本文關(guān)鍵詞：腸道病毒71型湖州分離株的遺傳進(jìn)化和重組分析

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【摘要】：目的對(duì)湖州市腸道病毒71型(EV71)進(jìn)行基因特征及重組特點(diǎn)分析。方法對(duì)2011-2012年湖州市EV71分離株進(jìn)行全基因組測(cè)序,并與其基因型及A組腸道病毒其他血清型的原型株進(jìn)行全序列比對(duì),使用Mega 4.0軟件繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹。然后利用Simplot 3.5.1軟件進(jìn)行相似性分析,對(duì)基因重組加以驗(yàn)證。結(jié)果 P1區(qū)系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,2011-2012年湖州市EV71株屬于C4基因型的C4a亞型。P1、P2、P3區(qū)的系統(tǒng)進(jìn)化和相似性分析證實(shí)湖州市分離株在非結(jié)構(gòu)蛋白2B編碼區(qū)存在EV71 C基因型和Cox A16、14、4型間重組。結(jié)論 2011-2012年湖州市EV71分離株為C4a亞型,與2004年以來中國(guó)大陸優(yōu)勢(shì)株流行趨勢(shì)一致。EV71 C4基因型湖州市株存在型間重組現(xiàn)象。
【作者單位】： 湖州市疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】： 腸道病毒型 系統(tǒng)進(jìn)化分析 重組
【分類號(hào)】：R373
【正文快照】： 作者單位:湖州市疾病預(yù)防控制中心,浙江湖州313000Corresponding author:WU Xiao-fang,Email:xf980718@126.com腸道病毒71型(enterovirus 71,EV71)屬于小RNA病毒科(picornaviridae)、腸道病毒屬(enterovirus),是引起兒童手足口病最常見的病原體之一。病毒基因組僅有一個(gè)開放閱

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本文編號(hào)：1099305