【摘要】：目的:探討脂多糖(LPS)誘導(dǎo)的腸巨噬細(xì)胞炎癥反應(yīng)與長鏈非編碼RNA(lncRNA)表達(dá)的關(guān)系。方法:分離培養(yǎng)大鼠腸巨噬細(xì)胞,用lncRNA表達(dá)譜芯片技術(shù)檢測LPS處理的大鼠腸巨噬細(xì)胞(實(shí)驗(yàn)組)和無處理的大鼠腸巨噬細(xì)胞(對照組)之間差異表達(dá)的lncRNA,并用分層聚類的方法分析了基因芯片數(shù)據(jù);構(gòu)建差異表達(dá)的lncRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),利用GO分析和通路分析預(yù)測其生物學(xué)功能;最后用RT-qPCR對部分差異表達(dá)的lncRNA進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果:與對照組比較,實(shí)驗(yàn)組共檢測出357個(gè)差異表達(dá)的lncRNA(差異表達(dá)倍數(shù)1.5),其中上調(diào)的有245個(gè),下調(diào)的有112個(gè)。GO分析和通路分析顯示差異表達(dá)的lncRNA參與多種生物過程,包括炎癥反應(yīng),免疫應(yīng)答和細(xì)胞凋亡,其中l(wèi)ncRNA NONMMUT024673、NONMMUT047081在網(wǎng)絡(luò)中可能起重要作用。RT-qPCR驗(yàn)證NONMMUT024673、NONMMUT047081的表達(dá),結(jié)果與基因芯片數(shù)據(jù)一致。結(jié)論:LPS可誘導(dǎo)大鼠腸巨噬細(xì)胞lncRNA表達(dá)改變,這些差異表達(dá)的lncRNA可能參與調(diào)控LPS誘導(dǎo)的腸巨噬細(xì)胞的炎癥反應(yīng)。
[Abstract]:Aim: to investigate the relationship between the inflammatory response of intestinal macrophages induced by lipopolysaccharide (LPS) and the expression of long chain non-coding RNA (lncRNA). Methods: rat intestinal macrophages were isolated and cultured. LncRNA microarray technique was used to detect the differentially expressed LNcRNAs between LPS treated rat intestinal macrophages (experimental group) and untreated rat intestinal macrophages (control group). The co-expression network of differentially expressed lncRNA-mRNA was constructed, and its biological function was predicted by go analysis and pathway analysis. Finally, partial differentially expressed lncRNA was verified by RT-qPCR. Results: compared with the control group, 357 differentially expressed lncRNA (differential expression multiple 1.5) were detected in the experimental group, including 245 up-regulated, 112 .GO and pathway analysis showed that the differentially expressed lncRNA were involved in a variety of biological processes. Including inflammatory response, immune response and apoptosis, the expression of NONMMUT024673, NONMMUT047081 may play an important role in the network. RT-qPCR was used to verify the expression of NONMMUT024673 and NONMMUT047081. The results were consistent with the gene chip data. Conclusion lncRNA expression in rat intestinal macrophages can be induced by lncRNA. These differentially expressed lncRNA may be involved in regulating the inflammatory response of intestinal macrophages induced by LPS.
【作者單位】： 江蘇大學(xué)附屬醫(yī)院普通外科;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81070287)
【分類號】：R392

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本文編號：2147720