寧夏是少數(shù)民族自治區(qū),通過對寧夏地區(qū)回族群體進行遺傳多樣性的研究,能使我國這一多民族國家的民族群體研究資料得到一定程度的豐富,同時對民族群體間遺傳結構的探究和寧夏人群起源遷徙路徑的探尋有著極為重要的價值。短串聯(lián)重復序列(STR),作為一種遺傳穩(wěn)定性較強、多態(tài)性較高的DNA遺傳標記,擴增片段短,實驗效率高,可進行多位點復合擴增,適用于微量檢材DNA的檢驗分析,是進行親子鑒定、群體遺傳學結構研究及個體識別的重要手段。本論文通過對寧夏回族和寧夏漢族人群15個STR基因座的遺傳多態(tài)性進行調查,應用Identifiler Plus試劑盒檢測15個STR基因座(CSF1PO、D13S317、D16S539、D18S51、D19S433、D21S11、D2S1338、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、FGA、TH01、TPOX、vWA)的基因分型,使用Modified-Powerstates統(tǒng)計軟件計算各等位基因分布頻率等法醫(yī)遺傳學數(shù)據(jù),根據(jù)等位基因頻率計算結果,應用POPTREE2軟件計算不同人群相互間的遺傳距離,使用鄰接法(Neighbor-Joining method,NJ)繪制不同民族人群的系統(tǒng)進化樹。最后一章綜述了 15個STR基因座的法醫(yī)學應用及當前DNA數(shù)據(jù)庫的情況,為后來回族基因座的遺傳多態(tài)性研究工作者提供理論和實際操作上的幫助。同時為不同人群的基因組學探討提供一定的遺傳學資料。論文的主要實驗結果歸納如下:1.通過對寧夏五個地區(qū)回族人群血樣的檢測(大武口區(qū)、興慶區(qū)、利通區(qū)、同心縣、海原縣),每地區(qū)200例人口,獲取了 15個基因座的遺傳多態(tài)性資料,其中:大武口回族共檢出178個等位基因、463種基因型,興慶區(qū)回族共檢出143個等位基因、427種基因型,利通區(qū)回族共檢出151個等位基因、435種基因型,同心縣回族共檢出136個等位基因、467種基因型,海原縣回族共檢出151個等位基因、450種基因型。各基因型頻率分布均符合哈迪-溫伯格定律(Hardy-Weinberg)。分別統(tǒng)計出了各地回族群體不同基因座的H、Pm、DP、PIC及PE值。TDP代表累計個體識別率,CEP代表累計非父排除率,其中:大武口的TDP為0.999 999 999 999 999 98569、CEP 為 0.999 999665,興慶區(qū)的 TDP 為0.999 999 999 999 999 98915、CEP 為 0.999 997735,利通區(qū)的 TDP 為0.999 999 999 999 999 97447、CEP 為 0.999 999204,同心縣的 TDP 為0.999 999 999 999 999 98323、CEP 為 0.999 998017,海原縣的 TDP 為0.999 999 999 999 999 98870、CEP 為 0.999 997070,數(shù)據(jù)結果顯示,論文中這15個STR基因座的鑒別能力均較好。研究結果提示,在15個STR 位點中,除CSF1PO、TH01、D5S818、TPOX、D3S1358 5 個位點外,其余10個位點在五個地區(qū)回族群體中的遺傳多態(tài)性均較高。從遺傳距離上看,興慶區(qū)與利通區(qū)回族群體間的遺傳距離最近(0.007),大武口區(qū)與同心縣回族群體間的遺傳距離最遠(0.015)。通過繪制系統(tǒng)進化樹,結果顯示大武口與興慶區(qū)回族群體首先聚成一支,再與利通區(qū)回族群體聚為一支,同心縣與海原縣回族群體聚成一支,最終匯合在一起。提示在五個地區(qū)回族群體中,同心縣和海原縣回族群體來源于一支,大武口和興慶區(qū)回族群體來源于一支。2.通過對寧夏回族人群和漢族人群血樣的檢測,每個民族598例人口,其中寧夏回族檢出194個等位基因、615種基因型,寧夏漢族檢出180個等位基因、588種基因型。15個STR基因座的基因頻率分布在0.001～0.524之間(寧夏回族),0.001·0.523之間(寧夏漢族),各基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律。