使用高通量測序技術測量人腦皮層中精神疾病候選基因mRNA等位基因表達不平衡
本文選題:高通量測序 + 人腦皮層; 參考:《復旦大學》2011年碩士論文
【摘要】:[目的]發(fā)展一種高通量測量人腦皮層等位基因特異mRNA表達不平衡的手段。 [方法]建立劑量敏感基因數據庫。抽取總mRNA并逆轉錄,PCR擴增包含SNP位點的片斷,連接識別片斷并用Solexa Sequencing技術測序。計算等位基因的表達差異。[結果]共測量了73個和各類精神疾病相關的劑量敏感基因,其中71個取得了理想結果。與原有熒光方法相比,重復性好,測量精度顯著提高。[結論]該技術是一種更理想的高通量測量等位基因表達不平衡的手段。疾病相關的劑量敏感基因中出現等位基因表達不平衡的頻率較普通基因更高。
[Abstract]:Objective: to develop a high-throughput method for measuring the imbalance of allelic specific mRNA expression in human brain cortex. [methods] A dose-sensitive gene database was established. The total mRNA fragment was amplified by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and the fragment was identified and sequenced by Solexa Sequencing technique. The difference of allele expression was calculated. [results] A total of 73 dose-sensitive genes associated with various mental disorders were measured, of which 71 achieved ideal results. Compared with the original fluorescence method, the method has better repeatability and higher precision. [conclusion] this technique is an ideal method for high-throughput measurement of allelic imbalance. The frequency of unbalanced expression of alleles in disease-related dose sensitive genes was higher than that in common genes.
【學位授予單位】:復旦大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2011
【分類號】:R3416;Q78
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,本文編號:1973489
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