受精15.5天胎鼠血清和新生鼠血清蛋白質(zhì)組學(xué)比較研究
本文選題:血漿蛋白質(zhì)組 切入點(diǎn):發(fā)育 出處:《北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院》2011年博士論文 論文類(lèi)型:學(xué)位論文
【摘要】:血液是人體的重要體液,包含了來(lái)自全身各組織分泌的蛋白和細(xì)胞死亡滲出的蛋白,在某種程度上可以說(shuō)血液是人體的窗口。在胎兒發(fā)育過(guò)程中,尤其是胎兒發(fā)育中后期,各器官無(wú)論在形態(tài)還是在功能都發(fā)生了巨大的變化;谝嘿|(zhì)聯(lián)用的蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)能對(duì)蛋白質(zhì)——生命功能的具體執(zhí)行者,進(jìn)行高通量、大規(guī)模的全面研究。通過(guò)使用液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)不同時(shí)期胎鼠血清進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定分析,能夠更好的了解生命發(fā)育的過(guò)程。 考慮到胎鼠血清個(gè)體差異,分別對(duì)受精15.5天胎鼠和新生鼠血清的個(gè)體樣本和混合樣本進(jìn)行質(zhì)譜鑒定。以混合樣本三次質(zhì)譜鑒定的變異系數(shù)(作為實(shí)驗(yàn)方法的差異)為對(duì)照,計(jì)算個(gè)體樣本變異系數(shù)與混合樣本變異系數(shù)的比值,獲得每個(gè)蛋白在去除質(zhì)譜儀器等實(shí)驗(yàn)誤差造成的影響后,在蛋白質(zhì)組學(xué)水平上進(jìn)行個(gè)體差異性評(píng)價(jià)。 應(yīng)用毛細(xì)管液相色譜(反相)和質(zhì)譜聯(lián)用方法,在質(zhì)譜鑒定可信度為99%的條件下,在個(gè)體樣本中,共鑒定的669個(gè)蛋白,對(duì)鑒定的蛋白進(jìn)行雙側(cè)T檢驗(yàn),在95%的可信區(qū)間內(nèi)分別有35個(gè)蛋白顯著性上升和58個(gè)蛋白顯著性降低。對(duì)鑒定的蛋白進(jìn)行功能注釋,并對(duì)在血漿中參與運(yùn)輸、防御、酶活性調(diào)節(jié)、凝血等生物學(xué)過(guò)程的蛋白進(jìn)行分析,共發(fā)現(xiàn)9種補(bǔ)體分子,均上升,其中6種出現(xiàn)顯著性上升;酶活性調(diào)節(jié)物分子中4種顯著性下降,13種顯著性上升;載脂蛋白分子顯著減少,11種載脂蛋白分子中8種顯著性下降,1種顯著性升高;同時(shí)發(fā)現(xiàn)不同種類(lèi)血紅蛋白分子出現(xiàn)改變。 蛋白翻譯后修飾對(duì)蛋白結(jié)構(gòu)和功能起著重要的調(diào)節(jié)作用。通過(guò)對(duì)不同時(shí)期血清混合樣本蛋白的翻譯后修飾的研究,發(fā)現(xiàn)了50種不同的修飾。通過(guò)對(duì)修飾位點(diǎn)的定量比較,發(fā)現(xiàn)受精15.5天和新生鼠血清蛋白翻譯后修飾的狀態(tài)不同,為以后研究翻譯后修飾在血清發(fā)育中的作用提供線索。
[Abstract]:Blood is the important body fluid of the human body. It contains proteins secreted from various tissues of the whole body and proteins exudated by cell death. To some extent, blood is the window of the human body. In the course of fetal development, especially in the middle and late stages of fetal development, Great changes have taken place in both morphology and function of the organs. Proteomics analysis based on liquid-mass spectrometry can perform high throughput on the specific implementers of protein-life function. Through the proteomics identification and analysis of fetal rat serum at different stages, we can better understand the process of life development. Taking into account the individual difference of fetal rat serum, the individual and mixed samples of fetal mouse and newborn mouse serum on the 15.5 day of fertilization were identified by mass spectrometry, and the coefficient of variation (as the difference of experimental method) of the three times mass spectrometry identification of mixed sample was compared. The ratio of the coefficient of variation of individual samples to that of mixed samples was calculated and the individual differences were evaluated at proteomics level after removing the effects of experimental errors such as mass spectrometer. Capillary liquid chromatography (RP-MS) and mass spectrometry were used to detect 669 proteins in individual samples under the condition that the reliability of mass spectrometry was 99%. 35 proteins increased significantly and 58 proteins decreased significantly in the confidence interval of 95%. The identified proteins were annotated and regulated to participate in transport, defense and enzyme activity in plasma. In the analysis of proteins in biological processes such as coagulation, 9 complement molecules were found to be increased, among which 6 were significantly increased, 4 of the enzyme activity regulators were significantly decreased and 13 were significantly increased. Apolipoprotein molecules decreased significantly in 8 out of 11 apolipoprotein molecules and increased significantly in 1 out of 11 apolipoprotein molecules, and different hemoglobin molecules were found to change. Posttranslational modification of proteins plays an important role in regulating the structure and function of proteins. Through the study of post-translational modification of serum mixed sample proteins at different stages, 50 different modifications were found. It was found that the posttranslational modification of serum proteins in 15.5 days of fertilization was different from that in newborn mice, which provided clues for further study on the role of posttranslational modification in serum development.
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類(lèi)號(hào)】:R321.2;Q51
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,本文編號(hào):1580844
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