使用高通量測序技術(shù)測量人腦皮層中精神疾病候選基因mRNA等位基因表達(dá)不平衡
本文選題:高通量測序 + 人腦皮層 ; 參考:《復(fù)旦大學(xué)》2011年碩士論文
【摘要】:[目的]發(fā)展一種高通量測量人腦皮層等位基因特異mRNA表達(dá)不平衡的手段。 [方法]建立劑量敏感基因數(shù)據(jù)庫。抽取總mRNA并逆轉(zhuǎn)錄,PCR擴(kuò)增包含SNP位點(diǎn)的片斷,連接識(shí)別片斷并用Solexa Sequencing技術(shù)測序。計(jì)算等位基因的表達(dá)差異。[結(jié)果]共測量了73個(gè)和各類精神疾病相關(guān)的劑量敏感基因,其中71個(gè)取得了理想結(jié)果。與原有熒光方法相比,重復(fù)性好,測量精度顯著提高。[結(jié)論]該技術(shù)是一種更理想的高通量測量等位基因表達(dá)不平衡的手段。疾病相關(guān)的劑量敏感基因中出現(xiàn)等位基因表達(dá)不平衡的頻率較普通基因更高。
[Abstract]:Objective: to develop a high-throughput method for measuring the imbalance of allelic specific mRNA expression in human brain cortex. [methods] A dose-sensitive gene database was established. The total mRNA fragment was amplified by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and the fragment was identified and sequenced by Solexa Sequencing technique. The difference of allele expression was calculated. [results] A total of 73 dose-sensitive genes associated with various mental disorders were measured, of which 71 achieved ideal results. Compared with the original fluorescence method, the method has better repeatability and higher precision. [conclusion] this technique is an ideal method for high-throughput measurement of allelic imbalance. The frequency of unbalanced expression of alleles in disease-related dose sensitive genes was higher than that in common genes.
【學(xué)位授予單位】:復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類號】:R3416;Q78
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,本文編號:1973489
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