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馬爾尼菲藍(lán)狀菌Tcr1、IDO1和IDO2基因功能的初步研究

發(fā)布時(shí)間:2020-06-03 00:02
【摘要】:馬爾尼菲藍(lán)狀菌(Talaromyces marneffei,TM),過去稱作馬爾尼菲青霉菌(Penicillium marneffei,PM),是溫度依賴性雙相病原真菌的一種,也是一種條件致病菌。免疫缺陷和免疫低下的人群是高危人群。主要區(qū)域流行于東南亞和我國南方地區(qū)。它能引起嚴(yán)重的散播性馬爾尼菲青霉病(Penicilliosis marneffei,PSM),預(yù)后較差,會(huì)嚴(yán)重危害人體健康,但其雙相轉(zhuǎn)換和致病機(jī)制尚未研究清楚。色氨酸的犬尿氨酸代謝途徑在病原菌感染宿主和宿主清除病原菌過程中都發(fā)揮了重要的作用。該途徑關(guān)鍵酶是吲哚胺2,3-雙加氧酶(indoleamine2,3-dioxygenase,IDO)。當(dāng)宿主細(xì)胞高表達(dá)IDO時(shí),能抑制體內(nèi)真菌的繁殖和傳播,減輕炎癥反應(yīng)。相反,病原真菌高表達(dá)IDO時(shí),能躲避宿主免疫系統(tǒng)攻擊,加重炎癥。多種腫瘤細(xì)胞高表達(dá)IDO亦能躲避宿主免疫系統(tǒng)的清除。因此猜測(cè)馬爾尼菲藍(lán)狀菌色氨酸的犬尿氨酸代謝途徑與其致病機(jī)制可能有著密切的關(guān)系。近年來,越來越多的研究者關(guān)注馬爾尼菲藍(lán)狀菌的雙相轉(zhuǎn)換機(jī)制,普遍認(rèn)為其與致病性密切相關(guān)。本課題組對(duì)馬爾尼菲藍(lán)狀菌標(biāo)準(zhǔn)株雙相轉(zhuǎn)換過程中四個(gè)不同生長時(shí)相分別進(jìn)行鏈特異性轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)色氨酸沿犬尿氨酸代謝途徑的相關(guān)基因,Tcr1、IDO1和IDO2在菌絲相轉(zhuǎn)為酵母相或在酵母相時(shí)高表達(dá)。上述基因在雙相轉(zhuǎn)換過程中表達(dá)差異明顯,故推測(cè)它們可能在馬爾尼菲藍(lán)狀菌雙相轉(zhuǎn)換中發(fā)揮重要作用。因此本課題主要對(duì)這三個(gè)基因的功能進(jìn)行初步研究,進(jìn)而探究色氨酸代謝途徑在馬爾尼菲藍(lán)狀菌致病過程中的作用特征,為研究馬爾尼菲藍(lán)狀菌雙相轉(zhuǎn)換機(jī)制及其致病機(jī)制奠定基礎(chǔ)。目的:通過對(duì)致病性酵母相高表達(dá)的色氨酸代謝途徑中相關(guān)的Tcr1、IDO1和IDO2基因功能的初步研究,以便闡明馬爾尼菲藍(lán)狀菌中色氨酸代謝途徑的特征,與雙相轉(zhuǎn)換的關(guān)系及其致病的可能機(jī)制。方法:利用同源重組的方法,構(gòu)建目的基因缺失突變株,與出發(fā)菌株Spm4對(duì)比,主要觀察基因缺失突變株表型的變化,包括對(duì)色氨酸分解代謝能力的變化,對(duì)藥物、氧化壓力、滲透壓力和細(xì)胞壁壓力敏感性的變化,檢測(cè)并比較菌絲相、酵母相特異高表達(dá)基因表達(dá)量的變化,初步了解目的基因的功能。結(jié)果:(1)成功構(gòu)建Tcr1、IDO1和IDO2基因缺失突變株;(2)在25℃條件下,Tcr1、IDO1基因缺失突變株無法在以色氨酸為唯一碳源和唯一氮源培養(yǎng)板上生長,而IDO2可在上述培養(yǎng)板上生長;(3)相對(duì)Spm4,Tcr1缺失突變株對(duì)滲透壓力、兩性霉素B和米卡芬凈敏感性稍增加,另外對(duì)細(xì)胞壁脅迫壓力尤為敏感;(4)相對(duì)Spm4,IDO1對(duì)兩性霉素B的敏感性明顯下降;(5)IDO2基因缺失突變株對(duì)兩性霉素B和米卡芬凈的敏感性下降。(6)IDO1和Tcr1缺失后,酵母相特異性高表達(dá)的基因(如MP1,aspergillopepsin F precursor和antigenic cell wall galactomannoprotein等)表達(dá)量相對(duì)出發(fā)菌株Spm4明顯下降。結(jié)論:(1)在25℃條件下,IDO1基因在馬爾尼菲藍(lán)狀菌色氨酸分解代謝過程中起主要作用,該基因還可能與細(xì)胞膜上兩性霉素B固醇類結(jié)合位點(diǎn)的結(jié)構(gòu)相關(guān)。(2)在25℃條件下,Tcr1轉(zhuǎn)錄因子基因參與調(diào)控色氨酸的分解代謝。該轉(zhuǎn)錄因子還可能影響細(xì)胞壁的組成及完整性。(3)IDO2基因不是馬爾尼菲藍(lán)狀菌色氨酸分解代謝中關(guān)鍵基因,但可能與兩性霉素B細(xì)胞膜上固醇類結(jié)合位點(diǎn)和米卡芬凈細(xì)胞壁上葡聚糖結(jié)合位點(diǎn)的結(jié)構(gòu)相關(guān)。(4)Tcr1和IDO1基因可能參與了酵母形態(tài)形成和維持。
【圖文】:

