【摘要】：目的分析銅綠假單胞菌野生型菌株PAO1及PA0861突變菌株基因表達譜,探討銅綠假單胞菌中GGDEFEAL基因PA0861的生物學功能。方法以野生型銅綠假單胞菌PAO1及PA0861基因轉座子插入失活的突變體菌株為材料,利用結晶紫染色方法進行細菌生物膜的表型分析;利用Microarray技術分析其基因表達譜的變化;采用半定量RT-PCR驗證Microarray結果。結果 PA0861突變株生物膜的合成量在4、8、12h均高于PAO1(P0.05),在12h時增加了近1倍;利用Microarray技術篩選出差異表達基因517個,其中319個上調,198個下調。生物分子功能注釋和Pathway分類顯示這些差異表達基因除涉及代謝過程中基本的物質變化和能量轉換外,突變體PA0861中涉及鐵載體生物合成基因的表達增高。半定量RT-PCR驗結果一致。結論銅綠假單胞菌突株PA0861基因表達譜發(fā)生改變,其中鐵載體生物合成基因高表達,提示c-di-GMP可能通過對鐵載體的調控影響細菌生物膜的形成。
[Abstract]:Objective to analyze the gene expression profiles of PAO1 and PA0861 mutant strains of Pseudomonas aeruginosa and to explore the biological function of GGDEFEAL gene PA0861 in Pseudomonas aeruginosa. Methods the bacterial biofilm phenotypic analysis was carried out by crystal violet staining using inactivated mutants inserted into the transposon of PAO1 and PA0861 genes of Pseudomonas aeruginosa, and the gene expression profiles were analyzed by Microarray technique. Microarray results were verified by semi-quantitative RT-PCR. Results the biosynthesis of PA0861 mutant biofilm was significantly higher than that of PAO1 at 8 / 12 h (P0.05), and 517 differentially expressed genes were screened by Microarray technique, of which 319 were up-regulated and 198 down-regulated. The biomolecular functional annotation and Pathway classification showed that these differentially expressed genes were related to the expression of biosynthesis genes in iron carriers in addition to the basic changes of substance and energy conversion in metabolic process and the expression of iron vector biosynthesis genes in the mutant PA0861. The results of semi-quantitative RT-PCR were consistent. Conclusion the PA0861 gene expression profile of Pseudomonas aeruginosa strain changed, and the expression of iron biosynthesis gene was high, suggesting that c-di-GMP may influence the formation of bacterial biofilm through the regulation of iron carrier.
【作者單位】： 寧夏醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院;寧夏醫(yī)科大學醫(yī)學科學技術研究中心;
【基金】：國家自然科學基金項目(No.81260243)
【分類號】：R378

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