血管新生中內(nèi)皮細(xì)胞表型的基因表達(dá)譜分析
發(fā)布時間:2017-03-31 02:19
本文關(guān)鍵詞:血管新生中內(nèi)皮細(xì)胞表型的基因表達(dá)譜分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:背景: 血管分布廣泛,為機(jī)體提供氧氣和營養(yǎng),運(yùn)走代謝廢物;病理情況下,也可以促進(jìn)腫瘤的發(fā)生發(fā)展。目前研究最為廣泛的腫瘤血管形成途徑為血管新生(Angiogenesis)。在此過程中,內(nèi)皮細(xì)胞(endothelial cell, EC)形成三種表型:1.遷移表型,稱頂端細(xì)胞(tip cell);2.增殖表型,稱柄細(xì)胞(stalk cell);3.靜息表型,稱方陣細(xì)胞(phalanx cell)。這三種表型EC對于血管新生的發(fā)生發(fā)展至關(guān)重要。 方法: 采用高密度接種和血清饑餓法制備人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞(human umbilical veinendothelial cell,HUVEC)系的靜息表型,低密度接種和血清培養(yǎng)法制備HUVEC系增殖表型,Boyden小室法制備HUVEC系遷移表型;應(yīng)用EdU法和流式細(xì)胞術(shù)檢測HUVEC系的增殖能力,蘇木精染色法檢測HUVEC系的遷移能力,胰酶消化法收集遷移表型HUVEC系;利用基因芯片分析法在全基因組范圍內(nèi)篩選不同表型差異基因,并通過實(shí)時定量PCR(quantitative reverse transcription polymerase chain reaction,qRT PCR)驗證。 結(jié)果: 1.體外獲取HUVEC系靜息表型,應(yīng)用EdU法檢測陽性率約5%,流式細(xì)胞術(shù)檢測HUVEC系細(xì)胞周期,處于G1期細(xì)胞多于90%,S期低于10%,與EdU法檢測結(jié)果基本一致。 2.體外獲取HUVEC系增殖表型,,應(yīng)用EdU法檢測陽性率近80%,流式細(xì)胞術(shù)檢測90%HUVEC系處于S期,與EdU法檢測結(jié)果相似。 3. Boyden小室提供趨化濃度梯度,制備HUVEC系遷移表型。蘇木精染色觀察到HUVEC系遷移進(jìn)入下室;對遷移細(xì)胞采用胰酶消化法收集,獲取HUVEC系遷移表型,隨著遷移時間的延長,收獲細(xì)胞數(shù)量逐漸增加;EdU法檢測陽性率約15%,流式細(xì)胞術(shù)檢測S期比例也約為15%。 4.基因芯片分析增殖表型中差異表達(dá)基因。根據(jù)基因的生物過程分類,與靜息表型EC相比,上調(diào)基因主要參與細(xì)胞周期,細(xì)胞核分裂和有絲分裂等生物過程;下調(diào)基因主要參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控,RNA代謝和信號通路調(diào)節(jié)等生物過程;另外,差異基因主要參與DNA復(fù)制,細(xì)胞周期和嘧啶的代謝等信號通路。 5.基因芯片分析FBS誘導(dǎo)的遷移表型中差異表達(dá)基因。根據(jù)基因的生物過程分類,與靜息表型EC相比,上調(diào)基因主要參與細(xì)胞死亡,磷酸鹽代謝和血管新生等生物過程;下調(diào)基因主要參與轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié),RNA代謝和GTP酶活性的調(diào)節(jié)等生物過程。 6.基因芯片分析VEGF誘導(dǎo)的遷移表型中差異表達(dá)基因。根據(jù)基因的生物過程分類,與靜息表型EC相比,上調(diào)基因主要參與固醇的生物合成和代謝,脂質(zhì)合成等生物過程;下調(diào)基因主要參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控和胚胎發(fā)育的前后胚軸圖式形成等生物過程;另外,差異基因主要參與固醇和萜類化合物的生物合成等信號通路。 7.對HUVEC系三種表型中10個差異表達(dá)基因進(jìn)行qRT-PCR驗證,結(jié)果與芯片結(jié)果相近。 結(jié)論: 1.采用不同接種密度和培養(yǎng)條件的體外制備方式成功獲取HUVEC系的靜息、增殖、遷移表型。 2.基因芯片篩選出三種表型的差異基因,生物信息學(xué)分析證實(shí)體外獲取方法可行,并為進(jìn)一步探究不同表型中的調(diào)節(jié)機(jī)制提供了數(shù)據(jù)資源。 3.不同誘導(dǎo)因子獲取的遷移表型差異基因為研究單因素和多因素的遷移誘導(dǎo)方式提供了潛在的研究方向。
【關(guān)鍵詞】:血管新生 內(nèi)皮細(xì)胞 表型 基因表達(dá)
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R363
【目錄】:
- 摘要4-6
- Abstract6-8
- 英文縮略詞表8-11
- 第1章 文獻(xiàn)綜述11-20
- 第2章 實(shí)驗研究20-51
- 第1節(jié) 實(shí)驗材料及實(shí)驗方法20-27
- 1.1 實(shí)驗材料和儀器20-21
- 1.1.1 樣本來源20
- 1.1.2 主要儀器及耗材20
- 1.1.3 主要試劑20-21
- 1.2 實(shí)驗方法21-27
- 1.2.1 HUVEC 系的培養(yǎng)21
- 1.2.2 靜息表型 HUVEC 系制備21-22
- 1.2.3 增殖表型 HUVEC 系制備22
- 1.2.4 遷移表型 HUVEC 系制備22
- 1.2.5 EdU 法檢測 HUVEC 系增殖22-24
- 1.2.6 PI 染色檢測細(xì)胞周期24
- 1.2.7 RNA 提取以及 qRT-PCR 分析24-26
- 1.2.8 基因芯片分析26-27
- 1.2.9 統(tǒng)計學(xué)分析27
- 第2節(jié) 實(shí)驗結(jié)果27-51
- 2.1 HUVEC 系形態(tài)學(xué)觀察27
- 2.2 制備靜息、增殖和遷移表型 HUVEC 系27-30
- 2.2.1 不同表型 EC 增殖能力的檢測28
- 2.2.2 不同表型 EC 細(xì)胞周期的檢測28-29
- 2.2.3 細(xì)胞遷移能力的檢測29-30
- 2.3 基因芯片檢測不同表型 HUVEC 系中差異表達(dá)基因30-46
- 2.3.1 芯片樣本的制備30-31
- 2.3.2 差異表達(dá)基因的篩選31-32
- 2.3.3 差異表達(dá)基因的聚類分析32-33
- 2.3.4 差異表達(dá)基因的生物信息學(xué)分析33-45
- 2.3.5 qRT-PCR 驗證分析結(jié)果45-46
- 2.4 討論46-51
- 第3章 結(jié)論51-52
- 參考文獻(xiàn)52-57
- 作者簡介及攻讀碩士期間的研究成果57-58
- 致謝58
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 ZHANG Ping;YAN XianChun;CHEN Yan;YANG ZiYan;HAN Hua;;Notch signaling in blood vessels: from morphogenesis to homeostasis[J];Science China(Life Sciences);2014年08期
本文關(guān)鍵詞:血管新生中內(nèi)皮細(xì)胞表型的基因表達(dá)譜分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:278669
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