環(huán)介導(dǎo)同溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)全血日本血吸蟲DNA的研究
本文選題:血吸蟲 + 日本; 參考:《中國(guó)病原生物學(xué)雜志》2010年10期
【摘要】:目的建立一種檢測(cè)全血標(biāo)本中日本血吸蟲DNA的環(huán)介導(dǎo)同溫?cái)U(kuò)增(LAMP)方法。方法選擇日本血吸蟲基因組重復(fù)序列DNA SjR2(839~1 138 bp、563~764 bp)、SjSH7(204~399 bp)和Sj-nonLTR1(1 678~1 877 bp)的4段DNA序列作為擴(kuò)增片段,根據(jù)LAMP原理設(shè)計(jì)合成4組引物,通過對(duì)此4組引物用于DNA LAMP擴(kuò)增的敏感性和特異性進(jìn)行比較分析和檢測(cè)條件的優(yōu)化,建立特異、敏感,可用于檢測(cè)全血日本血吸蟲DNA的LAMP方法。應(yīng)用此方法對(duì)10只日本血吸蟲感染前及感染后不同時(shí)間同一家兔的配對(duì)全血DNA進(jìn)行擴(kuò)增,觀察其應(yīng)用價(jià)值。結(jié)果 4組引物中,以日本血吸蟲SjR2(839~1 138 bp)作為擴(kuò)增靶片段,可特異性擴(kuò)增日本血吸蟲中國(guó)大陸株(檢出限為10-4ngDNA)、菲律賓株和曼氏血吸蟲的基因組DNA,人全血基因組DNA、華支睪吸蟲基因組DNA、瘧原蟲基因組DNA不能擴(kuò)增。以Sj-nonLTR1(1 678~1 877 bp)為靶片段,LAMP擴(kuò)增無特異性。以SjR2(563~764 bp)和SjSH7(204~399bp)為靶片段,可特異性擴(kuò)增日本血吸蟲中國(guó)大陸株基因組DNA(檢出限為10-6ng和10-3ng)及菲律賓株基因組DNA,人全血基因組DNA、華支睪吸蟲基因組DNA、曼氏血吸蟲基因組DNA和瘧原蟲基因組DNA不能擴(kuò)增。用SjR2(839~1 138 bp)引物對(duì)10只日本血吸蟲感染兔不同時(shí)間的配對(duì)全血標(biāo)本進(jìn)行擴(kuò)增,感染前血樣均為陰性,感染后連續(xù)5周全血基因組DNA的濃縮標(biāo)本均為陽性,非濃縮標(biāo)本部分陽性。結(jié)論本研究建立了檢測(cè)兔全血日本血吸蟲兔基因組DNA的LAMP方法。該方法對(duì)濃縮DNA標(biāo)本的檢出效率高于非濃縮標(biāo)本,具有血吸蟲感染早期診斷價(jià)值。
[Abstract]:Objective to establish a method for the detection of Schistosoma japonicum DNA in whole blood samples. Methods four segments of DNA sequences of Schistosoma japonicum genomic repeat sequence (DNA SjR2(839~1 138 BP 563, 764 BP) and Sj-nonLTR1(1 678 1 877 BP) were selected as amplification fragments. Four sets of primers were designed and synthesized according to the principle of LAMP. The sensitivity and specificity of the four primers for DNA LAMP amplification were compared and the detection conditions were optimized to establish a specific and sensitive LAMP method for the detection of DNA of whole blood Schistosoma japonicum. This method was used to amplify the matched whole blood DNA of 10 rabbits before and after infection of Schistosoma japonicum. Results among the four primer groups, Schistosoma japonicum SjR2(839~1 138bp was used as the target fragment. The Chinese mainland strain of Schistosoma japonicum (the detection limit is 10-4 ng DNA), the Philippine strain and Schistosoma mansoni genomic DNA, the human whole blood genomic DNA, the Clonorchis sinensis genome DNA, the Plasmodium falciparum genome DNA can not be amplified. The amplification of lamp with Sj-nonLTR1(1 678 1 877 BP as the target fragment was not specific. Using SjR2(563~764 bp) and SjSH7 (204B) 399bp as target fragments, The genomic DNAs of Schistosoma japonicum Chinese mainland strain (detection limit: 10-6ng and 10-3 ng) and Philippine strain could be amplified specifically. The genomic DNA of human whole blood, clonorchiasis sinensis, Schistosoma mansoni and Plasmodium falciparum genome DNA could not be amplified. The whole blood samples of 10 rabbits infected with Schistosoma japonicum at different time were amplified with SjR2(839~1 138 BP primer. The blood samples were all negative before infection. The concentrated samples of whole blood genomic DNA were positive for 5 weeks after infection, and the non-concentrated samples were partially positive. Conclusion in this study, a LAMP method for the detection of genomic DNA of rabbits with whole blood Schistosoma japonicum was established. The efficiency of this method in detecting concentrated DNA samples is higher than that in non-concentrated specimens, and it is valuable for early diagnosis of schistosomiasis infection.
【作者單位】: 南京醫(yī)科大學(xué)病原生物學(xué)系;衛(wèi)生部重要寄生蟲病預(yù)防與控制高技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室江蘇省血吸蟲病防治研究所;
【基金】:國(guó)家“十一·五”科技重大專項(xiàng)項(xiàng)目(No.2008ZX10004-011) 江蘇省衛(wèi)生廳科技項(xiàng)目(No.H200738) 江蘇省科技廳公益專項(xiàng)基金項(xiàng)目(No.BM2007704) 江蘇省醫(yī)學(xué)重點(diǎn)人才基金項(xiàng)目(No.RC2007095)
【分類號(hào)】:R532.21
【參考文獻(xiàn)】
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4 毛小峰;磁共振T_2加權(quán)像結(jié)合磁共振胰膽管成像對(duì)Mirizzi綜合征的診斷價(jià)值[D];山西醫(yī)科大學(xué);2007年
5 唐曉波;膝關(guān)節(jié)半月板損傷的診斷對(duì)比研究[D];蘇州大學(xué);2009年
6 張輝;血清ICTP與Tracp 5b聯(lián)合應(yīng)用在乳腺癌骨轉(zhuǎn)移診斷中的價(jià)值[D];中南大學(xué);2009年
7 金霞;血漿腦鈉肽對(duì)急性心肌梗死早期診斷價(jià)值的臨床研究[D];中國(guó)醫(yī)科大學(xué);2009年
8 許傳軍;MSCT及多平面重組技術(shù)在腸梗阻診斷中的應(yīng)用研究[D];泰山醫(yī)學(xué)院;2009年
9 張春福;DSA對(duì)小腸出血的診斷價(jià)值[D];吉林大學(xué);2004年
10 盛旅德;不同影像技術(shù)對(duì)慢性縮窄性心包炎診斷價(jià)值的對(duì)比研究[D];南昌大學(xué);2010年
,本文編號(hào):1980146
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