【摘要】：目的:檢測人類子宮內(nèi)膜著床窗口期miRNA表達譜,建立miRNA參與調(diào)控胚胎著床的生物信息網(wǎng)絡(luò)。 方法:雙通道微陣列技術(shù)檢測人類子宮內(nèi)膜著床窗口期miRNA表達譜,應(yīng)用MMIA在線服務(wù)器進行靶mRNA基因預測,用Cytoscape軟件構(gòu)建由miRNAs和mRNAs組成的生物信息網(wǎng)絡(luò),通過MAS在線服務(wù)器對生物信息網(wǎng)絡(luò)中差異表達mRNAs基因進行功能分類,預測miRNA參與調(diào)控胚胎著床的關(guān)鍵分子通路。 結(jié)果:1.著床窗口期有72個miRNAs差異表達,其中50個顯著上調(diào),22個顯著下調(diào)(fold change =2, q value 0.01);2.除去23種miRNAs未能預測到靶基因外,余下49種miRNAs預測到6106種擁有唯一官方基因符號的靶mRNAs基因。對于每個差異表達的miRNA來說,預測mRNAs靶基因的數(shù)量存在較大差異;3.篩選出著床窗口期差異表達的miRNAs和差異表達的預測靶mRNAs基因(fold change =2.5, p value 0.01),滿足上述條件的共有218個基因構(gòu)成生物信息網(wǎng)絡(luò),其中39個miRNAs上調(diào),6個miRNAs下調(diào),114個mRNAs上調(diào),59個mRNAs下調(diào)。 結(jié)論:微陣列技術(shù)和計算機方法能有效分析著床窗期基因表達,為研究調(diào)控胚胎著床的分子機制提供了重要參考。
[Abstract]:Aim: to detect the miRNA expression profile of human endometrial implantation window and to establish a biological information network of miRNA involved in the regulation of embryo implantation. Methods: double channel microarray technique was used to detect miRNA expression profile of human endometrium during implantation window, MMIA online server was used to predict target mRNA gene, and Cytoscape software was used to construct a biological information network composed of miRNAs and mRNAs. The functional classification of differentially expressed mRNAs gene in biological information network was carried out by MAS online server, and the key molecular pathway of miRNA involved in regulating embryo implantation was predicted. Results: 1. There were 72 miRNAs differentially expressed in the window, 50 of which were up-regulated, 22 were significantly down-regulated (fold change = 2, Q value 0.01). With the exception of 23 miRNAs which failed to predict target genes, the remaining 49 miRNAs predicted 6106 target mRNAs genes with unique official gene symbols. For each differentially expressed miRNA, there were significant differences in the number of mRNAs target genes. The differentially expressed miRNAs and the predicted target mRNAs gene (fold change = 2.5, p value 0.01) were screened. A total of 218 genes satisfying the above conditions constituted a biological information network, in which 39 miRNAs were up-regulated and 6 miRNAs down-regulated. 114 mRNAs were up-regulated and 59 mRNAs down-regulated. Conclusion: microarray technique and computer method can effectively analyze gene expression in implantation window and provide important reference for studying molecular mechanism of embryo implantation.
【學位授予單位】：華中科技大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2011
【分類號】：R321

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本文編號：2401075