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克羅諾桿菌屬O抗原分型系統(tǒng)的建立及多樣性形成機制研究

發(fā)布時間:2018-06-09 02:11

  本文選題:O抗原 + 克羅諾桿菌屬; 參考:《南開大學》2012年博士論文


【摘要】:克羅諾桿菌屬是最近新分類的一個屬,目前包括7個命名的種——Cronobacter sakazakii, C. malonaticus, C. muytjensii, C. dublinensis, C.turicensis, C. condimenti,和C. universalis?肆_諾桿菌屬是一種重要的食源性致病菌,在多種食物中均分離到該屬菌株。克羅諾桿菌屬可導致任何年齡層人群的疾病,尤其是免疫力低下的嬰幼兒和老人,,能夠引起嚴重的壞死性小腸結腸炎、敗血癥和腦膜炎。盡管感染率低,但治愈率低且致死性強(在受感染的兒童中死亡率可高達33%-80%),已導致多起的腦膜炎和壞死性腸炎的散發(fā)和暴發(fā)。除C. universalis,其他6種克羅諾桿菌屬都有臨床感染的報道。C. sakazakii因其在臨床上分離的最多,臨床意義大而成為Cronobacter屬中最重要的一種菌。 O抗原是熱穩(wěn)定抗原,位于革蘭氏陰性菌表面,是脂多糖的重要組分。O抗原具有很強的免疫原性并且是一些噬菌體的作用位點,這些因素使其受到較強的選擇壓力并導致O抗原具有高度的多樣性。O抗原重復單元是高度變化的,這為革蘭氏陰性細菌的血清分型提供基礎。負責O抗原合成的基因簇通常位于細菌染色體特定位置,O抗原的多樣性主要是由于O抗原基因簇的遺傳學多樣性造成的。O抗原基因簇中的基因可以被分為3類:單糖合成酶基因、糖基轉移酶基因和寡糖單位處理酶基因。 血清學分型為細菌分類奠定了基礎,其在細菌的流行病學調(diào)查和預防控制方面具有重要的意義。目前,克羅諾桿菌屬的O抗原分型信息很少。在本研究中,我們對從不同分離地搜集到的134株Cronobacter菌株進行了鑒定,其中119株菌鑒定為C. sakazakii菌株,基于這119株C. sakazakii菌株,我們建立了一套血清學分型方法,將這119株菌分為7種血清型(O1-O7)。7種血清的效價都高達640。O2和O6血清較特異,O4血清和O1抗原、O7血清和O6抗原之間有非特異性凝集反應,O1、O3和O5類似一個血清群,彼此之間均有交叉反應,需要相互吸收才能得到特異的血清型血清。所有的119株C. sakazakii菌都分到了這7個血清型中,其中O1和O2血清型包含的菌株最多,占到菌株總數(shù)的69.7%。我們同時對C. sakazakii的O抗原基因簇進行了限制性酶切多態(tài)性分析(RFLP),結果顯示,RFLP的分型結果與血清的分型結果完全一致,這也進一步證明了血清學分型系統(tǒng)是準確的。本研究建立的C. sakazakii的血清學分型系統(tǒng)將為克羅諾桿菌屬的菌株分型提供基礎。 本研究還針對整個克羅諾桿菌屬的O抗原進行了系統(tǒng)的研究。在本研究中,我們確定了克羅諾桿菌屬的12個新的O血清型,分別為C. sakazakii O3-O7血清型、C. dublinensis O1-O3血清型、C. turicensis O2-O3血清型、C. muytjensii O2血清型和C. malonaticus O1血清型。并完成了這些血清型的O抗原基因簇的破譯和10個O抗原結構解析。從整體上分析了克羅諾桿菌屬O抗原基因簇的基本特征和特殊特征,深入分析O抗原結構和O抗原基因簇之間的對應關系,并預測了部分罕見單糖的合成途徑。本研究發(fā)現(xiàn),某些克羅諾桿菌屬的O抗原基因簇與大腸桿菌相似,例如C. malonaticus O1和E. coli O29,C. sakazakii O4和E.coli O103之間,并且這些O抗原內(nèi)部的基因的相似性明顯低于克羅諾桿菌屬和大腸桿菌持家基因之間的相似性,這意味著O抗原承受更大的選擇壓力。此外,分析顯示在克羅諾桿菌屬屬的不同種之間,存在著5對相似的O抗原基因簇,這意味著這些共享的O抗原類型可能具有共同的祖先并隨著種分化而分化形成,這些O抗原類型可能更適應克羅諾桿菌屬的生存環(huán)境。本研究在獲得克羅諾桿菌屬O抗原基因簇序列的基礎上,篩選獲得了克羅諾桿菌屬O抗原特異基因,并建立了基于特異PCR的克羅諾桿菌屬O血清型分型系統(tǒng),特異引物保守性、特異性和靈敏度試驗的結果顯示,篩選到底特異引物準確、特異,DNA靈敏度可達到0.01ng,純菌靈敏度達到103CFU。 總之,本研究首次建立了克羅諾桿菌屬O抗原分型系統(tǒng),從整體性分析了不同類型克羅諾桿菌屬O抗原基因簇及結構信息,揭示了克羅諾桿菌屬O抗原多樣性特征,并建立了基于特異PCR的克羅諾桿菌屬O抗原分型方法。這將更好地幫助我們理解克羅諾桿菌屬的O抗原多樣性形成機制,理解克羅諾桿菌屬O抗原與致病性的關系,為克羅諾桿菌屬的菌株分型、監(jiān)測及流行病學調(diào)查提供技術支持和理論基礎。
[Abstract]:Crohn ' s genus is one of the most recently taxonomic genera and currently includes 7 named species , such as sakazakii , C . cataraticus , C . muytjensii , C . duboensis , C . turicensis , C .

