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MS2噬菌體的純化和殘留核酸的去除研究

發(fā)布時間:2019-09-12 05:50
【摘要】:目的:用三種方法將MS2噬菌體生產(chǎn)過程中產(chǎn)生的大腸桿菌的核酸、細胞器、細胞碎片、化學(xué)試劑等去除掉,純化MS2噬菌體,同時比較三種純化方法的優(yōu)劣;分別用四種方法去除MS2噬菌體中混有的大量核酸,使MS2噬菌體達到內(nèi)參照品的要求,同時比較四種方法的優(yōu)劣。 方法:含有大量雜質(zhì)的MS2噬菌體用三種方法進行純化,超速離心法、三氯甲烷抽提法、分子篩法,比較三種方法的優(yōu)劣性;分別應(yīng)用酶消化法、無限稀釋和透析綜合法、超速離心法、Millipore柱子法四種方法去除MS2噬菌體中混有的大量核酸。 結(jié)果:用三種不同的方法純化MS2噬菌體。超速離心法:電泳分析圖可見,處理后的樣本電泳條帶亮度高,但有拖尾現(xiàn)象,且通過電鏡分析可知,背景純度不高,且含有大量的雜質(zhì)。三氯甲烷法:電泳分析圖可見,處理后的樣本電泳條帶亮度高,無拖尾現(xiàn)象,且通過電鏡分析可知,背景純度高,不含有雜質(zhì),但通過SDS-PAGE分析圖可見樣本中卻有少量的雜蛋白殘留。分子篩法:通過SDS-PAGE分析圖可知,處理后的樣本無雜蛋白殘留,只含有14KD的MS2噬菌體單體。 用四種不同的方法去除MS2噬菌體中混有的大量核酸。酶消化法:通過柱狀分析圖可知應(yīng)用50U、25U、12.5U、2.5U的酶濃度,其CT值相差不多,也就是說DNA模板量相差不多。無限稀釋和透析綜合法:通過PCR分析圖得知,隨著稀釋度的增加,透析前后的樣本之間只有些微的差異,且通過電泳分析也可得知,隨著稀釋度從10-2至10-7的增加,電泳條帶亮度相差不多,且透析前后的電泳條帶亮度也相差不多,加核酸酶與不加核酸酶處理的電泳條帶亮度也是相差不多,通過電鏡觀察可知,透析后的MS2噬菌體中混有大量的化學(xué)試劑的結(jié)晶,掩蓋了大量的MS2噬菌體。超速離心法:通過PCR產(chǎn)物電泳圖可知,第七次離心后沉淀中殘留的DNA于25個循環(huán)時才出現(xiàn),且消化掉DNA的影響后,RNA既MS2噬菌體的量仍較大。然而通過Real Time PCR精確定量后,每一次離心后沉淀和上清中的噬菌體和殘留核酸的量相差不多,且每離心一次大約損失10倍的噬菌體。Millipore柱子法:通過PCR產(chǎn)物電泳圖可知,PBS Buffer組和Bezonase Buffer組在25個循環(huán)時才有少量的DNA模板進行擴增,Bezonase Buffer組的電泳條帶亮度較PBS Buffer組亮度高,且通過RT-PCR檢測,PBS Buffer組MS2噬菌體與殘留核酸之間的絕對定量相差4個數(shù)量級,而Bezonase Buffer組MS2噬菌體與殘留核酸之間的絕對定量只相差3個數(shù)量級,然而通過電鏡觀察,Bezonase Buffer組的樣本背景較純,而PBS Buffer組的樣本背景跟前者相比較差,但兩者都較未過Millipore柱子的樣本背景純度高。 結(jié)論:用三種不同的方法純化MS2噬菌體,三氯甲烷抽提的方法最好;用四種不同的方法去除殘留的核酸,過Millipore柱子法最好。
【圖文】:

電泳分析,酶濃度,核酸酶,噬菌體


圖一 酶切后電泳分析圖2 去除 MS2 噬菌體中混有的核酸2.1 酶濃度法四種不同酶濃度 50U,25U,12.5U,2.5UPCR 檢測其 CT 值,通過下圖可知,各個量相差不多,應(yīng)用高濃度的酶濃度消化掉種方式不能完全去除 DNA 殘留。核酸酶處理后EV71 P-F25303540TCalveu

柱子,電泳條,亮度,循環(huán)時


26圖十一 上清中的絕對定量分析圖2.4 Millipore 柱子法通過圖十二可知,在 25 個循環(huán)時才出現(xiàn)電泳條帶,既有的 DNA 模板進行擴Bezonase Buffer 組的電泳條帶亮度較 PBS 組亮度高,說明 Bezonase Buffer 組的
【學(xué)位授予單位】:寧夏醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類號】:R378

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本文編號:2534925

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