邋of邋the邋chemical邋composition邋of邋nucleotide邋molecules逡逑DNA邐基IS邐基?邐基因{遺傳因子}是具有il傳效應(yīng)的DNA片段逡逑?白
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