SARS-CoV、SARSL-CoV與其他冠狀病毒的種系發(fā)生分析
發(fā)布時(shí)間:2017-11-07 02:15
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【摘要】:目的分析不同流行時(shí)段重癥急性呼吸綜合征冠狀病毒(severe acute respiratory syndromes coronavirus,SARS-CoV)病毒株與重癥急性呼吸綜合征樣冠狀病毒(severe acute respiratory syndromes like coronavirus,SARSLCoV)及其他冠狀病毒的分子進(jìn)化關(guān)系。方法從美國國立生物技術(shù)信息中心獲取不同分離時(shí)段的SARS-CoV(9條)、所有SARSL-CoV(24條)、其他冠狀病毒(26條)的全基因組序列,用Clustal X 2.1軟件進(jìn)行多重序列比對,用鄰接法(neighbor-joining,NJ)MEGA 6.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果在包含SARS-CoV、SARSL-CoV和其他冠狀病毒基因組序列的不同數(shù)據(jù)集中,流行早、中期SARS-CoV與流行末期毒株的基因組序列均分別屬于不同的分支;以流行早、中期SARS-CoV為根的有根樹顯示,流行末期SARS-CoV遺傳距離最遠(yuǎn),而與SARSL-CoV和其他冠狀病毒遺傳距離更接近。結(jié)論流行末期SARS-CoV與流行早、中期SARS-CoV遺傳差異大,且可能存在逆向/返祖進(jìn)化。
【作者單位】: 鄭州大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院環(huán)境衛(wèi)生學(xué)教研室;廣東省疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所;第四軍醫(yī)大學(xué)預(yù)防系流行病學(xué)教研室;新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院河南省分子診斷與醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81373059)
【分類號】:R373
【正文快照】: 2003年4月,世界衛(wèi)生組織宣布重癥急性呼吸綜合征(severe acute respiratory syndromes,SARS)的病因?yàn)橐环N新型冠狀病毒,即重癥急性呼吸綜合征冠狀病毒(severe acute respiratory syndromes corona-virus,SARS-Co V)。此后人們對SARS-Co V的起源與進(jìn)化進(jìn)行了探索,但自2003-2004,
本文編號:1150400
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