本文關(guān)鍵詞：結(jié)合蛋白質(zhì)互作信息構(gòu)建擴(kuò)展的人類(lèi)疾病網(wǎng)絡(luò)　出處：《哈爾濱醫(yī)科大學(xué)》2011年碩士論文　論文類(lèi)型：學(xué)位論文

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【摘要】：自從人類(lèi)疾病網(wǎng)絡(luò)的概念提出以來(lái)，它已經(jīng)成為發(fā)現(xiàn)疾病與疾病間聯(lián)系的一個(gè)有力工具。越來(lái)越多的研究表明，，共享相似或相同疾病表型的基因更可能編碼相互間發(fā)生互作的蛋白質(zhì)。因此，蛋白互作數(shù)據(jù)可以幫助我們進(jìn)一步地理解那些具有重疊的臨床表型的疾病間的關(guān)系。在我們的研究中，我們將疾病基因信息和蛋白質(zhì)互作信息結(jié)合起來(lái)構(gòu)建擴(kuò)展的人類(lèi)疾病網(wǎng)絡(luò)，并對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了拓?fù)涮卣骱凸δ軐傩缘姆治�。由上述分析我們發(fā)現(xiàn)，我們所構(gòu)建的擴(kuò)展的人類(lèi)疾病網(wǎng)絡(luò)是層次性的，且大多數(shù)疾病與少數(shù)其它疾病相關(guān)，而一部分疾病表型卻與多數(shù)不同疾病相關(guān)。其次，我們也發(fā)現(xiàn)屬于同一疾病類(lèi)的疾病傾向于聚集成緊密連接的集團(tuán)，且與同一疾病相關(guān)的基因趨于在功能上存在一定的相關(guān)性。通過(guò)比較擴(kuò)展的人類(lèi)疾病網(wǎng)絡(luò)與原始的人類(lèi)疾病網(wǎng)絡(luò)（僅根據(jù)疾病基因信息構(gòu)建），我們發(fā)現(xiàn)二者在所有的拓?fù)涮卣骱凸δ軐傩陨隙际歉叨纫恢碌�。這從某種程度上說(shuō)明，我們所構(gòu)建的擴(kuò)展的人類(lèi)疾病網(wǎng)絡(luò)是可靠的。在擴(kuò)展的人類(lèi)疾病網(wǎng)絡(luò)中，我們還可以發(fā)現(xiàn)一些由于共享了根據(jù)蛋白質(zhì)互作信息被擴(kuò)展到網(wǎng)絡(luò)中的基因而建立的疾病間的新聯(lián)系。最后，我們希望這一研究可以為臨床醫(yī)師和醫(yī)學(xué)研究者提供一個(gè)有價(jià)值的參考。
[Abstract]:Since the concept of human disease network was put forward, it has become a powerful tool to discover the link between disease and disease. Genes that share similar or identical disease phenotypes are more likely to encode proteins that interact with each other. The data on protein interactions can help us further understand the relationship between diseases with overlapping clinical phenotypes. We combine disease gene information with protein interaction information to construct an extended human disease network and analyze the topological characteristics and functional properties of the network. Our expanded human disease network is hierarchical, and most diseases are associated with a few other diseases, while some disease phenotypes are associated with most different diseases. We also found that diseases belonging to the same disease category tend to converge into tightly connected groups. And the genes associated with the same disease tend to have some functional correlation. By comparing the extended human disease network with the original human disease network (only based on disease gene information). We find that the two are highly consistent in all the topological features and functional attributes. This indicates to some extent that the extended human disease network we have constructed is reliable in the extended human disease network. We can also find new links between diseases that share genes that are spread to the network based on information about protein interactions. Finally. We hope that this study will provide a valuable reference for clinicians and medical researchers.
【學(xué)位授予單位】：哈爾濱醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2011
【分類(lèi)號(hào)】：R341

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本文編號(hào)：1405532