寧夏回族TDP為0.999999 999 999 999 99647、寧夏漢族 TDP 為 0.999 999 999 999 999 96947;寧夏回族CEP為0.999 998244、寧夏漢族CEP為0.999 997664。研究結果提示,在15個STR位點中,除CSF1PO、TH01、D3S1358、TPOX 4個位點外,寧夏回族人群和寧夏漢族人群中的其余11個位點的遺傳多態(tài)性均較高。運用軟件計算出寧夏回族、寧夏漢族、東北蒙古族、甘肅蒙古族、青海蒙古族、內蒙蒙古族、外蒙蒙古族七個群體間的遺傳距離。寧夏回族與寧夏漢族之間、內蒙蒙古族與外蒙蒙古族人群間的遺傳距離最近(0.014),甘肅蒙古族與東北蒙古族人群間的遺傳距離最遠(0.302)。進一步繪制系統(tǒng)進化樹,結果顯示寧夏回族與寧夏漢族群體首先聚成一支,再與內蒙蒙古族群體聚為一支,青海蒙古族與東北蒙古族聚為一支,與寧夏和內蒙匯合在一起,再與外蒙古、甘肅蒙古族最終匯合。提示寧夏與內蒙蒙古族、外蒙蒙古族、青海蒙古族群體間的關系較近,與東北蒙古族、甘肅蒙古族的關系較遠。3.計算寧夏回族與國內其他7個地區(qū)回族人口間的遺傳距離(甘肅回族、甘肅臨夏回族、甘肅平?jīng)龌刈�、廣西回族、河北滄州回族、遼寧回族、青�；刈�),同時繪制系統(tǒng)進化樹,結果提示:寧夏回族與甘肅臨夏回族、河北滄州回族、遼寧回族之間的親緣關系較為密切(0.005、0.006、0.007),其次甘肅臨夏回族與河北滄州回族、遼寧回族的親緣關系較為密切(0.006),河北滄州回族與遼寧回族的親緣關系也較近(0.007),寧夏回族與甘肅回族的親緣關系較遠(0.127)。聚類時七個地區(qū)的回族聚集在一起,與甘肅回族最終匯合。4.計算寧夏回族、寧夏漢族與國內15個其他民族的遺傳距離(東鄉(xiāng)族、撒拉族、哈薩克族、維吾爾族、廣東漢族、河南漢族、裕固族、壯族、彝族、白族、佤族、傣族、哈尼族、黎族),繪制系統(tǒng)進化樹,結果提示:寧夏回族與寧夏漢族、東鄉(xiāng)族、撒拉族之間的親緣關系較為密切(0.005、0.009、0.008),其次寧夏漢族與撒拉族、廣東漢族的親緣關系較為密切(0.008、0.008),東鄉(xiāng)族與撒拉族的親緣關系也較近(0.011),廣東漢族與彝族、哈尼族的親緣關系較遠(0.012、0.012),彝族與哈尼族的親緣關系較遠(0.013)。聚類時東鄉(xiāng)族與維吾爾族聚為一支,再與寧夏回族聚為一支,裕固族與藏族聚為一支,再與撒拉族聚為一支,然后與彝族聚類,兩支聚集在一起,與寧夏漢族聚集,河南漢族與哈薩克聚后與白族聚為一支,兩支聚合后,與佤族、哈尼族聚合,壯族、傣族和黎族聚為一支,最終十六個民族聚集在一起,與廣東漢族最終匯合。5.計算寧夏回族與國外11個地區(qū)不同人群間的遺傳距離(泰國、日本、白俄羅斯、巴勒斯坦、馬來西亞、韓國、印度、澳大利亞、非洲、馬耳他、波美拉尼亞),繪制系統(tǒng)進化樹,結果提示:寧夏回族與泰國、日本、韓國之間的親緣關系較為密切(0.013、0.011、0.013),與印度關系最遠(0.127),泰國與日本、馬來西亞、韓國關系較為密切(0.014、0.022、0.020),日本與韓國親緣關系較近(0.012),巴勒斯坦與澳大利亞關系較近(0.022)。聚類時寧夏回族與韓國聚為一支,再與日本相聚,泰國與馬來西亞聚為一支,再與寧夏回族、韓國、日本相聚;白俄羅斯與波美拉尼亞聚類,再與澳大利亞聚集,與馬耳他聚集,與巴勒斯坦聚集,最后與非洲聚為一支;兩支聚合后,與印度最終匯合。6.地理隔離因素大于地理距離的影響;中國南北民族群體之間具有顯著的遺傳差異;全球不同州人群間具有顯著的遺傳差異;宗教信仰影響民族間的基因交流;相同語系民族間的遺傳關系較近;地理的分布和歷史資料呈現(xiàn)出的關系與民族群體間的遺傳關系吻合;中國人類起源于非洲的問題得到印證。
【學位單位】：陜西師范大學
【學位級別】：博士
【學位年份】：2018
【中圖分類】：R394
【部分圖文】：

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本文編號：2816485