發(fā)布時(shí)間：2020-02-02 23:08

【摘要】：目的應(yīng)用生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)結(jié)核分枝桿菌AccD5基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)獲取AccD5基本的基因信息;應(yīng)用ProtParam軟件預(yù)測(cè)AccD5蛋白的理化性質(zhì);利用SignaIP 4.1和TMHMM分析其信號(hào)肽和跨膜區(qū);利用在線分析Expasy工具分析蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu),建立蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)模型;利用BepiPred 1.0Server和SYFPEITHI分析蛋白的B細(xì)胞及T細(xì)胞抗原表位。結(jié)果AccD5蛋白共548個(gè)氨基酸,分子式為C2621H4153N727O810S17,分子質(zhì)量單位(Mr)為59.354 2×103,理論等電點(diǎn)為5.19,脂溶性系數(shù)為91.15,不穩(wěn)定性指數(shù)為31.21,親水性平均系數(shù)為-0.16,預(yù)測(cè)該蛋白為穩(wěn)定性親水性蛋白;二級(jí)結(jié)構(gòu)中α-螺旋、β-轉(zhuǎn)角、β-折疊、無(wú)規(guī)則卷曲分別占37.23%、10.58%、22.81%和29.38%,預(yù)測(cè)的B細(xì)胞、CTL細(xì)胞抗原表位分別為14個(gè)和25個(gè)。結(jié)論生物信息學(xué)分析AccD5為穩(wěn)定蛋白,含有潛在的B、T細(xì)胞抗原表位,為研發(fā)治療結(jié)核新藥提供了潛在靶標(biāo)。

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6 陳陽(yáng),李健峰,姬秋彥,閆玲梅,龍海亭,徐維明;幽門(mén)螺桿菌oipA基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[J];世界華人消化雜志;2005年07期

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8 李良仁,王繼德,白楊,王群英;幽門(mén)螺桿菌OMP25基因的克隆、測(cè)序及生物信息學(xué)分析[J];廣東醫(yī)學(xué);2005年06期

9 胡平;羅軍;張文炳;龍北國(guó);;幽門(mén)螺桿菌基因hp0231和hp0410的克隆表達(dá)及生物信息學(xué)分析[J];熱帶醫(yī)學(xué)雜志;2007年04期

10 沈旭,薛建華,余長(zhǎng)纓,羅海彬,秦磊,俞曉晶,陳靜,陳莉莉,熊斌,岳莉多,蔡建華,沈建華,羅小民,陳凱先,石鐵流,李亦學(xué),胡庚熙,蔣華良;SARS病毒小信封蛋白E:克隆、表達(dá)、純化、CD測(cè)定和生物信息學(xué)分析(英文)[J];Acta Pharmacologica Sinica;2003年06期

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