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DNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析與數(shù)字化表征

發(fā)布時間:2017-03-19 05:03

  本文關(guān)鍵詞:DNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析與數(shù)字化表征,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:電子系統(tǒng)受到復(fù)雜電磁環(huán)境的影響可能會導(dǎo)致失靈甚至損毀,而傳統(tǒng)的電磁防護(hù)存在防護(hù)主動性和自我修復(fù)性差等缺點,因此急需尋找新的電子系統(tǒng)抗擾及防護(hù)方式。由于生物網(wǎng)絡(luò)具有“自組織、自適應(yīng)和自修復(fù)”等特性,使得生物體在復(fù)雜電磁環(huán)境中能夠保持自身內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定性。因此,對生物網(wǎng)絡(luò)的特性進(jìn)行研究能夠為電磁防護(hù)提供新的思想和解決方案;蛘{(diào)控網(wǎng)絡(luò)是一種重要的生物網(wǎng)絡(luò),具有復(fù)雜性、穩(wěn)定性等特性,基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中具有代表性的是P53基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),本文基于布爾網(wǎng)絡(luò)建模方法,對P53基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分析,研究網(wǎng)絡(luò)的邏輯特性及數(shù)字化表達(dá)。主要工作如下:1、實現(xiàn)了P53基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的可視化,通過可視化得到了P53基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中各節(jié)點的入度分布,根據(jù)入度分布構(gòu)建了單中心基因的連接類型及對應(yīng)邏輯電路。2、對P53基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,通過編程實現(xiàn)了各節(jié)點連接類型的自動選擇,并結(jié)合權(quán)值矩陣對各連接類型的輸入進(jìn)行判斷,為P53網(wǎng)絡(luò)中各基因選擇了相關(guān)的連接類型及對應(yīng)的邏輯電路,并對基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)邏輯電路的穩(wěn)定性進(jìn)行了初步的分析。3、從模體的角度對P53基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了分析,構(gòu)建了三種不同的隨機(jī)網(wǎng)絡(luò),分別對P53基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行模體檢測,對檢測到的模體進(jìn)行了邏輯電路的轉(zhuǎn)化,并對其穩(wěn)定性進(jìn)行了分析。
【關(guān)鍵詞】:基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò) 布爾網(wǎng)絡(luò) 網(wǎng)絡(luò)數(shù)字化 子網(wǎng)搜索 模體識別
【學(xué)位授予單位】:河北工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R3416
【目錄】:
  • 摘要4-5
  • ABSTRACT5-8
  • 第一章 緒論8-20
  • 1.1 研究背景8-9
  • 1.2 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)9-15
  • 1.2.1 中心法則9-10
  • 1.2.2 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)來源10-11
  • 1.2.3 P53基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)11-12
  • 1.2.4 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)常用數(shù)學(xué)模型12-15
  • 1.3 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)國內(nèi)外研究現(xiàn)狀15-18
  • 1.3.1 國內(nèi)研究進(jìn)展15-16
  • 1.3.2 國外研究進(jìn)展16-18
  • 1.4 本文的主要工作18-20
  • 第二章 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)可視化及邏輯分析20-28
  • 2.1 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建的描述20-21
  • 2.2 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖的可視化21-23
  • 2.3 基因連接邏輯關(guān)系表達(dá)23-27
  • 2.4 本章小結(jié)27-28
  • 第三章 基于基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)布爾模型的邏輯電路構(gòu)建28-38
  • 3.1 標(biāo)志位的設(shè)置28-29
  • 3.2 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的數(shù)據(jù)處理29-31
  • 3.3 網(wǎng)絡(luò)節(jié)點的類型選擇31-34
  • 3.4 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)邏輯電路的穩(wěn)定性分析34-36
  • 3.5 本章小結(jié)36-38
  • 第四章 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模體研究38-48
  • 4.1 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的模體38-39
  • 4.2 網(wǎng)絡(luò)模體識別39-42
  • 4.2.1 構(gòu)建隨機(jī)網(wǎng)絡(luò)39-40
  • 4.2.2 子圖搜索算法40-41
  • 4.2.3 評價模體的參數(shù)41-42
  • 4.3 對P53調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行模體檢測42-44
  • 4.4 P53網(wǎng)絡(luò)模體的邏輯分析44-46
  • 4.5 本章小結(jié)46-48
  • 第五章 結(jié)論48-50
  • 5.1 總結(jié)48-49
  • 5.2 工作展望49-50
  • 參考文獻(xiàn)50-54
  • 致謝54

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 郭子龍;紀(jì)兆華;涂華偉;梁艷春;;基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究內(nèi)容及其數(shù)據(jù)分析方法[J];電腦知識與技術(shù);2008年15期

2 劉齊軍;王正華;郭昊;孫漢昌;劉萬霖;朱云平;;一種新的度量生物復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)模塊性的方法[J];計算機(jī)工程與科學(xué);2010年08期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 徐紅林;基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的建模及其結(jié)構(gòu)分解方法研究[D];江南大學(xué);2010年

2 劉齊軍;生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)的功能模塊性分析與模塊識別方法研究[D];國防科學(xué)技術(shù)大學(xué);2010年


  本文關(guān)鍵詞:DNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析與數(shù)字化表征,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:255538

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