發(fā)布時間：2017-11-13 19:04

  本文關(guān)鍵詞：結(jié)核分枝桿菌MT3876蛋白的生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的應(yīng)用生物信息學(xué)分析軟件預(yù)測結(jié)核分枝桿菌MT3876基因編碼的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫獲取MT3876基本的基因信息;應(yīng)用ProParam預(yù)測MT3876蛋白的理化性質(zhì);應(yīng)用SignalP 4.0及TMHMM分析其信號肽及跨膜區(qū);利用在線分析Expasy工具分析蛋白二級結(jié)構(gòu)并建立蛋白的三級結(jié)構(gòu)模型;利用ABCpred、SYFPEITHI及NetMHCIIpan 3.1Server分析蛋白抗原表位,尋找最佳B細胞及T細胞抗原位點。結(jié)果 MT3876編碼結(jié)核分枝桿菌假想蛋白MT3876具有172個氨基酸殘基。該蛋白無信號肽,位于胞壁,跨膜結(jié)構(gòu)不明顯。二級結(jié)構(gòu)中無規(guī)卷曲約占52.33%,結(jié)構(gòu)疏松。MT3876具有潛在的B細胞抗原表75~90、103~118、17~32、140~155、96~113、123~142及37~54等位點,T細胞抗原表位1~10、80~88、114~118、133~141及149~172等。結(jié)論生物信息學(xué)預(yù)測MT3876基因編碼的蛋白質(zhì)具有潛在的B、T細胞抗原表位,可作為研發(fā)免疫診斷方法的侯選分子靶標。
【作者單位】： 濰坊醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗學(xué)系;濰坊醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)教研室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(No.81170080,81470001) 濰坊醫(yī)學(xué)院2011年科技創(chuàng)新前沿探索重點研究項目(No.K11TS1004)
【分類號】：R378.911
【正文快照】： ***結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuber-culosis,MTB)引起的慢性傳染性疾病。世界衛(wèi)生組織結(jié)核報告中指出2014年全球150萬人死于結(jié)核病,其中包括40萬HIV陽性的結(jié)核病患者。近年來,由于多耐藥性結(jié)核分枝桿菌菌株的出現(xiàn)和HIV感染導(dǎo)致的免疫力低下人群增多,使得結(jié)核病發(fā)

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 劉志輝;劉玉美;孟繁榮;謝貝;王楠;鄧曉華;吳玲;張言斌;譚守勇;;4種蛋白質(zhì)/多肽在結(jié)核病患者與健康人血清中的表達和意義[J];實用醫(yī)學(xué)雜志;2014年23期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 張霞;結(jié)核性胸腔積液與惡性胸腔積液的比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D];北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所;2014年

2 徐丹丹;肺結(jié)核病血清生物學(xué)標志物的篩選、鑒定及FCN2 SNPs與肺結(jié)核病易感性研究[D];浙江大學(xué);2015年

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 梁丕;;人血管內(nèi)皮生長因子的生物信息學(xué)分析[J];吉林醫(yī)學(xué);2013年36期

2 李建強;李薇;張予超;高晶晶;趙祖波;楊俊杰;;中國EV71病毒VP1蛋白生物信息學(xué)分析[J];微生物學(xué)免疫學(xué)進展;2010年04期

3 聶佳瑩;楊致邦;唐磊;黃進;蔣英;;幽門螺桿菌感應(yīng)蛋白CrdS的原核表達及生物信息學(xué)分析[J];中國生物制品學(xué)雜志;2013年09期

4 郭松;劉曉光;;普城沙雷氏菌rpoS基因的生物信息學(xué)分析[J];江蘇大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版);2013年06期

5 陳陽,李健峰,姬秋彥,閆玲梅,龍海亭,徐維明;幽門螺桿菌oipA基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[J];世界華人消化雜志;2005年07期

6 白向陽;嚴玲玲;朱濤;盧運萍;周劍鋒;馬丁;;淋巴組織中新基因C14ORF44的生物信息學(xué)分析[J];基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床;2007年10期

7 李良仁,王繼德,白楊,王群英;幽門螺桿菌OMP25基因的克隆、測序及生物信息學(xué)分析[J];廣東醫(yī)學(xué);2005年06期

8 胡平;羅軍;張文炳;龍北國;;幽門螺桿菌基因hp0231和hp0410的克隆表達及生物信息學(xué)分析[J];熱帶醫(yī)學(xué)雜志;2007年04期

9 沈旭,薛建華,余長纓,羅海彬,秦磊,俞曉晶,陳靜,陳莉莉,熊斌,岳莉多,蔡建華,沈建華,羅小民,陳凱先,石鐵流,李亦學(xué),胡庚熙,蔣華良;SARS病毒小信封蛋白E:克隆、表達、純化、CD測定和生物信息學(xué)分析(英文)[J];Acta Pharmacologica Sinica;2003年06期

10 ;[J];;年期

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本文編號：1181969