發(fā)布時間：2018-01-10 14:05

  本文關鍵詞：結合蛋白質互作信息構建擴展的人類疾病網絡　出處：《哈爾濱醫(yī)科大學》2011年碩士論文　論文類型：學位論文

  更多相關文章： 擴展的人類疾病網絡 蛋白質互作 疾病-疾病關聯(lián) 疾病組 生物網絡

【摘要】：自從人類疾病網絡的概念提出以來，它已經成為發(fā)現疾病與疾病間聯(lián)系的一個有力工具。越來越多的研究表明，，共享相似或相同疾病表型的基因更可能編碼相互間發(fā)生互作的蛋白質。因此，蛋白互作數據可以幫助我們進一步地理解那些具有重疊的臨床表型的疾病間的關系。在我們的研究中，我們將疾病基因信息和蛋白質互作信息結合起來構建擴展的人類疾病網絡，并對網絡進行了拓撲特征和功能屬性的分析。由上述分析我們發(fā)現，我們所構建的擴展的人類疾病網絡是層次性的，且大多數疾病與少數其它疾病相關，而一部分疾病表型卻與多數不同疾病相關。其次，我們也發(fā)現屬于同一疾病類的疾病傾向于聚集成緊密連接的集團，且與同一疾病相關的基因趨于在功能上存在一定的相關性。通過比較擴展的人類疾病網絡與原始的人類疾病網絡（僅根據疾病基因信息構建），我們發(fā)現二者在所有的拓撲特征和功能屬性上都是高度一致的。這從某種程度上說明，我們所構建的擴展的人類疾病網絡是可靠的。在擴展的人類疾病網絡中，我們還可以發(fā)現一些由于共享了根據蛋白質互作信息被擴展到網絡中的基因而建立的疾病間的新聯(lián)系。最后，我們希望這一研究可以為臨床醫(yī)師和醫(yī)學研究者提供一個有價值的參考。
[Abstract]:Since the concept of human disease network was put forward, it has become a powerful tool to discover the link between disease and disease. Genes that share similar or identical disease phenotypes are more likely to encode proteins that interact with each other. The data on protein interactions can help us further understand the relationship between diseases with overlapping clinical phenotypes. We combine disease gene information with protein interaction information to construct an extended human disease network and analyze the topological characteristics and functional properties of the network. Our expanded human disease network is hierarchical, and most diseases are associated with a few other diseases, while some disease phenotypes are associated with most different diseases. We also found that diseases belonging to the same disease category tend to converge into tightly connected groups. And the genes associated with the same disease tend to have some functional correlation. By comparing the extended human disease network with the original human disease network (only based on disease gene information). We find that the two are highly consistent in all the topological features and functional attributes. This indicates to some extent that the extended human disease network we have constructed is reliable in the extended human disease network. We can also find new links between diseases that share genes that are spread to the network based on information about protein interactions. Finally. We hope that this study will provide a valuable reference for clinicians and medical researchers.
【學位授予單位】：哈爾濱醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2011
【分類號】：R341

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本文編號：1405532