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流體剪切力對內(nèi)皮細胞miR-21和miR-199a表達的影響

發(fā)布時間:2018-01-18 05:18

  本文關(guān)鍵詞:流體剪切力對內(nèi)皮細胞miR-21和miR-199a表達的影響 出處:《生物信息學(xué)》2016年01期  論文類型:期刊論文


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【摘要】:為探討流體剪切力對內(nèi)皮細胞micorRNAs表達的影響。采用旋轉(zhuǎn)錐形圓盤剪切力系統(tǒng)對內(nèi)皮細胞分別加載低(4dyn/cm2)、中(10 dyn/cm2)和高(15 dyn/cm2)3種不同梯度的剪切力作用24h。對照組未加載剪切力。采用高通量篩選芯片檢測microRNAs表達變化,qRT-PCR驗證,并進行生物信息學(xué)分析。與對照組比較,低剪切力組表達差異的microRNAs有33個(FC1.5或0.5倍,P0.05),其中28個上調(diào),5個下調(diào);中剪切力組表達差異的microRNAs有8個(FC1.5或0.5倍,P0.05),其中6個上調(diào),2個下調(diào);高剪切力組表達差異的microRNAs有31個(FC1.5或0.5倍,P0.05),其中25個上調(diào),6個下調(diào)。miR-21在高剪切力組中上調(diào)最顯著(FC=0.026),在低剪切力組中顯著下調(diào)(FC=3.531)。miR-199a在低剪切力組中上調(diào)最顯著(FC=0.075),在高剪切力組中顯著下調(diào)(FC=3.031)。表達差異的microRNA的靶基因主要與內(nèi)皮細胞的力學(xué)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞跨膜遷移、鈣離子信號通路、細胞內(nèi)吞作用等相關(guān)。流體剪切力可誘導(dǎo)內(nèi)皮細胞miR-21和miR-199a表達發(fā)生改變。
[Abstract]:In order to investigate the effect of fluid shear stress on the expression of micorRNAs in endothelial cells, a rotating conical disc shear stress system was used to load endothelial cells with 4 dyn / cm ~ (2), respectively. 10 dyn / cm ~ (2) and 15 dyn / cm ~ (2)). The shear stress of three different gradients was applied for 24 h, and the control group was not loaded with shear stress. High throughput screening microarray was used to detect the expression of microRNAs. Compared with the control group, 33 microRNAs with low shear stress were confirmed by qRT-PCR and analyzed by bioinformatics. 28 of them were up-regulated and 5 were downgraded; In the middle shear stress group, the expression of microRNAs was 1. 5 or 0. 5 times higher than that of the control group, among which 6 were up-regulated and 2 were down-regulated. In the high shear stress group, there were 31 microRNAs with FC1.5 or 0.5 times P0.05A, 25 of which were up-regulated. Six down-regulated .miR-21 were significantly up-regulated in high shear stress group (FC0.026). In the low shear stress group, the up-regulation of FCU 3.531 and miR-199a was significantly lower in the low shear stress group than that in the low shear stress group (0.075). In the high shear stress group, the target genes of the differentially expressed microRNA were significantly down-regulated. The target genes were mainly related to the mechanical signal transduction of endothelial cells, cell transmembrane migration and calcium signaling pathway. Fluid shear stress could induce changes of miR-21 and miR-199a expression in endothelial cells.
【作者單位】: 山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所;濟南大學(xué)山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院;山東省齊河縣人民醫(yī)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項目(81470489) 山東省自然科學(xué)基金項目(ZR2014HM098) 山東省醫(yī)藥衛(wèi)生科技發(fā)展計劃項目(2014WS0312,2014WS0316)
【分類號】:R3416
【正文快照】: 血管內(nèi)皮細胞(Endothelial cell,EC)是連接血流和血管壁的重要結(jié)構(gòu),是血流剪切力(Shearstress,SS)作用的靶細胞,其功能障礙是導(dǎo)致動脈粥樣硬化形成的關(guān)鍵因素。研究表明[1-3],不同梯度的血流剪切力對內(nèi)皮細胞的影響不同。microRNA是一類高度保守、內(nèi)源性非蛋白編碼小分子RNA,

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