O - antigen is a heat stable antigen , which is located on the surface of gram - negative bacteria and is an important component of lipopolysaccharide . The O - antigen has strong immunogenicity and is the active site of some ages . These factors are highly variable , which is the basis for the serotyping of Gram - negative bacteria . The gene cluster responsible for the synthesis of O - antigen is usually located at the specific position of bacteria chromosome , and the diversity of O - antigen is mainly due to the genetic diversity of O - antigen gene cluster . The gene in O - antigen gene cluster can be divided into three classes : monosaccharide synthetase gene , glycosyltransferase gene and oligosaccharide unit processing enzyme gene .

All 119 strains of C . sakazakii were identified as C . sakazakii strain .

In this study , we identified 12 new O serotypes of Crohn ' s genus , which were C . sakazakii O3 - 7 serotype , C . dulaensis O1 - O3 serotype , C . turicensis O2 - O3 serotype , C . muytjensii O2 serotype and C .

In conclusion , this study first established the O - antigen typing system of Crohn ' s bacterium , and analyzed the genetic clusters and structural information of O - antigen of different types of Crohn ' s bacterium from the whole , revealed the characteristics of O - antigen diversity of Crohn ' s bacterium , and established a specific PCR - based method for the classification of O - antigen diversity . This would better help us understand the mechanism of O - antigen diversity in the genus Crowe , understand the relationship between O - antigen and pathogenicity of Crohn ' s bacterium , provide technical support and theoretical basis for the classification , monitoring and epidemiological investigation of strains of Crohn ' s .
【學位授予單位】:南開大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2012
【分類號】:R392.2

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 張波,李淑琴,陳冠軍,黃翠芬,張兆山;腸毒素大腸桿菌定居因子抗原基因CFA-I在痢疾桿菌中的表達[J];生物化學與生物物理學報;2001年03期

2 胡連霞;張偉;張先舟;袁耀武;張?zhí)N哲;張會彥;馬曉燕;蘇旭東;;改良環(huán)介導等溫擴增技術快速檢測嬰兒配方奶粉中的阪崎腸桿菌[J];微生物學報;2009年03期



本文編號:1998331

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