發(fā)布時間：2018-01-27 04:52

  本文關(guān)鍵詞： 隨機寡核苷酸文庫 血漿 蛋白質(zhì) 高豐度 低豐度 譜圖數(shù)量　出處：《色譜》2017年03期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：基于隨機寡核苷酸與蛋白質(zhì)之間的離子、親和、疏水、氫鍵等相互作用力及多種空間結(jié)構(gòu)作用,發(fā)展了一種基于隨機寡核苷酸文庫作為配基的新型血漿樣品處理方法。采用寡核苷酸文庫修飾的磁性顆粒(MNP@ssDNA)材料,在生理緩沖體系條件下捕獲血漿樣品中的蛋白質(zhì)。比較了兩種洗脫體系的洗脫效果,并利用nano-RPLC-ESIMS/MS對獲得的蛋白質(zhì)酶解液組分進行分析。結(jié)果表明,MNP@ssDNA材料處理后的血漿蛋白質(zhì)鑒定數(shù)量提升了約29.5%,兩種洗脫體系呈現(xiàn)良好的互補性(26.7%)。血漿中前10種高豐度蛋白質(zhì)的譜圖占有率從處理前的31.82%降低到21.31%(洗脫體系1)和26.20%(洗脫體系2)。在鑒定到的蛋白質(zhì)中,豐度最低的蛋白質(zhì)在血漿中的質(zhì)量濃度約為0.29 ng/mL,該蛋白質(zhì)僅在MNP@ssDNA材料處理后被鑒定到。結(jié)果證明MNP@ssDNA策略不僅能有效降低血漿中高豐度蛋白質(zhì)的豐度,也為低豐度蛋白質(zhì)的深度挖掘提供了新的思路。
[Abstract]:Based on the interaction between random oligonucleotide and protein, such as ion, affinity, hydrophobic, hydrogen bond and so on, as well as a variety of spatial structures. A novel plasma sample processing method based on random oligonucleotide library was developed. The protein in plasma samples was captured under physiological buffer system. The elution effects of two elution systems were compared. Nano-RPLC-ESIMS/MS was used to analyze the components of protein hydrolysate. The number of identified plasma proteins increased by about 29.5% after treatment with MNP@ssDNA materials. The two elution systems showed good complementarities. The percentage of the first 10 kinds of high abundance protein in plasma decreased from 31.82% before treatment to 21.31% (elution system 1). And 26.20% (elution system 2) in identified proteins. The lowest concentration of protein in plasma was about 0.29 ng/mL. The protein was identified only after MNP@ssDNA treatment. The results showed that MNP@ssDNA strategy could not only effectively reduce the abundance of high abundance protein in plasma. It also provides a new idea for deep mining of low abundance protein.
【作者單位】： 中國煙草總公司鄭州煙草研究院;中國科學院大連化學物理研究所中科院分離分析化學重點實驗室國家色譜研究分析中心;鄭州大學第一附屬醫(yī)院醫(yī)學研究中心;
【基金】：國家自然科學基金項目(21505158,81600046)~~
【分類號】：R392-33
【正文快照】： *通訊聯(lián)系人.Tel:(0411)84379720,E-mail:lihuazhang@dicp.ac.cn.血漿在生命科學及臨床醫(yī)學領(lǐng)域具有重要的研究價值,但血漿內(nèi)蛋白質(zhì)的組成復(fù)雜,濃度動態(tài)范圍寬。據(jù)文獻[1,2]報道,血漿中前10種高豐度蛋白質(zhì)占蛋白質(zhì)總含量的90%,前22種高豐度蛋白質(zhì)占蛋白質(zhì)總含量的99%,而血漿中

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3 張芝蘭;高蘭興;王宗印;顧景范;;燒傷與營養(yǎng)代謝的研究 Ⅰ、實驗性燒傷對血漿蛋白質(zhì)的影響[A];中國生理科學會第三屆全國營養(yǎng)學術(shù)會議暨營養(yǎng)學會成立大會論文摘要匯編[C];1981年

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本文編號：1467620