【摘要】：適應(yīng)性免疫應(yīng)答(adaptive immune response)是指T和B淋巴細(xì)胞因?qū)乖奶禺愋宰R別而活化、增殖、分化,最終形成效應(yīng)細(xì)胞,并通過其所分泌的抗體或細(xì)胞因子表現(xiàn)出一定生物學(xué)效應(yīng)的過程。 T細(xì)胞表位(epitope)能夠激活T細(xì)胞的免疫應(yīng)答,在適應(yīng)性免疫應(yīng)答中發(fā)揮重要的作用。而T細(xì)胞對其的識別具有MHC限制性,并且根據(jù)參與的MHC分子的不同分為MHCI類途徑和MHCⅡ類途徑。 在MHCⅡ類途徑中,MHCⅡ類分子只能與特定的抗原肽結(jié)合,為了研究抗原肽和MHCⅡ類分子的結(jié)合特異性,本文采用交叉驗(yàn)證與固定點(diǎn)迭代算法相結(jié)合的方法(CV-FastICA),分別建立了三種基于13-mer擴(kuò)展核心結(jié)合序列的MHCⅡ類配體的定量構(gòu)效關(guān)系(quantitative structure-activity relationship, QSAR)模型,并與基于9-mer核心結(jié)合序列的模型進(jìn)行了比較。通過比較各個(gè)模型預(yù)測性能,可知建立模型時(shí)需要考慮核心結(jié)合序列兩側(cè)的擴(kuò)展位置上氨基酸的影響。另外,本文以HLADRBl*0101為例,分析了抗原肽的不同位置氨基酸對MHCⅡ類分子的結(jié)合特異性,所得結(jié)果與實(shí)驗(yàn)結(jié)果基本一致。 首先,通過理論模型來預(yù)測候選Th表位,再利用相應(yīng)的生物實(shí)驗(yàn)加以驗(yàn)證,可以減少實(shí)驗(yàn)成本,提高鑒定效率。本文使用CV-Fast ICA方法建立MHCⅡ類分子與抗原肽相互作用結(jié)合的QSAR模型,對了解免疫機(jī)理和指導(dǎo)表位疫苗的開發(fā)具有一定的指導(dǎo)意義。
【學(xué)位授予單位】：大連理工大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2012
【分類號】：R392

【參考文獻(xiàn)】

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1 沈軍;脈間波形變換信號分選跟蹤器的設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)[D];哈爾濱工程大學(xué);2007年

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本文編號：2521458