犬尿氨酸,色氨酸,代謝途徑


則會(huì)抑制病原真菌的生長和 Th17 淋巴細(xì)胞的分化、限制組織的過度炎癥反應(yīng)[11, 12]。在宿主和真菌都需要代謝和利用色氨酸,共享著相同的中間代謝產(chǎn)物,互相作用,共同影響,,它們之間是如何串?dāng)_,尚未清楚。總而言之,IDO 在真菌感染后的機(jī)體免疫反應(yīng)中起著重要的調(diào)節(jié)作用,影響著感染程度。其在馬爾尼菲藍(lán)狀菌感染過程中也可能發(fā)揮著重要的作用。本課題組在前期馬爾尼菲藍(lán)狀菌 FRR2161 菌株轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果中,發(fā)現(xiàn)在 37℃致病性酵母相時(shí)色氨酸的犬尿酸代謝途徑中 IDO、犬尿酸酶(kynureninase)、乙酰輔酶 A 乙;D(zhuǎn)移酶(acetyl-CoA C-acetyltransferase)和 氨 基 羧 酸 縮 醛 半 醛 脫 羧 酶 ( aminocarboxymuconate-semialdehydedecarboxylase,ACMSD)的表達(dá)大幅度上調(diào),而犬尿氨酸氧化戊二酸氨基轉(zhuǎn)移酶(kynurenine-oxoglutarate transaminase)表達(dá)下調(diào),最終生成的犬尿酸減少,而犬尿氨酸、吡啶甲酸和乙酰輔酶 A 增加(圖 1-1)。

統(tǒng)計(jì)圖,統(tǒng)計(jì)圖,基因,酵母


在酵母相時(shí)高表達(dá)或者是菌絲相轉(zhuǎn)向酵母相時(shí)表達(dá)量增加(圖1-2)。我們猜測(cè)色氨酸代謝的犬尿氨酸代謝途徑與酵母細(xì)胞形態(tài)的形成和維持都發(fā)揮著重要的作用。在馬爾尼菲藍(lán)狀菌基因數(shù)據(jù)庫中編碼發(fā)現(xiàn) IDO1 基因和犬尿酸酶基因在同一個(gè)基因簇(Gene cluster)上,并在同簇基因上發(fā)現(xiàn)它們的編碼前面有一個(gè) Tcr1 轉(zhuǎn)錄因子基因,而該轉(zhuǎn)錄因子基因表達(dá)變化趨勢(shì)同樣在酵母相和菌絲相轉(zhuǎn)為酵母相時(shí)表達(dá)上升(圖 1-2),我們猜測(cè)該轉(zhuǎn)錄因子可能參與調(diào)控色氨酸的分解。而 IDO3 基因的表達(dá)量在不同溫度條件下都比較穩(wěn)定。圖 1-2 四種生長時(shí)相中 Tcr1、IDO1 和 IDO2 基因 RPKM 變化的統(tǒng)計(jì)圖。Figure 1-2 The RPKM value change of Tcr1、IDO1 and IDO2 gene during four phase.
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R379

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