移液法高通量核酸提取系統(tǒng)中若干技術(shù)研究
發(fā)布時間:2020-06-29 14:05
【摘要】:隨著醫(yī)療水平的不斷提高,越來越多的遺傳性疾病被診斷,核酸作為重要的遺傳物質(zhì),在蛋白質(zhì)的復(fù)制與合成中起著存儲和傳遞遺傳信息的作用,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)有將近2000多種遺傳性疾病與之相關(guān)。核酸提取作為核酸檢測流程中的重要環(huán)節(jié),快速高效地進行核酸提取對核酸檢測的結(jié)果至關(guān)重要。針對該需求,本論文在課題組自主研制的高通量液體處理平臺基礎(chǔ)上,對高通量核酸提取系統(tǒng)流程進行了設(shè)計,并對其中的關(guān)鍵技術(shù)進行了深入研究。本論文首先優(yōu)化了高通量液體處理平臺的機械抓手模塊設(shè)計,選用了更高精度的旋轉(zhuǎn)編碼器與減速器,并使用了具備自鎖功能的梯形絲杠,通過實驗證明優(yōu)化后的機械抓手的旋轉(zhuǎn)精度和穩(wěn)定性都有所提高。為了配合完成核酸提取實驗設(shè)計了高通量磁分離模塊與振蕩混勻模塊,詳細介紹了兩個模塊的機械設(shè)計與各個工位的功能。兩個模塊均采用ADS1220芯片進行溫度采集,并使用增量式PID算法進行溫度控制,通過實驗驗證溫度控制的精度達到±0.5°C,控溫時間在90 s左右。其次分別對高通量磁分離模塊與振蕩混勻模塊進行磁珠轉(zhuǎn)移率測試實驗與蛋白濃度測試實驗,驗證了模塊的磁分離效率大于95%,振蕩混勻效果良好。最后進行了高通量核酸提取系統(tǒng)的流程控制軟件的框架設(shè)計,并分別進行了手動磁珠法核酸提取實驗、便攜式核酸提取儀核酸提取實驗以及高通量核酸提取系統(tǒng)核酸提取實驗,結(jié)果表明,課題組自主研發(fā)的高通量核酸提取系統(tǒng)的性能介于手動與便攜式核酸提取儀之間,大大縮短了實驗時間,但是核酸提取效率有待提高。
【學(xué)位授予單位】:東南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R346
【圖文】:
磁珠法核酸提取示意圖
儀器內(nèi)磁棒的運動,來實現(xiàn)磁珠從樣本裂解液、結(jié)合液到洗滌液最后進而實現(xiàn)核酸的分離純化,而移液法主要是利用儀器內(nèi)三軸機械臂上,通過控制液體的轉(zhuǎn)移來實現(xiàn)核酸的提取。國內(nèi)外使用磁棒法的核酸提取儀包括西安天隆 NP968-S,艾康生物 N 1-2 所示,其具體的操作步驟為:1)裂解:將磁珠加入裂解液中,進,通過適當(dāng)?shù)募訜嵋约俺浞值拇荡蚧靹蛄呀饧毎?)結(jié)合:裂解以后用磁珠在高鹽低 pH 環(huán)境中對核酸具有強力特異性吸附的特點,加入高進行特異性吸附,將釋放的核酸吸附到磁珠上,而其余雜質(zhì)留在溶液器內(nèi)磁棒的磁場作用下,磁珠與溶液進行分離,經(jīng)過多次反復(fù)洗滌,洗滌緩沖液當(dāng)中,去除殘留下來的蛋白質(zhì)、無機鹽等雜質(zhì);4)洗脫:的磁珠帶入到低鹽高 pH 的洗脫緩沖液中,在此環(huán)境中磁珠被充分洗將磁珠移除,實現(xiàn)核酸的提取純化。
【學(xué)位授予單位】:東南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R346
【圖文】:
磁珠法核酸提取示意圖
儀器內(nèi)磁棒的運動,來實現(xiàn)磁珠從樣本裂解液、結(jié)合液到洗滌液最后進而實現(xiàn)核酸的分離純化,而移液法主要是利用儀器內(nèi)三軸機械臂上,通過控制液體的轉(zhuǎn)移來實現(xiàn)核酸的提取。國內(nèi)外使用磁棒法的核酸提取儀包括西安天隆 NP968-S,艾康生物 N 1-2 所示,其具體的操作步驟為:1)裂解:將磁珠加入裂解液中,進,通過適當(dāng)?shù)募訜嵋约俺浞值拇荡蚧靹蛄呀饧毎?)結(jié)合:裂解以后用磁珠在高鹽低 pH 環(huán)境中對核酸具有強力特異性吸附的特點,加入高進行特異性吸附,將釋放的核酸吸附到磁珠上,而其余雜質(zhì)留在溶液器內(nèi)磁棒的磁場作用下,磁珠與溶液進行分離,經(jīng)過多次反復(fù)洗滌,洗滌緩沖液當(dāng)中,去除殘留下來的蛋白質(zhì)、無機鹽等雜質(zhì);4)洗脫:的磁珠帶入到低鹽高 pH 的洗脫緩沖液中,在此環(huán)境中磁珠被充分洗將磁珠移除,實現(xiàn)核酸的提取純化。
【參考文獻】
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1 查瑤;王小靈;朱詩艷;劉曉光;;煮沸裂解法與磁珠法在HBV DNA熒光定量檢測中的核酸提取效果[J];浙江預(yù)防醫(yī)學(xué);2015年12期
2 徐文莉;張洪德;林燕華;;磁珠法核酸提取對檢測低HBV DNA病毒載量的臨床價值[J];熱帶醫(yī)學(xué)雜志;2015年09期
3 彭雙;李娓;田l
本文編號:2733955
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