【摘要】：目的應用生物信息學方法分析結核分枝桿菌Rv2629基因編碼蛋白的結構和功能。方法從NCBI GenBank中獲得結核分枝桿菌H37Rv利福平敏感菌株Rv2629的基因序列,利用在線分析軟件預測和分析其編碼蛋白的理化性質和親疏水性,跨膜結構域及信號肽,糖基化位點及磷酸化位點,二級和三級結構及B、T淋巴細胞抗原表位。結果Rv2629蛋白由374個氨基酸組成,具有親水性,主要存在于細胞壁及細胞膜。Rv2629含有信號肽及跨膜結構域,6個糖基化位點和4個磷酸化氨基酸位點,二級結構中α螺旋約占45.72%,β折疊約占17.11%。該蛋白含有3個潛在的B細胞抗原表位,其優(yōu)勢抗原表位主要集中在67-70,91-95,229-232位氨基酸,4個CTL細胞表位分別位于279、283、98、346位氨基酸,11個T h細胞表位分別位于26、127、256、25、34、116、204、215、350、363、367位氨基酸。結論Rv2629蛋白存在于細胞壁及細胞膜,是一分泌蛋白,在結核病的潛伏期可上調表達。該蛋白含有B、T細胞抗原表位,可作為結核利福平耐藥株的研究靶點。
[Abstract]:Objective to analyze the structure and function of Rv2629 gene encoding protein of Mycobacterium tuberculosis by bioinformatics. Methods the gene sequence of rifampicin sensitive strain Rv2629 of Mycobacterium tuberculosis H37Rv was obtained from NCBI GenBank. The physical and chemical properties, hydrophobicity, transmembrane domain and signal peptide of the encoded protein were predicted and analyzed by on-line analysis software. Glycosylation sites and phosphorylation sites, secondary and tertiary structures, and B, T lymphocyte antigen surface sites. Results the Rv2629 protein was composed of 374 amino acids and was hydrophilic. Rv2629 contained signal peptide and transmembrane domain, 6 glycosylation sites and 4 phosphorylated amino acid sites. In the secondary structure, 偽 helix accounted for 45.72% and 尾 fold about 17.11%. The protein contains three potential B cell epitopes. The dominant epitopes are located at the amino acids at the 67-70G 91-95229-232 position, the four CTL cell epitopes are located at the 279U 283N 98346 amino acids, and the 11 T h cell epitopes are located at the amino acids at 269127U 256116244215350363367, respectively. Conclusion Rv2629 protein exists in the cell wall and cell membrane. It is a secretory protein and can up-regulate the expression in the latent period of tuberculosis. The protein contains B and T cell antigen, and can be used as a target of rifampicin-resistant tuberculosis.
【作者單位】： 濰坊醫(yī)學院醫(yī)學檢驗學系;濰坊醫(yī)學院病原生物學教研室;
【基金】：國家自然科學基金項目(No.30972639) 山東省自然科學基金項目(No.ZR2016HM09)
【分類號】：R378.911

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 蔡群芳;鄔強;閆玉蘭;呂剛;;歐猥迭宮絳蟲谷胱甘肽轉移酶1基因序列與功能的生物信息學分析[J];海南醫(yī)學院學報;2013年05期

2 梁丕;;人血管內皮生長因子的生物信息學分析[J];吉林醫(yī)學;2013年36期

3 李建強;李薇;張予超;高晶晶;趙祖波;楊俊杰;;中國EV71病毒VP1蛋白生物信息學分析[J];微生物學免疫學進展;2010年04期

4 聶佳瑩;楊致邦;唐磊;黃進;蔣英;;幽門螺桿菌感應蛋白CrdS的原核表達及生物信息學分析[J];中國生物制品學雜志;2013年09期

5 郭松;劉曉光;;普城沙雷氏菌rpoS基因的生物信息學分析[J];江蘇大學學報(醫(yī)學版);2013年06期

6 陳陽,李健峰,姬秋彥,閆玲梅,龍海亭,徐維明;幽門螺桿菌oipA基因的克隆及其生物信息學分析[J];世界華人消化雜志;2005年07期

7 白向陽;嚴玲玲;朱濤;盧運萍;周劍鋒;馬丁;;淋巴組織中新基因C14ORF44的生物信息學分析[J];基礎醫(yī)學與臨床;2007年10期

8 李良仁,王繼德,白楊,王群英;幽門螺桿菌OMP25基因的克隆、測序及生物信息學分析[J];廣東醫(yī)學;2005年06期

9 胡平;羅軍;張文炳;龍北國;;幽門螺桿菌基因hp0231和hp0410的克隆表達及生物信息學分析[J];熱帶醫(yī)學雜志;2007年04期

10 沈旭,薛建華,余長纓,羅海彬,秦磊,俞曉晶,陳靜,陳莉莉,熊斌,岳莉多,蔡建華,沈建華,羅小民,陳凱先,石鐵流,李亦學,胡庚熙,蔣華良;SARS病毒小信封蛋白E:克隆、表達、純化、CD測定和生物信息學分析(英文)[J];Acta Pharmacologica Sinica;2003年06期

相關碩士學位論文 前2條

1 孫萃萍;多房棘球絳蟲HSP20蛋白的生物信息學分析、重組表達及泡球蚴的體外培養(yǎng)[D];蘭州大學;2015年

2 陳鶴;基于生物信息學分析的弓形蟲致密顆粒蛋白GRA3的疫苗設計與體內驗證[D];安徽醫(yī)科大學;2014年

，

本文編號：2427279