本文關鍵詞：細粒棘球絳蟲myophilin的抗原表位預測　出處：《中國病原生物學雜志》2017年01期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：目的應用生物信息學軟件預測細粒棘球絳蟲親肌肉蛋白myophilin的二級結(jié)構(gòu)及B、T細胞抗原表位,為其保護性抗原表位篩選提供依據(jù)。方法從Genbank中獲取myophilin的氨基酸序列,采用SOPMA軟件預測其二級結(jié)構(gòu);采用LEPS和ABCpred軟件聯(lián)合預測其B細胞抗原表位;采用IEDB和SYFPEITHI軟件聯(lián)合預測其T細胞抗原表位。結(jié)果α螺旋、β折疊、無規(guī)則卷曲和β轉(zhuǎn)角在myophilin二級結(jié)構(gòu)中所占的比例分別為47.89%、10.00%、30.53%和11.58%;潛在的B細胞抗原表位分別為19~27、41~48、92~101、110~118、128~137和155~162;潛在的T細胞抗原表位為9~18、140~148和157~165氨基酸序列。結(jié)論 myophilin蛋白可能有6個B細胞抗原表位和3個T細胞抗原表位,有望用作免疫診斷抗原和疫苗候選抗原。
[Abstract]:Objective bioinformatics software was applied to predict the two level structure of the muscle protein myophilin of Echinococcus granulosus and the epitope of B and T cells, so as to provide evidence for screening the protective epitopes of Echinococcus granulosus. Methods the amino acid sequences of myophilin were obtained from Genbank. The secondary structure was predicted by SOPMA software. The B cell epitopes were predicted by LEPS and ABCpred software. The T cell epitopes were predicted by IEDB and SYFPEITHI software. The alpha helix and beta folding, random coil and beta angle for myophilin two level structure in the proportion was 47.89%, 10%, 30.53% and 11.58%; the potential B cell epitopes were 19~27, 41~48, 92~101, 110~118, 128~137 and 155~162; the potential T cell epitopes, 9~18 140~148 and 157~165 amino acid sequence. Conclusion myophilin protein may have 6 B cell antigen epitopes and 3 T cell antigen epitopes, which are expected to be used as immuno diagnostic antigen and vaccine candidate antigen.
【作者單位】： 青海大學生態(tài)環(huán)境工程學院;青海大學醫(yī)學院基礎醫(yī)學研究中心;
【基金】：國家自然科學基金項目(No.31260015) 青海省科技廳項目(No.2016-ZJ-746)
【分類號】：R392
【正文快照】： 棘球蚴感染人體可引起包蟲病,該病在我國西北畜牧地區(qū)廣泛流行,對當?shù)鼐用窠】岛托竽翗I(yè)發(fā)展危害極其嚴重[1]。可靠的診斷方法和有效的預防措施對該病的防控至關重要,其中免疫診斷和疫苗預防是一種切實可行的途徑[2]。親肌肉蛋白(myophilin)是棘球絳蟲的一種天然抗原,有較強的

【參考文獻】

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【共引文獻】

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本文編號：1346414