【摘要】：目的應(yīng)用生物信息學(xué)方法分析結(jié)核分枝桿菌Rv2629基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能。方法從NCBI GenBank中獲得結(jié)核分枝桿菌H37Rv利福平敏感菌株Rv2629的基因序列,利用在線分析軟件預(yù)測和分析其編碼蛋白的理化性質(zhì)和親疏水性,跨膜結(jié)構(gòu)域及信號肽,糖基化位點及磷酸化位點,二級和三級結(jié)構(gòu)及B、T淋巴細胞抗原表位。結(jié)果Rv2629蛋白由374個氨基酸組成,具有親水性,主要存在于細胞壁及細胞膜。Rv2629含有信號肽及跨膜結(jié)構(gòu)域,6個糖基化位點和4個磷酸化氨基酸位點,二級結(jié)構(gòu)中α螺旋約占45.72%,β折疊約占17.11%。該蛋白含有3個潛在的B細胞抗原表位,其優(yōu)勢抗原表位主要集中在67-70,91-95,229-232位氨基酸,4個CTL細胞表位分別位于279、283、98、346位氨基酸,11個T h細胞表位分別位于26、127、256、25、34、116、204、215、350、363、367位氨基酸。結(jié)論Rv2629蛋白存在于細胞壁及細胞膜,是一分泌蛋白,在結(jié)核病的潛伏期可上調(diào)表達。該蛋白含有B、T細胞抗原表位,可作為結(jié)核利福平耐藥株的研究靶點。
[Abstract]:Objective to analyze the structure and function of Rv2629 gene encoding protein of Mycobacterium tuberculosis by bioinformatics. Methods the gene sequence of rifampicin sensitive strain Rv2629 of Mycobacterium tuberculosis H37Rv was obtained from NCBI GenBank. The physical and chemical properties, hydrophobicity, transmembrane domain and signal peptide of the encoded protein were predicted and analyzed by on-line analysis software. Glycosylation sites and phosphorylation sites, secondary and tertiary structures, and B, T lymphocyte antigen surface sites. Results the Rv2629 protein was composed of 374 amino acids and was hydrophilic. Rv2629 contained signal peptide and transmembrane domain, 6 glycosylation sites and 4 phosphorylated amino acid sites. In the secondary structure, 偽 helix accounted for 45.72% and 尾 fold about 17.11%. The protein contains three potential B cell epitopes. The dominant epitopes are located at the amino acids at the 67-70G 91-95229-232 position, the four CTL cell epitopes are located at the 279U 283N 98346 amino acids, and the 11 T h cell epitopes are located at the amino acids at 269127U 256116244215350363367, respectively. Conclusion Rv2629 protein exists in the cell wall and cell membrane. It is a secretory protein and can up-regulate the expression in the latent period of tuberculosis. The protein contains B and T cell antigen, and can be used as a target of rifampicin-resistant tuberculosis.
【作者單位】： 濰坊醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗學(xué)系;濰坊醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)教研室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(No.30972639) 山東省自然科學(xué)基金項目(No.ZR2016HM09)
【分類號】：R378.911

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本文編號：2427279