肺炎克雷伯碳青霉烯酶與β-內(nèi)酰胺酶抑制蛋白復合物的運動模式
本文選題:炎克雷伯碳青霉烯酶 + β-內(nèi)酰胺酶抑制蛋白; 參考:《四川大學學報(自然科學版)》2017年03期
【摘要】:肺炎克雷伯碳青霉烯酶能水解臨床治療多藥耐藥菌感染的碳青霉烯類抗生素,嚴重削弱革蘭氏陰性菌感染的治療效果.開發(fā)新型有效專一的肺炎克雷伯碳青霉烯酶抑制劑有助于提高此類抗生素的治療有效率.β-內(nèi)酰胺酶抑制蛋白能競爭性抑制肺炎克雷伯碳青霉烯酶的活性.通過粗粒化模型分析肺炎克雷伯碳青霉烯酶-β-內(nèi)酰胺酶抑制蛋白復合物的運動模式.結果表明,結合β-內(nèi)酰胺酶抑制蛋白后,肺炎克雷伯碳青霉烯酶的運動模式發(fā)生較大變化.使用分子對接和分子動力學模擬方法得到一系列環(huán)硼酸類β-內(nèi)酰胺酶抑制劑與肺炎克雷伯碳青霉烯酶的結合模式,并從氫鍵和能量的角度解釋該類抑制劑的識別機制與構象-抑制活性間的關系.本研究為后續(xù)基于肺炎克雷伯碳青霉烯酶結構的抑制劑設計提供了一定的理論依據(jù).
[Abstract]:Klebsiella pneumoniae can hydrolyze carbapenem antibiotics in the treatment of multidrug resistant bacteria, which seriously weakens the therapeutic effect of Gram-negative bacteria infection. The development of new and effective Klebsiella carbapenem inhibitor is helpful to improve the therapeutic efficiency of these antibiotics. 尾-lactamase inhibitor protein can competitively inhibit the activity of Klebsiella pneumoniae carbapenem. The motility pattern of Klebsiella carbapenem-尾-lactamase inhibitor protein complex was analyzed by coarse-grained model. The results showed that the motility pattern of Klebsiella pneumoniae carbapenem was changed after binding to 尾-lactamase inhibitor protein. A series of cycloboric acid 尾 -lactamases inhibitors combined with Klebsiella carbapenem pneumoniae were obtained by molecular docking and molecular dynamics simulation. The relationship between the recognition mechanism of these inhibitors and conformation-inhibitory activity was explained from the point of view of hydrogen bond and energy. This study provides a theoretical basis for the design of inhibitors based on the structure of Klebsiella pneumoniae carbapenem.
【作者單位】: 成都大學四川抗菌素工業(yè)研究所藥食同源植物資源開發(fā)四川省高校重點實驗室;樂山師范學院化學學院;
【基金】:國家自然科學基金(11247018,11147175) 四川省教育廳科研重點項目(12ZA066) 樂山市科技計劃項目(14SZD018)
【分類號】:R378
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,本文編號:2092665
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