空腸彎曲菌AhpC蛋白B細(xì)胞抗原表位預(yù)測及抗原性分析
本文選題:空腸彎曲菌 切入點(diǎn):表位 出處:《中國人獸共患病學(xué)報》2017年10期
【摘要】:目的利用生物信息學(xué)預(yù)測分析空腸彎曲菌AhpC的跨膜結(jié)構(gòu)、信號肽及B細(xì)胞抗原表位,并分析空腸彎曲菌AhpC優(yōu)勢B細(xì)胞抗原表位的抗原性,為后續(xù)疫苗研究提供依據(jù)。方法使用TMHMM Server V2.0、SignalP 4.1、IEDB等生物信息學(xué)分析軟件對空腸彎曲菌AhpC進(jìn)行蛋白跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測、信號肽及線性B細(xì)胞抗原表位進(jìn)行預(yù)測分析。分別以原核表達(dá)的空腸彎曲菌AhpC蛋白和化學(xué)合成的表位肽為抗原,空腸彎曲菌AhpC抗體為一抗,通過ELISA及Dot blot對優(yōu)勢線性B細(xì)胞抗原表位的抗原性進(jìn)行分析及篩選。結(jié)果生物信息學(xué)預(yù)測結(jié)果表明AhpC定位于空腸彎曲菌外膜,無跨膜結(jié)構(gòu),無信號肽,同時該蛋白中存在7個的B細(xì)胞線性表位。經(jīng)Dot blot和ELISA檢測發(fā)現(xiàn)其中AhpC4-16表位具有較強(qiáng)的抗原性,為優(yōu)勢表位。結(jié)論空腸彎曲菌AhpC保守存在于細(xì)菌表面,存在1個優(yōu)勢的B細(xì)胞線性抗原表位(AhpC4-16),可用于后續(xù)的疫苗開發(fā)研究。
[Abstract]:Objective to predict and analyze the transmembrane structure, signal peptide and B cell antigen epitopes of Campylobacter jejuni AhpC by bioinformatics, and to analyze the antigenicity of dominant B cell epitopes of Campylobacter jejuni AhpC. Methods TMHMM Server V2.0 Signal P 4.1 IEDB and other bioinformatics software were used to predict the protein transmembrane structure of Campylobacter jejuni AhpC. The signal peptide and linear B cell antigen epitope were predicted and analyzed. The prokaryotic expressed AhpC protein and the chemically synthesized epitope peptide were used as antigens, respectively, and the AhpC antibody against Campylobacter jejuni was a primary antibody against Campylobacter jejuni. The antigenicity of dominant linear B cell epitopes was analyzed and screened by ELISA and Dot blot. Results the bioinformatics prediction results showed that AhpC was located in the outer membrane of Campylobacter jejuni with no transmembrane structure and no signal peptide. At the same time, there were 7 B cell linear epitopes in the protein. The AhpC4-16 epitopes were found to have strong antigenicity by Dot blot and ELISA. Conclusion the AhpC of Campylobacter jejuni is conserved on the surface of bacteria. There is a dominant B cell epitope AhpC4-16, which can be used for further vaccine development.
【作者單位】: 金華職業(yè)技術(shù)學(xué)院醫(yī)學(xué)院分子生物學(xué)實驗室;金華職業(yè)技術(shù)學(xué)院人畜共患病研究所;
【基金】:浙江省科技計劃項目(No.2016C33229);浙江省科技計劃項目(No.2016C37093) 金華市科技研究計劃項目(No.2016-3-002)聯(lián)合資助~~
【分類號】:R392
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,本文編號:1680716
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